bioperl-run-git/PKGBUILD

   1 # Maintainer: Thomas Dziedzic < gostrc at gmail >
   2
   3 pkgname=bioperl-run-git
   4 pkgver=20100604
   5 pkgrel=1
   6 pkgdesc='Wrapper modules around many common bioinformatics applications and tools.'
   7 arch=('any')
   8 license=('GPL' 'PerlArtistic')
   9 url='http://www.bioperl.org/wiki/Run_package'
  10 depends=('perl' 'perl-io-string' 'bioperl-live-git')
  11 makedepends=('perl-data-stag' 'git')
  12 options=(!emptydirs)
  13
  14 _gitroot='git://github.com/bioperl/bioperl-run.git'
  15 _gitname='bioperl-run'
  16
  17 build() {
  18   msg 'Getting sources...'
  19   if [ -d $_gitname ]; then
  20     cd $_gitname
  21     git pull origin
  22   else
  23     git clone $_gitroot
  24     cd $_gitname
  25   fi
  26   msg 'GIT checkout done or server timeout'
  27   msg 'Starting make...'
  28
  29   # non-interactive, uses defaults
  30   perl Build.PL < /dev/null
  31
  32   ./Build
  33
  34   ./Build install                                   \
  35     --install_base /usr                             \
  36     --install_path lib=/usr/share/perl5/vendor_perl \
  37     --install_path bindoc=/usr/share/man/man1       \
  38     --install_path libdoc=/usr/share/man/man3       \
  39     --destdir "$pkgdir"
  40
  41   # remove perllocal.pod and .packlist
  42   find "$pkgdir" -name 'perllocal.pod' -delete
  43   find "$pkgdir" -name '.packlist' -delete
  44 }