updated on Thu Jan 26 16:09:46 UTC 2012
[aur-mirror.git] / readseq / arch-readseq.readme
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1 The readseq jar file is located at /usr/share/java/readseq/readseq.jar
3 Normally readseq is used by typing a command such as:
4 java -cp /usr/share/java/readseq/readseq.jar run myfile -f 12 -o outfile
6 For the arch installation, a script has been placed at /usr/bin/readseq that passes command line args to the readseq jar file.
7 So, to run the java command given above, you just need to type:
8 readseq run myfile -f 12 -o outfile
10 If you run /usr/bin/readseq without command line arguments, readseq will open as a gui application.