mafft/PKGBUILD

   1 # Maintainer: boenki <boenki at gmx dot de>
   2 # Contributor: Mick Elliot <micke at sfu dot ca>
   3
   4 pkgname=mafft
   5 pkgver=6.864
   6 pkgrel=1
   7 pkgdesc="Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences"
   8 arch=('i686' 'x86_64')
   9 url="http://mafft.cbrc.jp/alignment/software"
  10 license=('custom')
  11 depends=('ruby')
  12 source=($url/$pkgname-$pkgver-with-extensions-src.tgz)
  13 md5sums=('3255f8ff21ae02b56148e69109d8f20b')
  14
  15 build() {
  16   cd $srcdir/$pkgname-$pkgver-with-extensions/core
  17   make -e PREFIX=/usr LIBDIR=/usr/lib/mafft
  18
  19   cd ../extensions
  20   make -e PREFIX=/usr LIBDIR=/usr/lib/mafft
  21 }
  22
  23 package() {
  24   cd $srcdir/$pkgname-$pkgver-with-extensions/core
  25   make PREFIX=$pkgdir/usr LIBDIR=$pkgdir/usr/lib/mafft install
  26
  27   cd ../extensions
  28   make PREFIX=$pkgdir/usr LIBDIR=$pkgdir/usr/lib/mafft install
  29
  30   cd ..
  31   install -Dm644 license $pkgdir/usr/share/licenses/mafft/license
  32   install -Dm644 license.extensions $pkgdir/usr/share/licenses/mafft/license.extensions
  33
  34   rm $pkgdir/usr/lib/mafft/*.1
  35
  36   ln -sf /usr/lib/mafft/mafft-profile $pkgdir/usr/bin
  37   ln -sf /usr/lib/mafft/mafft-distance $pkgdir/usr/bin
  38 }