INSTALL

   1 bioperl-network Installation
   2
   3 1. Requirements
   4 2. Installing bioperl-network (Unix or Cygwin)
   5
   6 1. Requirements
   7
   8 Perl 5.6.1 is required, but 5.8 or greater is recommended.
   9
  10 The bioperl-network package depends on the core BioPerl package. See
  11 the BioPerl INSTALL file for instructions for downloading and installing
  12 BioPerl. You should install at least the corresponding version of Bioperl:
  13 since this is bioperl-network 1.6, bioperl 1.6 or greater is recommended.
  14
  15 bioperl-network also depends on Perl's Graph package. See CPAN at
  16 www.perl.org for instructions on downloading and installing Graph,
  17 use Graph version .86 or greater.
  18
  19 Reading PSI XML files using bioperl-network requires the XML::Twig
  20 module. See CPAN at www.perl.org for instructions on downloading
  21 and installing XML::Twig.
  22
  23 2. Installing bioperl-network (Unix, Mac OS X and Cygwin)
  24
  25 Using CPAN:
  26
  27     cpan>install C/CJ/CJFIELDS/BioPerl-network-1.6.0.tar.gz
  28
  29 Manual installation:
  30
  31     >gunzip bioperl-network-<release-version>.tar.gz
  32     >tar xvf bioperl-network-<release-version>.tar
  33     >cd bioperl-network
  34
  35 where <release-version> is the current release.
  36
  37     >perl Build.PL
  38
  39 You can run regression tests and install bioperl-network using the
  40 following commands:
  41
  42     >./Build test
  43     >./Build install
  44
  45 You may have to have root privileges in order to run './Build install'
  46 successfully on Unix. See the BioPerl INSTALL file for alternative approaches
  47 if you don't have root or administrative privileges.