A test to ensure Bio::PrimarySeqI->trunc() doesn't use clone() for a Bio::Seq::RichSe...
[bioperl-live.git] / t / data / test1.blasttab3
blob9366df3ed0e18ec3c3f7d05bcee821f205cb3056
1 # BLASTP 2.0MP-WashU [04-May-2006] [linux26-i686-ILP32F64 2006-05-09T11:47:08]
2 # Start: 3:11:00 PM CEST May 21, 2008
3 # Parameters:
4 #   topcomboN=5
5 #   links
6 #   E=0.0001
7 #   mformat=3
8 #   V=5
9 #   B=5
10 # Database: test_orfs.fa
11 #   Title: test_orfs.fa
12 #   Posted: 11:50:04 AM CEST May 14, 2008
13 #   Created: 11:50:04 AM CEST May 14, 2008
14 #   Letters: 9460
15 #   Records: 307
16 # Query: 000086_1606_1131
17 # Fields: qid   sid     E       N       Sprime  S       alignlen        nident  npos    nmism   pcident pcpos   qgaps   qgaplen sgaps   sgaplen qframe  qstart  qend    sframe  sstart  send    group   links
18 000086_1606_1131        000086_1606_1131        1.7e-11 1       50.12   128     21      21      21      0       100.00  100.00  0       0       0       0       +0      1       21      +0      1       21      1       (1)
19 000086_1606_1131        000269_0423_3271        5.4e-06 1       31.81   76      22      17      18      1       77.27   81.82   2       2       2       2       +0      1       20      +0      2       21      1       (1)
20 000086_1606_1131        000780_0082_2331        6.9e-06 1       31.46   75      23      17      19      2       73.91   82.61   3       3       1       1       +0      1       20      +0      2       23      1       (1)
21 # EXIT: [000086_1606_1131]: 0