t/data/rel9.swiss

   1 ID   GCDH_CAEEL              Reviewed;         409 AA.
   2 AC   Q20772;
   3 DT   01-NOV-1997, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.
   4 DT   01-NOV-1996, sequence version 1.
   5 DT   31-OCT-2006, entry version 47.
   6 DE   Probable glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial precursor
   7 DE   (EC 1.3.99.7) (GCD).
   8 GN   ORFNames=F54D5.7;
   9 OS   Caenorhabditis elegans.
  10 OC   Eukaryota; Metazoa; Nematoda; Chromadorea; Rhabditida; Rhabditoidea;
  11 OC   Rhabditidae; Peloderinae; Caenorhabditis.
  12 OX   NCBI_TaxID=6239;
  13 RN   [1]
  14 RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
  15 RC   STRAIN=Bristol N2;
  16 RX   MEDLINE=99069613; PubMed=9851916; DOI=10.1126/science.282.5396.2012;
  17 RG   The C. elegans sequencing consortium;
  18 RT   "Genome sequence of the nematode C. elegans: a platform for
  19 RT   investigating biology.";
  20 RL   Science 282:2012-2018(1998).
  21 CC   -!- CATALYTIC ACTIVITY: Glutaryl-CoA + acceptor = crotonoyl-CoA +
  22 CC       CO(2) + reduced acceptor.
  23 CC   -!- COFACTOR: FAD (By similarity).
  24 CC   -!- PATHWAY: Degradative pathway of L-lysine, L-hydroxylysine, and L-
  25 CC       tryptophan metabolism.
  26 CC   -!- INTERACTION:
  27 CC       P39745:mpk-1; NbExp=1; IntAct=EBI-313068, EBI-321013;
  28 CC       Q17446:pmk-1; NbExp=1; IntAct=EBI-313068, EBI-312987;
  29 CC   -!- SUBCELLULAR LOCATION: Mitochondrion; mitochondrial matrix
  30 CC       (Potential).
  31 CC   -!- SIMILARITY: Belongs to the acyl-CoA dehydrogenase family.
  32 CC   -----------------------------------------------------------------------
  33 CC   Copyrighted by the UniProt Consortium, see http://www.uniprot.org/terms
  34 CC   Distributed under the Creative Commons Attribution-NoDerivs License
  35 CC   -----------------------------------------------------------------------
  36 DR   EMBL; Z66513; CAA91333.1; -; Genomic_DNA.
  37 DR   PIR; T22647; T22647.
  38 DR   UniGene; Cel.30446; -.
  39 DR   HSSP; Q06319; 1BUC.
  40 DR   IntAct; Q20772; -.
  41 DR   Ensembl; F54D5.7; Caenorhabditis elegans.
  42 DR   KEGG; cel:F54D5.7; -.
  43 DR   WormBase; WBGene00010052; F54D5.7.
  44 DR   WormPep; F54D5.7; CE03411.
  45 DR   GO; GO:0005515; F:protein binding; IPI:IntAct.
  46 DR   InterPro; IPR006089; Acyl_CoA_DH.
  47 DR   InterPro; IPR006091; Acyl_CoA_DH/ox_M.
  48 DR   InterPro; IPR006090; Acyl_CoA_DH_1.
  49 DR   InterPro; IPR006092; Acyl_CoA_DH_N.
  50 DR   InterPro; IPR009075; AcylCo_DH/ox_C.
  51 DR   InterPro; IPR013786; AcylCoA_DH/ox_N.
  52 DR   InterPro; IPR009100; AcylCoA_DH/ox_NM.
  53 DR   InterPro; IPR013764; AcylCoA_DH_1/2_C.
  54 DR   Pfam; PF00441; Acyl-CoA_dh_1; 1.
  55 DR   Pfam; PF02770; Acyl-CoA_dh_M; 1.
  56 DR   Pfam; PF02771; Acyl-CoA_dh_N; 1.
  57 DR   PROSITE; PS00072; ACYL_COA_DH_1; FALSE_NEG.
  58 DR   PROSITE; PS00073; ACYL_COA_DH_2; 1.
  59 KW   Complete proteome; FAD; Flavoprotein; Hypothetical protein;
  60 KW   Mitochondrion; Oxidoreductase; Transit peptide.
  61 FT   TRANSIT       1      ?       Mitochondrion (Potential).
  62 FT   CHAIN         ?    409       Probable glutaryl-CoA dehydrogenase.
  63 FT                                /FTId=PRO_0000000530.
  64 FT   ACT_SITE    388    388       Proton acceptor (Potential).
  65 SQ   SEQUENCE   409 AA;  44964 MW;  4D06241FB6768069 CRC64;
  66      MLTRGFTSIG KIASRGLSST FYQDAFQLSD QLTEDERSLM LSAREYCQER LLPRVTEAYR
  67      TEKFDPSLIP EMGSMGLLGA PYQGYGCAGT STVGYGLIAR EVERVDSGYR STMSVQTSLV
  68      IGPIYNYGSE DQKQKYIPDL ASGKKIGCFG LTEPNHGSNP GGMETKATWD ETTKTYKLNG
  69      SKTWISNSPV SDVMVVWARS ARHNNKIKGF ILERGMKGLT TPKIEGKLSL RASITGQIAM
  70      DDVPVPEENL LPNAEGLQGP FGCLNNARLG IAWGALGAAE ECFHLARQYT LDRQQFGRPL
  71      AQNQLMQLKM ADMLTEISLG LQGCLRVSRL KDEGKVQSEQ ISIIKRNSCG KALEVARKAR
  72      DMLGGNGIVD EYHIMRHMVN LETVNTYEGT HDVHALILGR AITGLNGFC
  73 //
  74 ID   Q41V66_FERAC            Unreviewed;       607 AA.
  75 AC   Q41V66;
  76 DT   27-SEP-2005, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
  77 DT   27-SEP-2005, sequence version 1.
  78 DT   31-OCT-2006, entry version 6.
  79 DE   Glycoside hydrolase, family 15.
  80 GN   ORFNames=FaciDRAFT_1685;
  81 OS   Ferroplasma acidarmanus Fer1.
  82 OC   Archaea; Euryarchaeota; Thermoplasmata; Thermoplasmatales;
  83 OC   Ferroplasmaceae; Ferroplasma.
  84 OX   NCBI_TaxID=333146;
  85 RN   [1]
  86 RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
  87 RC   STRAIN=Fer1;
  88 RG   US DOE Joint Genome Institute (JGI-PGF);
  89 RA   Copeland A., Lucas S., Lapidus A., Barry K., Detter C., Glavina T.,
  90 RA   Hammon N., Israni S., Pitluck S., Richardson P.;
  91 RT   "Sequencing of the draft genome and assembly of Ferroplasma
  92 RT   acidarmanus fer1.";
  93 RL   Submitted (JUN-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
  94 RN   [2]
  95 RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
  96 RC   STRAIN=Fer1;
  97 RG   US DOE Joint Genome Institute (JGI-ORNL);
  98 RA   Larimer F., Land M.;
  99 RT   "Annotation of the draft genome assembly of Ferroplasma acidarmanus
 100 RT   fer1.";
 101 RL   Submitted (JUN-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
 102 RN   [3]
 103 RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
 104 RC   STRAIN=Fer1;
 105 RG   US DOE Joint Genome Institute (JGI-PGF);
 106 RA   Copeland A., Lucas S., Lapidus A., Barry K., Detter C., Glavina T.,
 107 RA   Hammon N., Israni S., Pitluck S., Richardson P.;
 108 RL   Submitted (JUN-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
 109 CC   -!- CAUTION: The sequence shown here is derived from an
 110 CC       EMBL/GenBank/DDBJ whole genome shotgun (WGS) entry which is
 111 CC       preliminary data.
 112 CC   -----------------------------------------------------------------------
 113 CC   Copyrighted by the UniProt Consortium, see http://www.uniprot.org/terms
 114 CC   Distributed under the Creative Commons Attribution-NoDerivs License
 115 CC   -----------------------------------------------------------------------
 116 DR   EMBL; AABC04000001; EAM94575.1; -; Genomic_DNA.
 117 DR   GO; GO:0004339; F:glucan 1,4-alpha-glucosidase activity; IEA:InterPro.
 118 DR   GO; GO:0016787; F:hydrolase activity; IEA:UniProtKB-KW.
 119 DR   GO; GO:0005976; P:polysaccharide metabolism; IEA:InterPro.
 120 DR   InterPro; IPR008928; 6hp_glycosidase.
 121 DR   InterPro; IPR011613; Glyco_hydro_15_rel.
 122 DR   InterPro; IPR012343; Glyco_trans_sub.
 123 DR   Pfam; PF00723; Glyco_hydro_15; 1.
 124 KW   Hydrolase.
 125 SQ   SEQUENCE   607 AA;  69495 MW;  8AC6297BA16ED500 CRC64;
 126      MGTYRGLYDL HDAYRSDYLK IANHGFIANN RTAALVGIDG TIDWACLPNF NSNPVFDSIL
 127      DARNGGYFKT SPVMESNVNQ YYEESTNILI TEFVNNNQVI LRLTDFLPTS SYSTITFPEI
 128      HRLIEAPYSD VEVSIDIKSH FNFGSGKTNI TRDRNGYIFS CTDDTLGIST NLKLKKGNGN
 129      VYSRIKVEKG SHEWIVVLSG VRQIGNVRQY ESYTRLEETR NYWSAWAGKI NYSGLYYDHV
 130      IRSALTLRGL FYDPTGMMVA APTTSLPEII GGERNWDYRY TWIRDTAYVV EALSLIGLND
 131      VATKFLYDIM SIVQKDKKVK TIYPVNGDSK LEEKKVNLSG YMDSIPVRIG NEASEQLQID
 132      QYGSIVNAVF RFHEAGGLVT TYLWDFLIEI LDTLKDIWKL PDSSIWEFRS EPKHYLYSKL
 133      ISWSAFNRAI KMGRELGYSA PYRTWHKIRE EIKNEIMEKG YNPDVKAFTQ YYGSDQMDAS
 134      VLRMPLTGII SAKDPRFVST LARVEAELKN PCGMFIRYHS DDGLKGHDNA FLLLSFWYVE
 135      DLILSGRIME AKETFENILD HSNHLMLFSE EINFNDCREM LGNFPQAITH LGVIRAAIKL
 136      DEALRGK
 137 //
 138 ID   Q41US7_FERAC            Unreviewed;       270 AA.
 139 AC   Q41US7;
 140 DT   27-SEP-2005, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
 141 DT   27-SEP-2005, sequence version 1.
 142 DT   31-OCT-2006, entry version 6.
 143 DE   Potassium channel protein.
 144 GN   ORFNames=FaciDRAFT_1443;
 145 OS   Ferroplasma acidarmanus Fer1.
 146 OC   Archaea; Euryarchaeota; Thermoplasmata; Thermoplasmatales;
 147 OC   Ferroplasmaceae; Ferroplasma.
 148 OX   NCBI_TaxID=333146;
 149 RN   [1]
 150 RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
 151 RC   STRAIN=Fer1;
 152 RG   US DOE Joint Genome Institute (JGI-PGF);
 153 RA   Copeland A., Lucas S., Lapidus A., Barry K., Detter C., Glavina T.,
 154 RA   Hammon N., Israni S., Pitluck S., Richardson P.;
 155 RT   "Sequencing of the draft genome and assembly of Ferroplasma
 156 RT   acidarmanus fer1.";
 157 RL   Submitted (JUN-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
 158 RN   [2]
 159 RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
 160 RC   STRAIN=Fer1;
 161 RG   US DOE Joint Genome Institute (JGI-ORNL);
 162 RA   Larimer F., Land M.;
 163 RT   "Annotation of the draft genome assembly of Ferroplasma acidarmanus
 164 RT   fer1.";
 165 RL   Submitted (JUN-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
 166 RN   [3]
 167 RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
 168 RC   STRAIN=Fer1;
 169 RG   US DOE Joint Genome Institute (JGI-PGF);
 170 RA   Copeland A., Lucas S., Lapidus A., Barry K., Detter C., Glavina T.,
 171 RA   Hammon N., Israni S., Pitluck S., Richardson P.;
 172 RL   Submitted (JUN-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
 173 CC   -!- CAUTION: The sequence shown here is derived from an
 174 CC       EMBL/GenBank/DDBJ whole genome shotgun (WGS) entry which is
 175 CC       preliminary data.
 176 CC   -----------------------------------------------------------------------
 177 CC   Copyrighted by the UniProt Consortium, see http://www.uniprot.org/terms
 178 CC   Distributed under the Creative Commons Attribution-NoDerivs License
 179 CC   -----------------------------------------------------------------------
 180 DR   EMBL; AABC04000002; EAM94333.1; -; Genomic_DNA.
 181 DR   GO; GO:0005216; F:ion channel activity; IEA:UniProtKB-KW.
 182 DR   GO; GO:0006813; P:potassium ion transport; IEA:InterPro.
 183 DR   InterPro; IPR013099; Ion_trans_2.
 184 DR   InterPro; IPR003148; TrkA_N.
 185 DR   Pfam; PF07885; Ion_trans_2; 1.
 186 DR   Pfam; PF02254; TrkA_N; 1.
 187 DR   PROSITE; PS51201; RCK_N; 1.
 188 KW   Ionic channel.
 189 SQ   SEQUENCE   270 AA;  30497 MW;  528C4EA75C41DF75 CRC64;
 190      MQTITTVGYG DTPVYGLAGR ANGMLIMVIG IGSLGYLMAG LTSMLIDIRL SSKLGERMAA
 191      EKKHIVLCNY NESTKKVLDK IKYDGIDIVI LNENEVKGDN EYTYIKGSFL RENDLIRAGI
 192      KKASSVIIFS RSEDKEQMAM DAESILSAMI IRKLNPEIRI IGEILNPDSR EHASSFMDDI
 193      IIKGDVSSML IYSSIMIPGI PEFINDLLMS NSISEEDIDK KYASNTYREF ISNMEKENRI
 194      VLAFRKQDKI YLRENSDKKI DVDSYIFIKN
 195 //