A test to ensure Bio::PrimarySeqI->trunc() doesn't use clone() for a Bio::Seq::RichSe...
[bioperl-live.git] / t / data / cysprot_vs_gadfly.FASTA
blob114dff5234ff78b485b189835b46d462577e95af
1  FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
2  version 3.3t08 Jan. 17, 2001
3 Please cite:
4  W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
6  cysprot.fa, 2385 aa
7  vs /data_2/jason/blastdb/gadflypep2 library
9 7177762 residues in 14334 sequences
10   Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9846+/-0.000606; mu= 15.4125+/- 0.036
11  mean_var=84.2366+/-16.296, 0's: 5 Z-trim: 12  B-trim: 404 in 1/54
12  Lambda= 0.1397
14 FASTA (3.36 June 2000) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
15  join: 43, opt: 31, gap-pen: -12/ -2, width:  16
16 The best scores are:                                       opt bits E(14315)
17 Cp1|FBgn0013770|pp-CT20780|FBan0006692 GO:[cathep  ( 341) 1073  228 3.1e-59
18 CG11459|FBgn0037396|pp-CT28891|FBan0011459 GO:[ca  ( 336)  771  167 6.4e-41
19 CG4847|FBgn0034229|pp-CT15577|FBan0004847 GO:[end  ( 390)  762  165 2.5e-40
20 26/29kD-proteinase|FBgn0028967|pp-CT25694|FBan000  ( 549)  712  155 3.5e-37
21 CG12163|FBgn0037303|pp-CT8855|FBan0012163 GO:[] m  ( 475)  558  124 6.9e-28
22 CG1075|FBgn0037397|pp-CT1381|FBan0001075 GO:[cath  ( 274)  413   95   3e-19
23 CG6347|FBgn0033874|pp-CT19836|FBan0006347 GO:[cat  ( 235)  311   74 4.1e-13
24 CG6337|FBgn0033873|pp-CT19824|FBan0006337 GO:[end  ( 340)  265   65 3.3e-10
25 CG5367|FBgn0032228|pp-CT17056|FBan0005367 GO:[end  ( 228)  249   62 2.4e-09
26 CG3074|FBgn0034709|pp-CT10308|FBan0003074 GO:[cat  ( 441)  252   62 2.4e-09
27 CG10992|FBgn0030521|pp-CT30795|FBan0010992 GO:[ca  ( 340)  235   59 2.2e-08
28 CG10460|FBgn0034443|pp-CT29364|FBan0010460 GO:[en  (  79)  131   37   0.016
29 Ddx1|FBgn0015075|pp-CT25986|FBan0009054 GO:[helic  ( 727)  107   33     2.2
30 CPTI|FBgn0027842|pp-CT32036|FBan0012891 GO:[carni  ( 780)  105   33       3
31 CG4393|FBgn0039075|pp-CT14338|FBan0004393 GO:[cyt  ( 968)  105   33     3.5
32 CG4392|FBgn0036283|pp-CT14260|FBan0004392 GO:[mit  ( 370)  100   32     3.6
33 CG14034|FBgn0031691|pp-CT33593|FBan0014034 GO:[ph  ( 223)   93   30     6.8
34 CG6357|FBgn0033875|pp-CT19866|FBan0006357 GO:[end  ( 439)   96   31     7.2
35 CG11288|FBgn0039895|pp-CT31491|FBan0011288 GO:[ce  ( 202)   91   30     8.4
36 CG13155|FBgn0033723|pp-CT32396|FBan0013155 GO:[]   ( 236)   91   30     9.3
37 CG4810|FBgn0037994|pp-CT15451|FBan0004810 GO:[tra  ( 551)   95   31     9.6
40 >>Cp1|FBgn0013770|pp-CT20780|FBan0006692 GO:[cathepsin L  (341 aa)
41  initn: 829 init1: 615 opt: 1073  Z-score: 1170.6  bits: 227.8 E(): 3.1e-59
42 Smith-Waterman score: 1219;  53.043% identity (56.135% ungapped) in 345 aa overlap (1373-1706:5-341)
44            1350      1360      1370      1380      1390      1400  
45 PAPA_C SNWGNNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPQVMNPTLILAAFCLGIASATLTFDHSLEAQW
46                                      :. : : :    :..:.: ..:   .  .:
47 Cp1|FB                           MRTAVLLPLLAL----LAVAQA-VSFADVVMEEW
48                                          10             20         
50            1410       1420      1430      1440      1450      1460 
51 PAPA_C TKWKAMHNRLY-GMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQEYREGKHSFTMAMNAFGDMTSEEF
52          .:  : . :   .:: .:  ....: . :  :::.. ::: :: .:.: ..:.  .::
53 Cp1|FB HTFKLEHRKNYQDETEERFRLKIFNENKHKIAKHNQRFAEGKVSFKLAVNKYADLLHHEF
54       30        40        50        60        70        80         
56                1470            1480      1490      1500      1510  
57 PAPA_C RQVMNGFQ---NRKPR------KGKVFQEPLFYEAPRSVDWREKGYVTPVKNQGQCGSCW
58        ::.::::.   ... :      :: .:  :     :.::::: :: :: ::.::.:::::
59 Cp1|FB RQLMNGFNYTLHKQLRAADESFKGVTFISPAHVTLPKSVDWRTKGAVTAVKDQGHCGSCW
60       90       100       110       120       130       140         
62            1520      1530      1540      1550      1560      1570  
63 PAPA_C AFSATGALEGQMFRKTGRLISLSEQNLVDCSGPQGNEGCNGGLMDYAFQYVQDNGGLDSE
64        :::.::::::: :::.: :.:::::::::::   ::.:::::::: ::.:..::::.:.:
65 Cp1|FB AFSSTGALEGQHFRKSGVLVSLSEQNLVDCSTKYGNNGCNGGLMDNAFRYIKDNGGIDTE
66      150       160       170       180       190       200         
68            1580      1590      1600       1610      1620      1630 
69 PAPA_C ESYPYEATEESCKYNPKYSVANDTGFVDIPK-QEKALMKAVATVGPISVAIDAGHESFLF
70        .:::::: ..::..:     :.: ::.:::. .:: . .:::::::.::::::.:::: :
71 Cp1|FB KSYPYEAIDDSCHFNKGTVGATDRGFTDIPQGDEKKMAEAVATVGPVSVAIDASHESFQF
72      210       220       230       240       250       260         
74             1640      1650      1660      1670      1680      1690 
75 PAPA_C YKEGIYFEPDCSSEDMDHGVLVVGYGFESTESDNNKYWLVKNSWGEEWGMGGYVKMAKDR
76        :.::.: ::.:.....::::::::.: . .  :   :::::::::  ::  :..:: ...
77 Cp1|FB YSEGVYNEPQCDAQNLDHGVLVVGFGTDESGED---YWLVKNSWGTTWGDKGFIKMLRNK
78      270       280       290       300          310       320      
80             1700      1710      1720      1730      1740      1750 
81 PAPA_C RNHCGIASAASYPTVMTPLLLLAVLCLGTALATPKFDQTFNAQWHQWKSTHRRLYGTNEE
82        .:.::::::.::: :                                             
83 Cp1|FB ENQCGIASASSYPLV                                             
84         330       340                                              
86 >>CG11459|FBgn0037396|pp-CT28891|FBan0011459 GO:[catheps  (336 aa)
87  initn: 350 init1: 191 opt: 771  Z-score: 841.7  bits: 166.9 E(): 6.4e-41
88 Smith-Waterman score: 771;  37.143% identity (38.870% ungapped) in 315 aa overlap (1399-1705:27-335)
90      1370      1380      1390      1400      1410      1420        
91 PAPA_C PIPQVMNPTLILAAFCLGIASATLTFDHSLEAQWTKWKAMHNRLYGMNEEGWRRAVWEKN
92                                      ...: ..:: .:. :  :.. ..::..:. 
93 CG1145     MGTPRLTVVHGLILLLLVELGLTAVSDTEWDQYKAKYNKQY-RNRDKYHRALYEQR
94                    10        20        30        40         50     
96      1430      1440      1450      1460      1470      1480        
97 PAPA_C MKMIELHNQEYREGKHSFTMAMNAFGDMTSEEFRQVMNGFQNRKPRKGKVFQEPLFY---
98        .  .: ::: : .:: .: :..: :.:  .. . .  ...      . ... : . :   
99 CG1145 VLAVESHNQLYLQGKVAFKMGLNKFSDTDQRILFNYRSSIPAPLETSTNALTETVNYKRY
100           60        70        80        90       100       110     
102          1490      1500       1510      1520      1530      1540   
103 PAPA_C -EAPRSVDWREKGYVTPVKNQG-QCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGRLISLSEQNLVDCS
104         .  ...:::. ::..:: .:: .: ::::::..:.::..: .: : :. :: ..:::: 
105 CG1145 DQITEGIDWRQYGYISPVGDQGTECLSCWAFSTSGVLEAHMAKKYGNLVPLSPKHLVDCV
106          120       130       140       150       160       170     
108           1550      1560      1570      1580      1590      1600   
109 PAPA_C GPQGNEGCNGGLMDYAFQYVQDNGGLDSEESYPYEATEESCKYNPKYSVANDTGFVDIPK
110         :  :.::.:: .. ::.:..:.: . ..:::::: .   : ..   :... .:.: . .
111 CG1145 -PYPNNGCSGGWVSVAFNYTRDHG-IATKESYPYEPVSGECLWKSDRSAGTLSGYVTLGN
112           180       190        200       210       220       230   
114            1610      1620      1630      1640        1650      1660
115 PAPA_C -QEKALMKAVATVGPISVAIDAGHESFLFYKEGIYFEPDCSS--EDMDHGVLVVGYGFES
116         .:. : ..: ..::..:.::  :: :  :. :.   : : :  .:. :.::.::.: . 
117 CG1145 YDERELAEVVYNIGPVAVSIDHLHEEFDQYSGGVLSIPACRSKRQDLTHSVLLVGFGTHR
118            240       250       260       270       280       290   
120              1670      1680      1690      1700      1710      1720
121 PAPA_C TESDNNKYWLVKNSWGEEWGMGGYVKMAKDRRNHCGIASAASYPTVMTPLLLLAVLCLGT
122          .:   ::..:::.: .:: .::.:.:..  : ::.::  .:::               
123 CG1145 KWGD---YWIIKNSYGTDWGESGYLKLARNANNMCGVASLPQYPTF              
124               300       310       320       330                    
126              1730      1740      1750      1760      1770      1780
127 PAPA_C ALATPKFDQTFNAQWHQWKSTHRRLYGTNEEEWRRAVWEKNMRMIQLHNGEYSNGKHGFT
129 >>CG4847|FBgn0034229|pp-CT15577|FBan0004847 GO:[endopept  (390 aa)
130  initn: 499 init1: 281 opt: 762  Z-score: 831.0  bits: 165.2 E(): 2.5e-40
131 Smith-Waterman score: 762;  42.857% identity (45.896% ungapped) in 287 aa overlap (1431-1706:112-390)
133              1410      1420      1430      1440      1450      1460
134 PAPA_C QWTKWKAMHNRLYGMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQEYREGKHSFTMAMNAFGDMTSEE
135                                      ..:  :  . .: :.: .:.:::.:.:  :
136 CG4847 FGDFLSQSGKTYLSAADRALHEGAFASTKNLVEAGNAAFAQGVHTFKQAVNAFADLTHSE
137               90       100       110       120       130       140 
139              1470            1480      1490      1500      1510    
140 PAPA_C FRQVMNGFQNRKPRKG------KVFQEPLFYEAPRSVDWREKGYVTPVKNQGQCGSCWAF
141        : . ..:..     :.      :. . :     : . ::::.: ::::: :: :::::::
142 CG4847 FLSQLTGLKRSPEAKARAAASLKLVNLPA-KPIPDAFDWREHGGVTPVKFQGTCGSCWAF
143              150       160       170        180       190       200
145          1520      1530      1540         1550      1560       1570
146 PAPA_C SATGALEGQMFRKTGRLISLSEQNLVDCSGPQ---GNEGCNGGLMDYAFQYVQD-NGGLD
147        ..:::.::. ::::: : .::::::::: ::    : .::.::... :: .... . :..
148 CG4847 ATTGAIEGHTFRKTGSLPNLSEQNLVDC-GPVEDFGLNGCDGGFQEAAFCFIDEVQKGVS
149               210       220        230       240       250         
151              1580      1590      1600       1610      1620         
152 PAPA_C SEESYPYEATEESCKYNPKYSVANDTGFVDIP-KQEKALMKAVATVGPISVAIDAGHESF
153        .: .:::  .. .:::. . : :.  ::. :: :.:. : :.:::.::.. ... : :..
154 CG4847 QEGAYPYIDNKGTCKYDGSKSGATLQGFAAIPPKDEEQLKKVVATLGPVACSVN-GLETL
155      260       270       280       290       300       310         
157     1630      1640      1650      1660      1670      1680         
158 PAPA_C LFYKEGIYFEPDCSSEDMDHGVLVVGYGFESTESDNNKYWLVKNSWGEEWGMGGYVKMAK
159          :  ::: . .:.. . .:..:::::: :. ..    ::.::::: . ::  :: .. .
160 CG4847 KNYAGGIYNDDECNKGEPNHSILVVGYGSEKGQD----YWIVKNSWDDTWGEKGYFRLPR
161       320       330       340       350           360       370    
163     1690      1700      1710      1720      1730      1740         
164 PAPA_C DRRNHCGIASAASYPTVMTPLLLLAVLCLGTALATPKFDQTFNAQWHQWKSTHRRLYGTN
165         . :.: ::   :::.:                                           
166 CG4847 GK-NYCFIAEECSYPVV                                           
167            380       390                                           
169 >>26/29kD-proteinase|FBgn0028967|pp-CT25694|FBan0008947   (549 aa)
170  initn: 428 init1: 244 opt: 712  Z-score: 774.7  bits: 155.2 E(): 3.5e-37
171 Smith-Waterman score: 769;  40.625% identity (43.624% ungapped) in 320 aa overlap (1728-2036:238-546)
173       1700      1710      1720      1730      1740       1750      
174 PAPA_C ASAASYPTVMTPLLLLAVLCLGTALATPKFDQTFNAQWHQWKSTHRRLYGTN-EEEWRRA
175                                      :.  .  .:..:  :   : .. :.: :. 
176 26/29k DDSLQCVGFPGPGTGHYATFNPMQEFISGTDEHVDKAFHHFKRKHGVAYHSDTEHEHRKN
177        210       220       230       240       250       260       
179        1760      1770      1780      1790      1800       1810     
180 PAPA_C VWEKNMRMIQLHNGEYSNGKHGFTMEMNAFGDMTNEEFRQIVNGYRHQK-HKKGRLFQEP
181        ....:.:.:. .:     .:  .:. .: ..: :.::..    ::. .  .. :. :   
182 26/29k IFRQNLRYIHSKN----RAKLTYTLAVNHLADKTEEELKA-RRGYKSSGIYNTGKPFPYD
183        270       280           290       300        310       320  
185            1820      1830      1840      1850      1860       1870 
186 PAPA_C LML---QIPKTVDWREKGCVTPVKNQGQCGSCWAFSASGCLEGQMFLKTG-KLISLSEQN
187        .     .::   :::  : :::::.:. :::::.:.. : ::: .:::.: .:. ::.: 
188 26/29k VPKYKDEIPDQYDWRLYGAVTPVKDQSVCGSCWSFGTIGHLEGAFFLKNGGNLVRLSQQA
189             330       340       350       360       370       380  
191             1880      1890       1900       1910      1920         
192 PAPA_C LVDCSHDQGNQGCNGGLMDF-AFQYIKENGGLDSEESY-PYEAKDGSCKYRAEYAVANDT
193        :.:::   ::.::.::  :: ..:.. ..::. .:: : :: ..:: :.      ::   
194 26/29k LIDCSWAYGNNGCDGG-EDFRVYQWMLQSGGVPTEEEYGPYLGQDGYCHVNNVTLVAPIK
195             390        400       410       420       430       440 
197     1930      1940       1950      1960      1970        1980      
198 PAPA_C GFVDIPQQEKALMK-AVATVGPISVAMDASHPSLQFYSSGIYYEPNCSS--KDLDHGVLV
199        :::.. ...   .: :.   ::.:::.:::  ...::: :.::::.:..    :::.::.
200 26/29k GFVNVTSNDPNAFKLALLKHGPLSVAIDASPKTFSFYSHGVYYEPTCKNDVDGLDHAVLA
201              450       460       470       480       490       500 
203        1990      2000      2010      2020      2030      2040      
204 PAPA_C VGYGYEGTDSNKDKYWLVKNSWGKEWGMDGYIKIAKDRNNHCGLATAASYPIVNMAMIPS
205        ::::    . : . ::::::::.  :: :::: ..  .:: ::. :  .:          
206 26/29k VGYG----SINGEDYWLVKNSWSTYWGNDGYILMSAKKNN-CGVMTMPTYVEM       
207                  510       520       530        540                
209        2050      2060      2070      2080      2090      2100      
210 PAPA_C ISKLLFVAICLFVYMGLSFGDFSIVGYSQNDLTSTERLIQLFESWMLKHNKIYKNIDEKI
212 >>CG12163|FBgn0037303|pp-CT8855|FBan0012163 GO:[] mol_we  (475 aa)
213  initn: 356 init1: 356 opt: 558  Z-score: 607.7  bits: 124.1 E(): 6.9e-28
214 Smith-Waterman score: 847;  41.615% identity (44.816% ungapped) in 322 aa overlap (29-343:169-474)
216                  10        20        30        40         50       
217 PAPA_C   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLG
218                                      : .:: .:...: :  :   :..::..:: 
219 CG1216 VQARHTRSVEWAEKKTHKKHSHRFDKVDHLFYKFQVRFGRRYVSTAERQMRLRIFRQNLK
220       140       150       160       170       180       190        
222         60        70        80        90        100       110      
223 PAPA_C KIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYY-LNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFIN
224         :::::    :. ...:.:...:::..:.:.:.   : ...   .    .:  .   . .
225 CG1216 TIEELN---ANEMGSAKYGITEFADMTSSEYKERTGLWQRDEAKATGGSAA--VVPAYHG
226       200          210       220       230       240         250   
228         120       130       140       150       160       170      
229 PAPA_C SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHE
230         .:  :::: . ::: :::::.:::::.::.:::.:: . .. ..:  .:::.:.:::  
231 CG1216 ELPKEFDWRQKDAVTQVKNQGSCGSCWAFSVTGNIEGLYAVKTGELKEFSEQELLDCD--
232            260       270       280       290       300       310   
234         180       190       200       210       220       230      
235 PAPA_C CMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS
236                . : .:::::. :::. :   ::.. :. ::: :. . ::.:: .   ....
237 CG1216 --------TTDSACNGGLMDNAYKAIKDIGGLEYEAEYPYKAKKN-QCHFNRTLSHVQVA
238                      320       330       340        350       360  
240         240        250       260       270          280       290  
241 PAPA_C NFTMIPK-NETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGV---FDIPCNPNSLDHGILIVG
242        .:. .:: :::.:  .....::..:. .:   ::: :::   .   :. ..::::.:.::
243 CG1216 GFVDLPKGNETAMQEWLLANGPISIGINANAMQFYRGGVSHPWKALCSKKNLDHGVLVVG
244             370       380       390       400       410       420  
246              300       310       320       330       340       350 
247 PAPA_C YSAKN-TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSIIMAHARVLL
248        :....   :.:..::::::::::  ::::::  . :: ::::::........        
249 CG1216 YGVSDYPNFHKTLPYWIVKNSWGPRWGEQGYYRVYRGDNTCGVSEMATSAVLA       
250             430       440       450       460       470            
252              360       370       380       390       400       410 
253 PAPA_C LALAVLATAAVAVASSSSFADSNPIRPVTDRAASTLESAVLGALGRTRHALRFARFAVRY
255 >>CG1075|FBgn0037397|pp-CT1381|FBan0001075 GO:[cathepsin  (274 aa)
256  initn: 233 init1: 148 opt: 413  Z-score: 452.7  bits: 94.7 E(): 3e-19
257 Smith-Waterman score: 413;  36.548% identity (39.130% ungapped) in 197 aa overlap (1522-1715:87-273)
259             1500      1510      1520      1530      1540      1550 
260 PAPA_C DWREKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGRLISLSEQNLVDCSGPQGNEGC
261                                      :.  ::.:   .:: ..::::  :  :.::
262 CG1075 QAVANHNGLYSQGRSGFRMGLNQLYIASASGEEVRKVG---DLSPKHLVDCF-PYPNQGC
263          60        70        80        90          100        110  
265             1560      1570      1580      1590      1600       1610
266 PAPA_C NGGLMDYAFQYVQDNGGLDSEESYPYEATEESCKYNPKYSVANDTGFVDIPKQ-EKALMK
267        :.: .. ::.. .: : . :.:::::.  .  :... . :...   .: . .. :. : :
268 CG1075 NAGWVSVAFNFKRDYG-IASKESYPYKPENGECRWDRRKSTGTLREYVTLTSNDERELAK
269             120        130       140       150       160       170 
271              1620      1630      1640        1650      1660        
272 PAPA_C AVATVGPISVAIDAGHESFLFYKEGIYFEPDC--SSEDMDHGVLVVGYGFESTESDNNKY
273        .:  .::. :.::  :: :  :  ::   :.:  .. :. :.::.::.  .   .:   :
274 CG1075 VVYKIGPVEVSIDHLHEEFDQYFGGILRTPSCRNTNYDLKHSVLLVGFETHPKWGD---Y
275              180       190       200       210       220           
277      1670      1680      1690      1700      1710      1720        
278 PAPA_C WLVKNSWGEEWGMGGYVKMAKDRRNHCGIASAASYPTVMTPLLLLAVLCLGTALATPKFD
279        :..:::.: ::: .:: :.:.. ..:  . : .:   .. : :  :.             
280 CG1075 WIIKNSYGTEWGESGYFKLARNCEQH--VISMTSIAKLVLPCLTEALN            
281       230       240       250         260       270                
283      1730      1740      1750      1760      1770      1780        
284 PAPA_C QTFNAQWHQWKSTHRRLYGTNEEEWRRAVWEKNMRMIQLHNGEYSNGKHGFTMEMNAFGD
286 >>CG6347|FBgn0033874|pp-CT19836|FBan0006347 GO:[cathepsi  (235 aa)
287  initn: 273 init1: 273 opt: 311  Z-score: 342.4  bits: 74.0 E(): 4.1e-13
288 Smith-Waterman score: 436;  37.000% identity (39.785% ungapped) in 200 aa overlap (1710-1899:15-210)
290     1680      1690      1700      1710      1720        1730       
291 PAPA_C GMGGYVKMAKDRRNHCGIASAASYPTVMTPLLLLAVLCLGTALATPKF-D-QTFNAQWHQ
292                                      : ::... :    . ::. : :.:.   .:
293 CG6347                 MRMCSTMWLQMTLGLALLGAVSLQQLQSFPKLCDVQNFDDFLRQ
294                                10        20        30        40    
296       1740      1750      1760      1770      1780      1790       
297 PAPA_C WKSTHRRLYGTNEEEWRRAVWEKNMRMIQLHNGEYSNGKHGFTMEMNAFGDMTNEEFRQI
298              ..:. .:. .:....  .: .: : : . .::  :: . .:...::: .:.  .
299 CG6347 TG----KVYSDEERVYRESIFAAKMSLITLSNKNADNGVSGFRLGVNTLADMTRKEIATL
300                50        60        70        80        90       100
302             1800       1810      1820      1830       1840         
303 PAPA_C VN------GYRHQK-HKKGRLFQEPLMLQIPKTVDWREKGCVTPVKNQG-QCGSCWAFSA
304        ..      : :. . : .    ..:   ..:.  :::::: :::   ::  ::.::.:..
305 CG6347 LGSKISEFGERYTNGHINFVTARNPASANLPEMFDWREKGGVTPPGFQGVGCGACWSFAT
306               110       120       130       140       150       160
308     1850      1860      1870      1880      1890      1900         
309 PAPA_C SGCLEGQMFLKTGKLISLSEQNLVDCSHDQGNQGCNGGLMDFAFQYIKENGGLDSEESYP
310        .: :::..: .:: : :::.::::::. : ::.::.::.....:.::...          
311 CG6347 TGALEGHLFRRTGVLASLSQQNLVDCADDYGNMGCDGGFQEYGFEYIRDHERNRRTSTAR
312               170       180       190       200       210       220
314     1910      1920      1930      1940      1950      1960         
315 PAPA_C YEAKDGSCKYRAEYAVANDTGFVDIPQQEKALMKAVATVGPISVAMDASHPSLQFYSSGI
316                                                                    
317 CG6347 ESGENSRLCHHYSRG                                             
318               230                                                  
320 >>CG6337|FBgn0033873|pp-CT19824|FBan0006337 GO:[endopept  (340 aa)
321  initn: 191 init1: 112 opt: 265  Z-score: 290.3  bits: 64.9 E(): 3.3e-10
322 Smith-Waterman score: 346;  28.707% identity (31.488% ungapped) in 317 aa overlap (1073-1369:28-336)
324            1050      1060      1070      1080         1090         
325 PAPA_C TALPLLCAGAWLLSAGATAELTVNAIEKFHFTSWMKQHQKTYSS---REYSHRLQVFANN
326                                      : ..  . .:::.:   :....   ..  :
327 CG6337    MFKLLLCCLLLTIDSGWAFNHGQDLVDFQTYEDNFNKTYASTSARNFANYYFIYNRN
328                   10        20        30        40        50       
330     1100         1110       1120      1130      1140      1150     
331 PAPA_C WRKIQAHN---QRNHT-FKMGLNQFSDMSFAEIKHKYLWSEPQNCSATKSNYLRGTGPYP
332          ..  ::   .::.: .. ..:::::. .  :.   :  .  :  .. ..   ..    
333 CG6337 --QVAQHNAQADRNRTTYREAVNQFSDIRL--IQFAALLPKAVNTVTSAASDPPASQAAS
334           60        70        80          90       100       110   
336         1160      1170       1180        1190      1200      1210  
337 PAPA_C SSMDWRKKGNVVSPVKNQGA-CGSCWTFSTTGALE--SAVAIASGKMMTLAEQQLVDCAQ
338        .:.:     ...  :..::. :.: :...:. :.:  .::  :.    .:. :::.::: 
339 CG6337 ASFDIITDFGLTVAVEDQGVNCSSSWAYATAKAVEIMNAVQTANPLPSSLSAQQLLDCAG
340            120       130       140       150       160       170   
342            1220      1230        1240         1250      1260       
343 PAPA_C NFNNHGCQGGLPSQAFEYI--LYNKGIMGEDSYPY---IGKNGQCKFNPEKAVAFVK--N
344           . ::.   :  :..:.  : .  .. : .::    .   :.:.  : .. . ::  .
345 CG6337 M--GTGCSTQTPLAALNYLTQLTDAYLYPEVDYPNNNSLKTPGMCQ-PPSSVSVGVKLAG
346              180       190       200       210        220       230
348         1270      1280      1290       1300      1310      1320    
349 PAPA_C VVNITLNDEAAMVEAVALYNPVSFAFE-VTEDFMMYKSGVYSSNSCHKTPDKVNHAVLAV
350          ... ::.::... :.   ::   .. .:  ::.:.:::: ...   :  : .. ...:
351 CG6337 YSTVADNDDAAVMRYVSNGFPVIVEYNPATFGFMQYSSGVYVQETRALTNPKSSQFLVVV
352               240       250       260       270       280       290
354            1330      1340      1350      1360      1370      1380  
355 PAPA_C GYGEQ--NGLLYWIVKNSWGSNWGNNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPQVMNPTLILAA
356        :: ..  ..: ::   ::.:..::..::. : : .:.  .:  : .:             
357 CG6337 GYDHDVDSNLDYWRCLNSFGDTWGEEGYIRIVRRSNQ-PIAKNAVFPSALA         
358               300       310       320        330       340         
360            1390      1400      1410      1420      1430      1440  
361 PAPA_C FCLGIASATLTFDHSLEAQWTKWKAMHNRLYGMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQEYREG
363 >>CG5367|FBgn0032228|pp-CT17056|FBan0005367 GO:[endopept  (228 aa)
364  initn: 309 init1: 173 opt: 249  Z-score: 275.0  bits: 61.5 E(): 2.4e-09
365 Smith-Waterman score: 493;  30.556% identity (40.741% ungapped) in 288 aa overlap (1425-1706:7-228)
367          1400      1410      1420      1430      1440      1450    
368 PAPA_C DHSLEAQWTKWKAMHNRLYGMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQEYREGKHSFTMAMNAFG
369                                      .:.:.:.:: :::.:.::. :: .  : :.
370 CG5367                         MRSYKAFEENFKVIEEHNQNYKEGQTSFRLKPNIFA
371                                        10        20        30      
373          1460           1470      1480      1490      1500         
374 PAPA_C DMTSEEF-----RQVMNGFQNRKPRKGKVFQEPLFYEAPRSVDWREKGYVTPVKNQGQCG
375        ::... .     : . .....     ...   ::. ..:.:.::: ::..::  :: .::
376 CG5367 DMSTDGYLKGFLRLLKSNIEDSADNMAEIVGSPLMANVPESLDWRSKGFITPPYNQLSCG
377          40        50        60        70        80        90      
379     1510      1520      1530      1540      1550      1560         
380 PAPA_C SCWAFSATGALEGQMFRKTGRLISLSEQNLVDCSGPQGNEGCNGGLMDYAFQYVQDNGGL
381        ::.::: . .. ::     :.                                       
382 CG5367 SCYAFSIAESIMGQ----KGK---------------------------------------
383         100       110                                              
385     1570      1580      1590      1600       1610      1620        
386 PAPA_C DSEESYPYEATEESCKYNPKYSVANDTGFVDIP-KQEKALMKAVATVGPISVAIDAGHES
387                      :.. :  ::.: :... .: ..:.:.. ::. .::....:.:. ..
388 CG5367 --------------CQFVPDLSVVNVTSWAILPVRDEQAIQAAVTHIGPVAISINASPKT
389                          120       130       140       150         
391      1630      1640      1650      1660      1670      1680        
392 PAPA_C FLFYKEGIYFEPDCSSEDMDHGVLVVGYGFESTESDNNKYWLVKNSWGEEWGMGGYVKMA
393        : .:..::: .: ::: ...:...:.:.:        . ::..:: ::..:: .::... 
394 CG5367 FQLYSDGIYDDPLCSSASVNHAMVVIGFG--------KDYWILKNWWGQNWGENGYIRIR
395      160       170       180               190       200       210 
397      1690      1700      1710      1720      1730      1740        
398 PAPA_C KDRRNHCGIASAASYPTVMTPLLLLAVLCLGTALATPKFDQTFNAQWHQWKSTHRRLYGT
399        :   : ::::. :.:  :                                          
400 CG5367 KGV-NMCGIANYAAYAIV                                          
401               220                                                  
403 >>CG3074|FBgn0034709|pp-CT10308|FBan0003074 GO:[cathepsi  (441 aa)
404  initn: 288 init1: 124 opt: 252  Z-score: 274.7  bits: 62.4 E(): 2.4e-09
405 Smith-Waterman score: 411;  35.124% identity (39.352% ungapped) in 242 aa overlap (1151-1369:184-422)
407              1130      1140      1150       1160      1170         
408 PAPA_C SDMSFAEIKHKYLWSEPQNCSATKSNYLRGTGPYPSSMD-WRKKGNVVSPVKNQGACGSC
409                                      :   :::..   : .. .: : .:: ::. 
410 CG3074 GRKYSEGLKLRLGTKEPTYRVKAMTRLKNPTDGLPSSFNALDKWSSYISEVPDQGWCGAS
411            160       170       180       190       200       210   
413     1180      1190        1200      1210      1220      1230       
414 PAPA_C WTFSTTGALESAVAIAS-GKM-MTLAEQQLVDCAQNFNNHGCQGGLPSQAFEYILYNKGI
415        :..:::..  .  :: : ::  . :. :....:..   ..::.::  . :..: :..::.
416 CG3074 WVLSTTSVASDRFAIQSKGKENVQLSAQNILSCTRR--QQGCEGGHLDAAWRY-LHKKGV
417            220       230       240         250       260        270
419       1240      1250        1260                   1270      1280  
420 PAPA_C MGEDSYPYIGKNGQCKF--NPEKAVAF-VKNVVNI------------TLNDEAAMVEAVA
421        . :. :::  .   ::.  : ..  :   .. ::.            .:: :: ..  . 
422 CG3074 VDENCYPYTQHRDTCKIRHNSRSLRANGCQKPVNVDRDSLYTVGPAYSLNREADIMAEIF
423               280       290       300       310       320       330
425            1290      1300      1310      1320       1330           
426 PAPA_C LYNPVSFAFEVTEDFMMYKSGVYSSNSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEQ-NGLLYW--IVKN
427          .::. ...:..::. :..:::  .. ..      :.:  ::.::. ::  ::  :. :
428 CG3074 HSGPVQATMRVNRDFFAYSGGVYRETAANRKAPTGFHSVKLVGWGEEHNGEKYWVSIAAN
429               340       350       360       370       380       390
431     1340      1350      1360        1370      1380      1390       
432 PAPA_C SWGSNWGNNGYFLIERGKNMCGLA--ACASYPIPQVMNPTLILAAFCLGIASATLTFDHS
433        :::: ::..::: : ::.: ::.   . ::.:                            
434 CG3074 SWGSWWGEHGYFRILRGSNECGIEEYVLASWPYVYSYYNVKPMEISRLIYF         
435               400       410       420       430       440          
437       1400      1410      1420      1430      1440      1450       
438 PAPA_C LEAQWTKWKAMHNRLYGMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQEYREGKHSFTMAMNAFGDMT
440 >>CG10992|FBgn0030521|pp-CT30795|FBan0010992 GO:[catheps  (340 aa)
441  initn: 193 init1: 146 opt: 235  Z-score: 257.6  bits: 58.9 E(): 2.2e-08
442 Smith-Waterman score: 370;  24.620% identity (29.889% ungapped) in 329 aa overlap (753-1038:25-338)
444             730       740       750       760          770         
445 PAPA_C PVCGAAELSVNSLEKFHFKSWMSKHRKTYSTEEYHHRLQTFASNW---RKINAHNNGNHT
446                                      ..:. . ... :..:   :...:  . .: 
447 CG1099       MNLLLLVATAASVAALTSGEPSLLSDEFIEVVRSKAKTWTVGRNFDASVTEGHI
448                      10        20        30        40        50    
450      780       790       800       810       820       830         
451 PAPA_C FKMALNQFSDMSFAEIKHKYLWSEPQNCSATKSNYLRGTGPYPPSVDWRKKGN---FVSP
452         ..       :.     ::.  . :..  .  . :. ..   :   : ::.      .. 
453 CG1099 RRL-------MGVHPDAHKF--ALPDKREVLGDLYVNSVDELPEEFDSRKQWPNCPTIGE
454                   60          70        80        90       100     
456         840       850       860         870       880       890    
457 PAPA_C VKNQGACGSCWTFSTTGALESAIAIATGKMLSL--AEQQLVDCAQDFNNYGCQGGLPSQA
458        ...::.:::::.:... :. . . : .:  ...  . ..::.: .  . .::.::.:. :
459 CG1099 IRDQGSCGSCWAFGAVEAMSDRVCIHSGGKVNFHFSADDLVSCCHTCG-FGCNGGFPGAA
460          110       120       130       140       150        160    
462           900       910                                920         
463 PAPA_C FEYILYNKGIMGEDTY-------PYQ------------------GKDGYCKF--QPGKAI
464        . :    :::..   :       ::.                  :.   :.   : : ..
465 CG1099 WSYWTR-KGIVSGGPYGSNQGCRPYEISPCEHHVNGTRPPCAHGGRTPKCSHVCQSGYTV
466           170        180       190       200       210       220   
468        930            940       950       960       970       980  
469 PAPA_C GFVKD----VANITIY-DEEAMVEAVALYNPVSFAFEVTQDFMMYRTGIYSSTSCHKTPD
470         ..::      . ..  . . . : .   .::  :: : .:...:. :.:.    :.   
471 CG1099 DYAKDKHFGSKSYSVRRNVREIQEEIMTNGPVEGAFTVYEDLILYKDGVYQ----HEHGK
472            230       240       250       260       270             
474              990        1000      1010      1020      1030         
475 PAPA_C KVN-HAVLAVGYG--EKNGIPYWIVKNSWGPQWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPL
476        ... ::.  .:.:   .. ::::.. :::. .:: .:.: : ::.. ::. .  :  .: 
477 CG1099 ELGGHAIRILGWGVWGEEKIPYWLIGNSWNTDWGDHGFFRILRGQDHCGIESSISAGLPK
478      280       290       300       310       320       330         
480     1040      1050      1060      1070      1080      1090         
481 PAPA_C VMWTALPLLCAGAWLLSAGATAELTVNAIEKFHFTSWMKQHQKTYSSREYSHRLQVFANN
482                                                                    
483 CG1099 L                                                           
484      340                                                           
486 >>CG10460|FBgn0034443|pp-CT29364|FBan0010460 GO:[endopep  (79 aa)
487  initn: 115 init1: 115 opt: 131  Z-score: 152.2  bits: 37.3 E(): 0.016
488 Smith-Waterman score: 141;  29.231% identity (29.231% ungapped) in 65 aa overlap (1399-1463:6-70)
490      1370      1380      1390      1400      1410      1420        
491 PAPA_C PIPQVMNPTLILAAFCLGIASATLTFDHSLEAQWTKWKAMHNRLYGMNEEGWRRAVWEKN
492                                      . .:...:.  .. :  .:.  :: .. ..
493 CG1046                          MSLVSDEEWVEYKSKFDKNYEAEEDLMRRRIYAES
494                                         10        20        30     
496      1430      1440      1450      1460      1470      1480        
497 PAPA_C MKMIELHNQEYREGKHSFTMAMNAFGDMTSEEFRQVMNGFQNRKPRKGKVFQEPLFYEAP
498           :: ::.....:. .. :..: ..:.: ::: :                         
499 CG1046 KARIEEHNRKFEKGEVTWKMGINHLADLTPEEFAQRCGKKVPPN                
500           40        50        60        70                         
502      1490      1500      1510      1520      1530      1540        
503 PAPA_C RSVDWREKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGRLISLSEQNLVDCSGPQGN
505 >>Ddx1|FBgn0015075|pp-CT25986|FBan0009054 GO:[helicase (  (727 aa)
506  initn:  64 init1:  64 opt: 107  Z-score: 114.0  bits: 33.4 E():  2.2
507 Smith-Waterman score: 107;  25.581% identity (29.412% ungapped) in 215 aa overlap (2142-2341:72-273)
509             2120      2130      2140      2150      2160           
510 PAPA_C FKDNLKYIDETNKKNNSYWLGLNVFADMSNDEFKEKYTGSIAGNYTTTELSYEE------
511                                      .: :    :.:.:  :   .:. .      
512 Ddx1|F VLMAAETGSGKTGAFCLPILQIVWETLRDLEEGKAGKGGAIGGAVTPWTMSFFDRGNALA
513               50        60        70        80        90       100 
515         2170       2180      2190      2200      2210      2220    
516 PAPA_C VLNDG-DVNIPEYVDWRQKGAVTPVKNQGSCGSCWAFSAVVTIEGIIKIRTGNLNEYSEQ
517        :  ::   .  :. .:.   :.: :...:.    . : :.:: ::. ..  :  .. .. 
518 Ddx1|F VTPDGLRCQSREFKEWHGCRATTGVRGKGK----FYFEATVTDEGLCRV--GWSTQQANL
519              110       120       130           140         150     
521          2230      2240      2250      2260      2270       2280   
522 PAPA_C ELLDCDRRSYGCNGGYPWSALQLVAQYGIHYRNTYPYEGVQRYCRSREKG-PYAAKTDGV
523        .:  : : ..: .:    :  .   .::  . ..    :     ...: .    ... ::
524 Ddx1|F DLGTC-RMGFGFGGTGKKSNNRQFDDYGEAFGKA-DVIGCLLDLKNQEVSFTKNGQNLGV
525          160        170       180        190       200       210   
527           2290      2300      2310             2320      2330      
528 PAPA_C RQVQPYNEGALLYSIANQPVSVVLEAA------GK-DFQLYRGGIFVGPCGNKVDHAVAA
529            : : .   .  :     :::. :      :: ::.   :. ::: :    .:. : 
530 Ddx1|F AFRLPDNLAKETFYPA-----VVLKNAEMQFNFGKTDFKYAPGNGFVGACQAGPEHSKAN
531            220            230       240       250       260        
533        2340      2350      2360      2370      2380                
534 PAPA_C VGYGPNYILIKNSWGTGWGENGYIRIKRGTGNSYGVCGLYTSSFYPVKN           
535           ::                                                       
536 Ddx1|F PITGPAAGAPSAKPAPNAPQAIIMEPSRELAEQTYNQIEKFKYHLSNPEVRSLLLIGGVR
537       270       280       290       300       310       320        
539 >>CPTI|FBgn0027842|pp-CT32036|FBan0012891 GO:[carnitine   (780 aa)
540  initn:  63 init1:  63 opt: 105  Z-score: 111.4  bits: 33.0 E():    3
541 Smith-Waterman score: 105;  27.551% identity (30.000% ungapped) in 98 aa overlap (904-998:486-578)
543            880       890       900       910          920       930
544 PAPA_C LVDCAQDFNNYGCQGGLPSQAFEYILYNKGIMGEDTYPYQ---GKDGYCKFQPGKAIGFV
545                                      :.:.: : :.   .  :   :::     ..
546 CPTI|F TVCVGTNGRVGFNAEHTWADAPVLGHLWEYIFGDDIYGYDETGNTKGTPAFQPPTPTRLT
547          460       470       480       490       500       510     
549               940       950       960       970       980       990
550 PAPA_C KDVANITIYDEEAMVEAVALYNPVSFAFEVTQDFMMYRTGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLA
551         :.       ::: .... : : :.. . : ::   :  :....  :. .::   . .: 
552 CPTI|F WDLKPCLAQIEEATIDVTKLINEVNLRILVHQD---YGKGFMKK--CRISPDAYIQMALQ
553          520       530       540          550         560       570
555              1000      1010      1020      1030      1040      1050
556 PAPA_C VGYGEKNGIPYWIVKNSWGPQWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPIPLVMWTALPLLCA
557        ..: .  :                                                    
558 CPTI|F LAYYRDAGRFSLTYEASMTRLFREGRTETVRPCTIESSAWVKAMQNPNTTNDERVKMMQA
559               580       590       600       610       620       630
561 >>CG4393|FBgn0039075|pp-CT14338|FBan0004393 GO:[cytoskel  (968 aa)
562  initn:  40 init1:  40 opt: 105  Z-score: 110.3  bits: 33.1 E():  3.5
563 Smith-Waterman score: 105;  23.973% identity (25.547% ungapped) in 146 aa overlap (412-555:373-511)
565              390       400       410       420       430       440 
566 PAPA_C RAASTLESAVLGALGRTRHALRFARFAVRYGKSYESAAEVRRRFRIFSESLEEVRSTNRK
567                                      ::: .:: . . ::    ..   ..: :. 
568 CG4393 NHLLNHSHSMQQSGYSKQRLSAGNGGPYNGGKSLDSALQPEDRFYQDLNAHSPLHSQNEM
569             350       360       370       380       390       400  
571              450       460       470         480       490         
572 PAPA_C GLPYRLGINRFSDMSWEEFQATRLGAAQTCSATLAGN--HLMRDAAALPETKDWREDGIV
573        :  :  ...  :..:   :. . ..  . ::.   :.  :.   : : :  :  :..  :
574 CG4393 GGGY--SVSPSSSLS--SFEPASVSPRSRCSTGGLGQPMHMSTFAPAGPPKKPPRRNLSV
575               410         420       430       440       450        
577      500       510       520       530       540       550         
578 PAPA_C SPVKNQAHCGSCWTFSTTGALEAAYTQATGKNISLSEQQLVDCAGGFNNFGCNGGLPSQA
579        ::.  .:  :. ...:. ..   . ... :.: .. .:   .   . .. :  ::.    
580 CG4393 SPT--HAGPGQQFSYSSPSSQSQSQSHGHGQN-QVRRQPASESPYSHQSHGSVGGMSFDE
581       460         470       480        490       500       510     
583      560       570       580       590       600       610         
584 PAPA_C FEYIKYNGGIDTEESYPYKGVNGVCHYKAENAAVQVLDSVNITLNAEDELKNAVGLVRPV
585                                                                    
586 CG4393 TQLRERQRNDRLYASARQSTRSAIAGGMSLSSSNDMLDRQCSSSELNSETSVPNSSGDSP
587          520       530       540       550       560       570     
589 >>CG4392|FBgn0036283|pp-CT14260|FBan0004392 GO:[mitochon  (370 aa)
590  initn:  55 init1:  55 opt: 100  Z-score: 110.0  bits: 31.7 E():  3.6
591 Smith-Waterman score: 104;  20.426% identity (22.642% ungapped) in 235 aa overlap (2099-2317:15-242)
593      2070      2080      2090      2100      2110      2120        
594 PAPA_C SIVGYSQNDLTSTERLIQLFESWMLKHNKIYKNIDEKIYRFEIFKDNLKYIDETNKKNNS
595                                      :.::..     ....: .  . .   .  .
596 CG4392                 MLRNSTYQYNLPVDYHNIQQMAVAGDMMEDFVVIFRDMMGRYLD
597                                10        20        30        40    
599      2130      2140            2150      2160       2170      2180 
600 PAPA_C YWLGLNVFADMSNDE------FKEKYTGSIAGNYTTTELS-YEEVLNDGDVNIPEYVDWR
601            .::  :... :      ...  .:.:::  . :  .  ...    .:: :.:.   
602 CG4392 IGEDMNVPDDFTQKEMQTGLWWRHLVAGGIAGAVSRTCTAPLDRIKVYLQVNQPRYTVQT
603            50        60        70        80        90       100    
605                 2190      2200      2210      2220      2230       
606 PAPA_C QKGAVTP----VKNQGSCGSCWAFSAVVTIEGIIKIRTGNLNEYSEQELLDCDRRSYGCN
607        :. ...     . :.:.  : :  ...    ...::   .  ...  : .   :   : .
608 CG4392 QRMGISECMHIMLNEGGSRSMWRGNGI----NVLKIAPETAFKFAAYEQMK--RLIRGDD
609           110       120       130           140       150          
611       2240          2250      2260      2270      2280      2290   
612 PAPA_C GGYPWSALQL----VAQYGIHYRNTYPYEGVQRYCRSREKGPYAAKTDGVRQVQPYNEGA
613        :.   : ..     .:  ::     ::.: ..     :. : ::. .:.. ..   .::.
614 CG4392 GSRQMSIVERFYAGAAAGGISQTIIYPMEVLKTRLALRRTGQYAGIADAAVKIYK-QEGV
615       160       170       180       190       200       210        
617           2300       2310      2320      2330      2340      2350  
618 PAPA_C LLYSIANQP-VSVVLEAAGKDFQLYRGGIFVGPCGNKVDHAVAAVGYGPNYILIKNSWGT
619          .  .  : .  .:  :: :. .:.                                  
620 CG4392 RSFYRGYVPNILGILPYAGIDLAVYETLKRRYIANHDNNEQPSFLVLLACGSTSSTLGQL
621        220       230       240       250       260       270       
623 >>CG14034|FBgn0031691|pp-CT33593|FBan0014034 GO:[phospho  (223 aa)
624  initn:  60 init1:  60 opt:  93  Z-score: 105.2  bits: 30.1 E():  6.8
625 Smith-Waterman score: 93;  18.719% identity (21.965% ungapped) in 203 aa overlap (1434-1625:28-211)
627           1410      1420      1430      1440      1450      1460   
628 PAPA_C KWKAMHNRLYGMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQEYREGKHSFTMAMNAFGDMTSEEFRQ
629                                      :...: .:: .  .. .: :  .  . .. 
630 CG1403    MLVAGLDDMNCFSLQNEICPNANISFWLYTKENQEGTKLSVFELNRFEFYHHKPLKV
631                   10        20        30        40        50       
633           1470      1480         1490          1500      1510      
634 PAPA_C VMNGFQNRKPRKGKVFQEPLFYEAPR---SVDW----REKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSA
635        ...::....  . ..  .:::        :.:.     :  :.  :.:    . : :   
636 CG1403 LIHGFNGHRDFSPNTQLRPLFLTQDYNLISLDYPKLAYEPCYTEAVHNAKYVARCTA---
637         60        70        80        90       100       110       
639        1520         1530      1540      1550       1560      1570  
640 PAPA_C TGALEGQMFR---KTGRLISLSEQNLVDCSGPQGNEGCNGGLM-DYAFQYVQDNGGLDSE
641              :..:   ..: :... . .:.  .      :  : .. .. ....    .::  
642 CG1403 ------QLLRVLLESG-LVKIEDLHLIGLGLGAHVAGFIGQFLPEHKLEHIT---ALDPA
643                 120        130       140       150          160    
645            1580      1590      1600      1610      1620      1630  
646 PAPA_C ESYPYEATEESCKYNPKYSVANDTGFVDIPKQEKALMKAVATVGPISVAIDAGHESFLFY
647        . . : . . . : .:     .:. :::. . . ...  . .:: ..  .. :       
648 CG1403 KPF-YMVKDPALKLDP-----TDAKFVDVVHTDVTMLGLLDAVGHVDFYLNMGVSQPNCG
649            170            180       190       200       210        
651            1640      1650      1660      1670      1680      1690  
652 PAPA_C KEGIYFEPDCSSEDMDHGVLVVGYGFESTESDNNKYWLVKNSWGEEWGMGGYVKMAKDRR
653                                                                    
654 CG1403 PINKS                                                       
655       220                                                          
657 >>CG6357|FBgn0033875|pp-CT19866|FBan0006357 GO:[endopept  (439 aa)
658  initn: 174 init1:  92 opt:  96  Z-score: 104.8  bits: 31.0 E():  7.2
659 Smith-Waterman score: 136;  31.852% identity (37.069% ungapped) in 135 aa overlap (344-461:1-133)
661            320       330       340       350          360       370
662 PAPA_C GADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSIIMAHARVLL---LALAVLATAAVAVASSSSF
663                                      :. ::.::   : : ....:  . .:.:: 
664 CG6357                               MTSARILLGVPLLLYLMGVALGVPVSTSSP
665                                              10        20        30
667                 380             390       400         410       420
668 PAPA_C ADS--NPIRPVT------DRAASTLESAVLGALGRTRHALRFA--RFAVRYGKSYESAAE
669        : .  ::   ::      : .. :.: .  ..:.. ..  .::  :: : .   :..  :
670 CG6357 ATQKINPEIGVTTGKSDADSSTPTIEHT--SGLSEFEEECQFAWQRFLVDFDVHYDNDYE
671                40        50          60        70        80        
673               430       440           450       460       470      
674 PAPA_C VRRRFRIFSESLEEVRSTNRK---GL-PYRLGINRFSDMSWEEFQATRLGAAQTCSATLA
675         ..:  :: :. ..::. : :   :.  .. :::..::...::..               
676 CG6357 RQKRRDIFCENWQKVRDHNLKYDLGVVSFKKGINQWSDLTFEEWKEKQTPKVMPEIASES
677        90       100       110       120       130       140        
679         480       490       500       510       520       530      
680 PAPA_C GNHLMRDAAALPETKDWREDGIVSPVKNQAHCGSCWTFSTTGALEAAYTQATGKNISLSE
681                                                                    
682 CG6357 SKEERDKVNCQAAWEKFLIDFGAQYKNANETEKRRNVFCANWRAIVEHNVQYEKWAEPFK
683       150       160       170       180       190       200        
685 >>CG11288|FBgn0039895|pp-CT31491|FBan0011288 GO:[cell ad  (202 aa)
686  initn:  61 init1:  61 opt:  91  Z-score: 103.5  bits: 29.6 E():  8.4
687 Smith-Waterman score: 91;  24.731% identity (25.843% ungapped) in 93 aa overlap (1843-1931:48-140)
689            1820      1830      1840      1850      1860            
690 PAPA_C QEPLMLQIPKTVDWREKGCVTPVKNQGQCGSCWAFSASGCLEGQMFLKT-GKLISLSE--
691                                      .:  .... :  :  . :  .: :...:  
692 CG1128 ENLCAHICENTFDAYQCKCHPGFMLDNNNVTCSPMKTQICPSGYNLDKLDNKCIDIDECR
693         20        30        40        50        60        70       
695     1870      1880      1890      1900      1910      1920         
696 PAPA_C QNLVDCSHDQGNQGCNGGLMDFAFQYIKENGGLDSEESYPYEAKDGSCKYRAEYAVAN-D
697        ..: ::. .:  .. :::   .  .  .   :.  ...:     : .:: :    . . :
698 CG1128 EDLHDCKSSQYCHNTNGGYHCLNVKEKECPPGFHYDHDYDACKDDYKCKDRKCVKIQSCD
699         80        90       100       110       120       130       
701      1930      1940      1950      1960      1970      1980        
702 PAPA_C TGFVDIPQQEKALMKAVATVGPISVAMDASHPSLQFYSSGIYYEPNCSSKDLDHGVLVVG
703         ::                                                         
704 CG1128 KGFSLHNGTCSDIDECSHKSLNNCHVNSNQECVNTVGSYSCNCLPGFNLDATLNKCVGKY
705        140       150       160       170       180       190       
707 >>CG13155|FBgn0033723|pp-CT32396|FBan0013155 GO:[] mol_w  (236 aa)
708  initn:  67 init1:  67 opt:  91  Z-score: 102.7  bits: 29.7 E():  9.3
709 Smith-Waterman score: 91;  27.397% identity (28.986% ungapped) in 73 aa overlap (165-237:146-214)
711           140       150       160       170       180       190    
712 PAPA_C NQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGL
713                                      :.:..: : :.    :  .:  :.::. . 
714 CG1315 NFNGTGWQIIQFQWVRDGDESHPDTKEYSYLTENKLWDSDQA---YAYQEP-DDGCHINC
715          120       130       140       150          160        170 
717           200       210       220       230       240       250    
718 PAPA_C QPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVS
719        ::..  : ...  .:     :   .  .. :.:: .  .:: .                 
720 CG1315 QPETAVYPLQSEPVQEPVVQPTQEQQQSRTNINSEQDPGKIHDTINEVLEYIQQRILPTL
721              180       190       200       210       220       230 
723           260       270       280       290       300       310    
724 PAPA_C TGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWG
725                                                                    
726 CG1315 PIKGE                                                       
727                                                                    
729 >>CG4810|FBgn0037994|pp-CT15451|FBan0004810 GO:[translat  (551 aa)
730  initn:  60 init1:  60 opt:  95  Z-score: 102.4  bits: 30.9 E():  9.6
731 Smith-Waterman score: 95;  25.000% identity (28.409% ungapped) in 100 aa overlap (2138-2227:368-465)
733       2110      2120      2130      2140         2150      2160    
734 PAPA_C RFEIFKDNLKYIDETNKKNNSYWLGLNVFADMSNDEF---KEKYTGSIAGNYTTTELSYE
735                                      :..::     . :..: : :    ...   
736 CG4810 QEPRFMFEEPNPFEEPGVDLASIGYRYRQWDLGNDVVLIARCKHNGVIQGPNGDVQFLSI
737        340       350       360       370       380       390       
739          2170      2180             2190      2200      2210       
740 PAPA_C EVLNDGDVNIPEYVDWRQK-----GAV--TPVKNQGSCGSCWAFSAVVTIEGIIKIRTGN
741        ..::. : .. . :.::::     :::  . ..:..   . :.  ::..  :  ... : 
742 CG4810 KALNEWDSKVTNSVEWRQKLDTQRGAVLASELRNNACKLARWTVEAVLA--GSDQLKLGY
743        400       410       420       430       440         450     
745       2220      2230      2240      2250      2260      2270       
746 PAPA_C LNEYSEQELLDCDRRSYGCNGGYPWSALQLVAQYGIHYRNTYPYEGVQRYCRSREKGPYA
747        ..... .. :                                                  
748 CG4810 VSRMNPRDHLRHVILGTQQFKPQEFATQINLNMDNAWGVLRCLIDLVMRQPDGKYLIMKD
749          460       470       480       490       500       510     
754 2385 residues in 1 query   sequences
755 7177762 residues in 14334 library sequences
756  Scomplib [33t08]
757  start: Tue May 21 16:24:31 2002 done: Tue May 21 16:24:44 2002
758  Scan time: 11.240 Display time:  1.580
760 Function used was FASTA [version 3.3t08 Jan. 17, 2001]