A test to ensure Bio::PrimarySeqI->trunc() doesn't use clone() for a Bio::Seq::RichSe...
[bioperl-live.git] / t / data / U71225.gb.unix
blobc88c596c12062d2c9c4f800d38860796779b0ab4
1 LOCUS       U71225                  1164 bp    DNA     linear   VRT 27-NOV-2001
2 DEFINITION  Desmognathus quadramaculatus 12S ribosomal RNA gene, partial
3             sequence; tRNA-Val gene, complete sequence; and 16S ribosomal RNA
4             gene, partial sequence, mitochondrial genes for mitochondrial RNAs.
5 ACCESSION   U71225
6 VERSION     U71225.1  GI:2804359
7 KEYWORDS    .
8 SOURCE      mitochondrion Desmognathus quadramaculatus (black-bellied
9             salamander)
10   ORGANISM  Desmognathus quadramaculatus
11             Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
12             Amphibia; Batrachia; Caudata; Salamandroidea; Plethodontidae;
13             Desmognathinae; Desmognathus.
14 REFERENCE   1  (bases 1 to 1164)
15   AUTHORS   Titus,T.A. and Larson,A.
16   TITLE     Molecular phylogenetics of Desmognathine salamanders (Caudata:
17             Plethodontidae): A reevaluation of evolution in ecology, life
18             history, and morphology
19   JOURNAL   Syst. Biol. 45, 451-472 (1996)
20 REFERENCE   2  (bases 1 to 1164)
21   AUTHORS   Titus,T.A.
22   TITLE     Direct Submission
23   JOURNAL   Submitted (19-SEP-1996) Biology, University of Oregon, Eugene, OR
24             97403, USA
25 FEATURES             Location/Qualifiers
26      source          1..1164
27                      /organism="Desmognathus quadramaculatus"
28                      /organelle="mitochondrion"
29                      /mol_type="genomic DNA"
30                      /db_xref="taxon:52105"
31      rRNA            <1..638
32                      /product="12S ribosomal RNA"
33      tRNA            639..706
34                      /product="tRNA-Val"
35      rRNA            707..>1164
36                      /product="16S ribosomal RNA"
37 ORIGIN      
38         1 ggcccaaagg gtagttttag gtgaaataaa atagaattta aaatttatct agtagttata
39        61 tataaacata aaatgtaaaa tcaaaaacga aagtcatact atataacctt gaatctacta
40       121 cagctgagaa acaaactagg attagatacc ctactatgct caactttaaa atggaccttc
41       181 ccgccagagc actacgagcc acagcttaaa actcaaagga cttggcggtg ctctacaccc
42       241 acctagagga gcctgttcta taatcgacac tccccgataa acctcaccac ctcttgctaa
43       301 tacagcctat ataccaccgc cctcagttca cccttcaaaa gaataatagt gaacaaaata
44       361 atttaaaata aaaaagtcag gtcaaggtgc agcaaatgaa gtggaaagaa atgggctaca
45       421 ttttttatag taaaaaatac ggaatattct atgaaataaa atataaagga ggatttagaa
46       481 gtaaaaagaa aaaagagtgt tctttttaaa ttggcaatag agcacgcaca caccgcccgt
47       541 caccctcttc aaaattaaat aaactaaata aatatataaa tttataagaa aaggtaagtc
48       601 gtaacatggt aagtctaccg gaaggtggcc ttggatatcg aagtatagct taaataaagc
49       661 attttgctta caccaaaaaa atatttgtta acccaaatta ccttaaattt taaatctatg
50       721 ctaaatataa aatactactt cctaatacac aaaacattat tatatgatag tacgggcgac
51       781 agaaaactta ttagcgcaat agaaaaagta ctgtaaagga aagatgaaat aaaattgaaa
52       841 taaaataaaa atataaaaga gcaaagatta taacttttac ctttagcata atggtctagc
53       901 cagtctatat taacataaag aattttagtt atataccccg aaaccaggcg agctacccta
54       961 aaacagcaat atatgagcga actcttctct gtggcaaaag agtgagaaga atttttggta
55      1021 gaggcgaaaa accaaacgag cccggatata gctggttact tgagaatgaa ttttagttca
56      1081 attaaaagca taaatattat aaaaacataa cgcttttatt ataattaatt gaggtacagc
57      1141 ccaattaata aaggaaacaa ccta