A test to ensure Bio::PrimarySeqI->trunc() doesn't use clone() for a Bio::Seq::RichSe...
[bioperl-live.git] / t / data / GlimmerM.out
blob698ac9efafa2aaf641a76e2919ffbd5bb60b6bba
1 GlimmerM (Version 3.0)
2 Sequence name: gi|23613028|ref|NC_004326.1|
3 Sequence length: 69930 bp
5 Predicted genes/exons
7 Gene Exon Strand  Exon            Exon Range      Exon
8    #    #         Type                           Length
10    1    1  -  Single          461        523       63
12    2    1  +  Initial        1095       1103        9
13    2    2  +  Internal       1167       1208       42
14    2    3  +  Terminal       1404       1445       42
16    3    1  -  Single         7055       7162      108
18    4    1  +  Initial        7273       7356       84
19    4    2  +  Internal       7434       7598      165
20    4    3  +  Internal       7861       7898       38
21    4    4  +  Terminal       7957       7975       19
23    5    1  +  Initial       20929      23815     2887
24    5    2  +  Terminal      23910      23956       47
26    6    1  +  Initial       24046      26310     2265
27    6    2  +  Internal      27215      28399     1185
28    6    3  +  Internal      28848      28855        8
29    6    4  +  Internal      29246      29309       64
30    6    5  +  Terminal      29502      29516       15
32    7    2  -  Terminal      29593      29600        8
33    7    1  -  Initial       29919      30636      718
35    8    8  -  Terminal      30737      30744        8
36    8    7  -  Internal      31124      31150       27
37    8    6  -  Internal      31814      31883       70
38    8    5  -  Internal      32469      32515       47
39    8    4  -  Internal      33199      34126      928
40    8    3  -  Internal      34647      34688       42
41    8    2  -  Internal      35216      35334      119
42    8    1  -  Initial       36613      36853      241
44    9    1  +  Initial       36912      37101      190
45    9    2  +  Internal      37285      37300       16
46    9    3  +  Terminal      37999      38005        7
48   10    5  -  Terminal      42047      42104       58
49   10    4  -  Internal      42781      42795       15
50   10    3  -  Internal      42864      42888       25
51   10    2  -  Internal      43211      43217        7
52   10    1  -  Initial       43372      46329     2958