t/data/codeml_lysozyme/lysozymeSmall.trees

   1 2 \r
   2 \r
   3 ((Hsa_Human: 0.02556, Hla_gibbon: 0.03889): 0.06798,\r
   4 ((Cgu/Can_colobus: 0.04379, Pne_langur: 0.05254) #1 : 0.07637, Mmu_rhesus:\r
   5 0.02168): 0.04345, (Ssc_squirrelM: 0.04080, Cja_marmoset: 0.02392):\r
   6 0.12266);\r
   7 ((Hsa_Human: 0.02556, Hla_gibbon: 0.03889): 0.06798,\r
   8 ((Cgu/Can_colobus: 0.04379, Pne_langur: 0.05254) #1 : 0.07637, Mmu_rhesus:\r
   9 0.02168): 0.04345, (Ssc_squirrelM: 0.04080, Cja_marmoset: 0.02392):\r
  10 0.12266);\r
  11 \r
  12 \r
  13 ((Hsa_Human, Hla_gibbon),((Cgu/Can_colobus, Pne_langur) #1,\r
  14 Mmu_rhesus), (Ssc_squirrelM, Cja_marmoset)); / * table 1B&F */\r
  15 \r
  16 \r
  17 ((1,2), ((3,4) #1, 5), (6,7) );     / * table 1B&F */\r
  18 ((1,2) #1, ((3,4), 5), (6,7) );        / * table 1C&G */\r
  19 ((1,2) #1, ((3,4) #1, 5), (6,7) );     / * table 1D&H */\r
  20 \r
  21 ((1,2) #1, ((3,4) #2, 5), (6,7) );     / * table 1E&I */\r
  22 ((1,2) #2, ((3,4) #1, 5), (6,7) );     / * table 1E&J */\r
  23 \r
  24 \r
  25 ((1,2), ((3,4), 5), (6,7) );\r
  26 \r
  27 For lysozymeSmall.nuc (Messier and Stewart 1997; Yang 1998)\r
  28 \r
  29  1: Hsa_Human\r
  30  2: Hla_gibbon\r
  31  3: Cgu/Can_colobus\r
  32  4: Pne_langur\r
  33  5: Mmu_rhesus\r
  34  6: Ssc_squirrelM\r
  35  7: Cja_marmoset\r
  36 \r