t/data/crypto.sim4-3

   1
   2 seq1 = cn416, 630 bp
   3 seq2 = Contig147.fa (>Contig147), 1086 bp
   4
   5
   6 36-132  (191-286)   89% <-
   7 133-191  (343-401)   93%
   8
   9       0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  10      36 AAAGCCATGCAATGCATCCCATGATACCAAAGATAAAATATCCAAAAATC
  11         |||||||||||||||||||-||||||||||||| || |||||||||||||
  12     191 AAAGCCATGCAATGCATCC ATGATACCAAAGACAATATATCCAAAAATC
  13
  14      50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  15      86 CATGACCGATCCTGATGCAATAACCAAGAGACCGTTTATCCCGGGAA
  16          | ||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||<<<
  17     240 TAAGATTGATCATCATGCAATAACCAAGAGACCCTTTATCCCGGGAACTA
  18
  19     100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  20     133       TGCCACAACGTAGTCCTTCTGTACATCCTGAACATTTCCATCAT
  21         ...<<<|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
  22     290 ...CACTGCCACAACGTAGTCCTTTTGTACATCCTGAACATTTCCATCAT
  23
  24     150     .    :    .
  25     177 CATCAACGAA AAGTA
  26         |||| |||||-||-||
  27     387 CATCTACGAACAA TA
  28