t/data/BK000016-tpa.gbk

   1 LOCUS       BK000016                1162 bp    mRNA    linear   ROD 17-MAY-2002
   2 DEFINITION  TPA: Mus musculus pantothenate kinase 4 mRNA, partial cds.
   3 ACCESSION   BK000016
   4 VERSION     BK000016.1  GI:20043254
   5 KEYWORDS    Third Party Annotation; TPA.
   6 SOURCE      Mus musculus (house mouse)
   7   ORGANISM  Mus musculus
   8             Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
   9             Mammalia; Eutheria; Rodentia; Sciurognathi; Muridae; Murinae; Mus.
  10 REFERENCE   1  (bases 1 to 1162)
  11   AUTHORS   Zhou,B., Westaway,S.K., Levinson,B., Johnson,M.A., Gitschier,J. and
  12             Hayflick,S.J.
  13   TITLE     A novel pantothenate kinase gene (PANK2) is defective in
  14             Hallervorden-Spatz syndrome
  15   JOURNAL   Nat. Genet. 28 (4), 345-349 (2001)
  16   MEDLINE   21372465
  17    PUBMED   11479594
  18 REFERENCE   2  (bases 1 to 1162)
  19   AUTHORS   Zhou,B., Westaway,S.K., Levinson,B., Johnson,M.A., Gitschier,J. and
  20             Hayflick,S.J.
  21   TITLE     Direct Submission
  22   JOURNAL   Submitted (31-JUL-2001) Medicine and HHMI, University of
  23             California, San Francisco, 3rd and Parnassus Avenues, San
  24             Francisco, CA 94143, USA
  25 PRIMARY     TPA_SPAN            PRIMARY_IDENTIFIER PRIMARY_SPAN        COMP
  26             1-455               BE554781.1         1-455
  27             177-687             BG146074.1         1-511
  28             608-956             AA671765.1         45-393
  29             656-1162            BE982078.1         1-507               c
  30 FEATURES             Location/Qualifiers
  31      source          1..1162
  32                      /organism="Mus musculus"
  33                      /mol_type="mRNA"
  34                      /db_xref="taxon:10090"
  35      CDS             <1..1119
  36                      /note="PANK4"
  37                      /codon_start=1
  38                      /product="pantothenate kinase 4"
  39                      /protein_id="DAA00010.1"
  40                      /db_xref="GI:20043255"
  41                      /translation="ERGASGGGSGGDSLDKSITLPPDEIFRNLENAKRFAIDIGGSLT
  42                      KLAYYSTVQHKVAKVRSFDHPGKDVEQDHEPPYEISVQEEITARLHFIKFENTYMEAC
  43                      LDFIRDHLVNTETKVIQATGGGAYKFKDLIEEKLRLKVDKEDVMTCLIKGCNFVLKNI
  44                      PHEAFMYQKDADPEFRFQTNHPNIFPYLLVNIGSGVSIVKVETEDRFEWIGGSSIGGG
  45                      TFWGLGALLTKTKKFDELLQLASRGRHANVDMLVQDIYGGAHQTLGLSGNLIASSFGK
  46                      SATADREFSKEDMAKSLLHMISNDIGQLACLYAKLHGLDRVYFGGFFIRGHPVTMRTI
  47                      TYSINFFSKGEVQALFLRHEGYLGAIGAFLKGAEQDSE"
  48 BASE COUNT      290 a    308 c    332 g    232 t
  49 ORIGIN
  50         1 gagcgtggag cgagtggcgg cgggagcggc ggggacagtc tggacaagag catcacgctg
  51        61 ccccccgacg agatcttccg caacctggag aacgccaagc gcttcgccat tgatataggt
  52       121 ggatcattga ccaagttggc atactattcc accgtacagc acaaagtggc caaagtgaga
  53       181 tcttttgacc acccgggaaa ggacgtggag caggatcatg agccacccta tgagatctca
  54       241 gtccaggagg agatcacagc tcgcctgcat ttcatcaagt ttgagaatac ctacatggaa
  55       301 gcctgcctgg acttcatcag agaccaccta gtcaacactg agaccaaggt catccaggcc
  56       361 actgggggtg gagcctataa gttcaaggac ctcatcgagg aaaagctgcg tctgaaggtg
  57       421 gacaaagagg atgtaatgac ctgcttgata aaggggtgca acttcgtgct gaagaacatc
  58       481 ccgcatgagg ccttcatgta ccagaaagac gcagacccag agtttcgatt tcagacaaat
  59       541 caccccaaca tcttccccta cctcctagtc aacattggct ctggcgtctc catcgtgaag
  60       601 gtggagacag aggaccggtt tgagtggatt ggtggaagct ccattggagg aggcaccttc
  61       661 tggggcctcg gggctctgct caccaaaaca aagaagtttg atgagctgct gcagctggct
  62       721 tccagaggcc ggcatgccaa cgttgacatg ctggtccagg acatctatgg tggggcccac
  63       781 cagaccctgg gcctgagtgg caatctcatc gcaagcagtt ttgggaagtc agccactgct
  64       841 gacagagagt tctccaaaga agacatggcc aagagcctgc tgcacatgat cagcaatgac
  65       901 atcgggcagc tcgcctgtct gtacgccaag ctccacggct tggacagggt ctactttggg
  66       961 ggcttcttca tccggggtca ccccgtgacc atgcgcacaa tcacctacag cattaacttc
  67      1021 ttctccaagg gtgaagtcca ggcactcttc ctgagacatg aaggctacct gggagccatc
  68      1081 ggggcatttt taaaaggagc cgagcaagac agtgagtaga gtcactgctg tgagcagtgg
  69      1141 ctggctgtgc aggacgcggc cg
  70 //