branch-1-6/t/data/testfile.erpin

   1
   2 Training set:   "/home/Administrator/pyrR.epn":
   3                 40 sequences of length 43
   4 Cutoff:         1.00
   5
   6 Database:       "AE016879.fna"
   7                 5227266 nucleotides to be processed in 1 sequence
   8                 ATGC ratios: 0.322  0.324  0.176  0.178
   9 E-value at cutoff 1.0 for 5.2Mb double strand data: 4.59e-02
  10
  11 >gi|30260185|gb|AE016879.1| Bacillus anthracis str. Ames, complete genome
  12 FW   1 5181155..5181183  30.36  1.68e-05
  13 CTTT.aacc--.CAACC.CCGTGA.GGTTG.a.GAAG
  14 >gi|30260185|gb|AE016879.1| Bacillus anthracis str. Ames, complete genome
  15 RC   1 3709092..3709121  28.97  5.61e-05
  16 CTTT.taatt-.CAGTC.CTGTGA.GACCG.g.AAAG
  17 RC   2 3710524..3710553  27.97  1.31e-04
  18 TTTT.aaatg-.TAGTC.CTGTGA.GGCTG.c.CAAA
  19 RC   3 3711223..3711251  31.64  4.44e-06
  20 CTTT.aaca--.CAGCC.CCGTGA.GGTTG.a.GAAG
  21
  22 -------- at level 1 --------
  23 10454532 bases processed
  24 cutoff: 1.00
  25 6 config. per site
  26 10 hits
  27 4 independent hits
  28