tag fourth (and hopefully last) alpha
[bioperl-live.git] / branch-1-6 / t / data / cysprot.water
blob72e8eeba51f8f3b722d0ff9389d4c392adaef6a4
1 Local: PAPA_CARPA vs CATL_HUMAN
2 Score: 501.50
4 PAPA_CARPA      3        MIPSISKLLFVAICLFVYMGLSFGDFSIVGYSQNDLTSTERLIQL 47      
5                          | |:   |:  | ||              | :   ||    |   
6 CATL_HUMAN      1        MNPT...LILAAFCL..............GIASATLTFDHSLEAQ 28      
8 PAPA_CARPA      48       FESWMLKHNKIYKNIDEKIYRFEIFKDNLKYIDETNKK....NNS 88      
9                          :  |   ||::|  ::|: :|  ::: |:| |:  |::     :|
10 CATL_HUMAN      29       WTKWKAMHNRLY.GMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQEYREGKHS 72      
12 PAPA_CARPA      89       YWLGLNVFADMSNDEFKEKYTG.....SIAGNYTTTELSYEEVLN 128     
13                          : : :| | ||:::||::   |        |      | ||    
14 CATL_HUMAN      73       FTMAMNAFGDMTSEEFRQVMNGFQNRKPRKGKVFQEPLFYE.... 113     
16 PAPA_CARPA      129      DGDVNIPEYVDWRQKGAVTPVKNQGSCGSCWAFSAVVTIEGIIKI 173     
17                                |  ||||:|| |||||||| |||||||||   :|| :  
18 CATL_HUMAN      114      .....APRSVDWREKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMFR 153     
20 PAPA_CARPA      174      RTGNLNEYSEQELLDCD..RRSYGCNGGYPWSALQLVAQY.GIHY 215     
21                          :|| |   ||| |:||   : : |||||    | | |    |:  
22 CATL_HUMAN      154      KTGRLISLSEQNLVDCSGPQGNEGCNGGLMDYAFQYVQDNGGLDS 198     
24 PAPA_CARPA      216      RNTYPYEGVQRYCRSREKGPYAAKTD.GVRQVQPYNEGALLYSIA 259     
25                            :||||  :  |:   |  |:   | |   : |  | ||: ::|
26 CATL_HUMAN      199      EESYPYEATEESCKYNPK..YSVANDTGFVDI.PKQEKALMKAVA 240     
28 PAPA_CARPA      260      N.QPVSVVLEAAGKDFQLYRGGIFVGP.CGNK.VDHAVAAVGYG. 300     
29                             |:|| ::|  : |  |: ||:  | | :: :|| |  |||| 
30 CATL_HUMAN      241      TVGPISVAIDAGHESFLFYKEGIYFEPDCSSEDMDHGVLVVGYGF 285     
32 PAPA_CARPA      301      .......PNYILIKNSWGTGWGENGYIRIKRGTGNSYGVCGLYTS 338     
33                                   | |:|||||  ||  ||::: :   |    ||: ::
34 CATL_HUMAN      286      ESTESDNNKYWLVKNSWGEEWGMGGYVKMAKDRRNH...CGIASA 327     
36 PAPA_CARPA      339      SFYP                                          342     
37                          : ||
38 CATL_HUMAN      328      ASYP                                          331     
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41 Overall %id = 35.65             Overall %similarity = 53.04