branch-1-6/t/data/crypto.sim4-4

   1
   2 seq1 = cn416, 630 bp
   3 seq2 = Contig147.fa (>Contig147), 1086 bp
   4
   5 >cn416 lastmodified=[2002-10-29 11:40:27] project=[B3501] length=[630] clusterid=[371] coverage=[1] crawid=[1] sequencecount=[2] longestsequence=[k9k11j2.f1] sequences=[k9k11j2.f1|k9k11j2.f1C] clone=[|k9k11j2]
   6 >Contig147
   7
   8 36-132  (191-286)   89% <-
   9 133-191  (343-401)   93%
  10
  11       0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  12      36 AAAGCCATGCAATGCATCCCATGATACCAAAGATAAAATATCCAAAAATC
  13         |||||||||||||||||||-||||||||||||| || |||||||||||||
  14     191 AAAGCCATGCAATGCATCC ATGATACCAAAGACAATATATCCAAAAATC
  15
  16      50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  17      86 CATGACCGATCCTGATGCAATAACCAAGAGACCGTTTATCCCGGGAA
  18          | ||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||<<<
  19     240 TAAGATTGATCATCATGCAATAACCAAGAGACCCTTTATCCCGGGAACTA
  20
  21     100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  22     133       TGCCACAACGTAGTCCTTCTGTACATCCTGAACATTTCCATCAT
  23         ...<<<|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
  24     290 ...CACTGCCACAACGTAGTCCTTTTGTACATCCTGAACATTTCCATCAT
  25
  26     150     .    :    .
  27     177 CATCAACGAA AAGTA
  28         |||| |||||-||-||
  29     387 CATCTACGAACAA TA
  30