branch-1-6/t/data/NM_002254.gb

   1 LOCUS       KIF3C                   4913 bp    mRNA    linear   PRI 06-APR-2003
   2 DEFINITION  Homo sapiens kinesin family member 3C (KIF3C), mRNA.
   3 ACCESSION   NM_002254
   4 VERSION     NM_002254.2  GI:19923139
   5 KEYWORDS    .
   6 SOURCE      Homo sapiens (human)
   7   ORGANISM  Homo sapiens
   8             Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
   9             Mammalia; Eutheria; Primates; Catarrhini; Hominidae; Homo.
  10 REFERENCE   1  (bases 1 to 4913)
  11   AUTHORS   Sardella,M., Navone,F., Rocchi,M., Rubartelli,A., Viggiano,L.,
  12             Vignali,G., Consalez,G.G., Sitia,R. and Cabibbo,A.
  13   TITLE     KIF3C, a novel member of the kinesin superfamily: sequence,
  14             expression, and mapping to human chromosome 2 at 2p23
  15   JOURNAL   Genomics 47 (3), 405-408 (1998)
  16   MEDLINE   98149989
  17    PUBMED   9480755
  18 REFERENCE   2  (bases 1 to 4913)
  19   AUTHORS   Telford,E.A., Wightman,P., Leek,J., Markham,A.F., Lench,N.J. and
  20             Bonthron,D.T.
  21   TITLE     cDNA cloning, genomic organization, and chromosomal localization of
  22             a novel human gene that encodes a kinesin-related protein highly
  23             similar to mouse Kif3C
  24   JOURNAL   Biochem. Biophys. Res. Commun. 242 (2), 407-412 (1998)
  25   MEDLINE   98113366
  26    PUBMED   9446808
  27 REFERENCE   3  (bases 1 to 4913)
  28   AUTHORS   Telford,E.A.R., Wightman,P., Leek,J., Lench,N.J., Markham,A.F. and
  29             Bonthron,D.T.
  30   TITLE     Homo sapiens kinesin family member 3C (KIF3C), mRNA
  31   JOURNAL   Unpublished (1997)
  32 COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
  33             NCBI review. The reference sequence was derived from AF035621.1.
  34             On Apr 4, 2002 this sequence version replaced gi:4504868.
  35 FEATURES             Location/Qualifiers
  36      source          1..4913
  37                      /organism="Homo sapiens"
  38                      /mol_type="mRNA"
  39                      /db_xref="taxon:9606"
  40                      /chromosome="2"
  41                      /map="2p23"
  42      gene            1..4913
  43                      /gene="KIF3C"
  44                      /db_xref="LocusID:3797"
  45                      /db_xref="MIM:602845"
  46      CDS             154..2535
  47                      /gene="KIF3C"
  48                      /codon_start=1
  49                      /product="kinesin family member 3C"
  50                      /protein_id="NP_002245.2"
  51                      /db_xref="GI:19923140"
  52                      /db_xref="LocusID:3797"
  53                      /db_xref="MIM:602845"
  54                      /translation="MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTL
  55                      RNPRAAPGELPKTFTFDAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTG
  56                      KTYTMQGTWVEPELRGVIPNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKE
  57                      PGKRLELKENPETGVYIKDLSSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHA
  58                      IFIITVECSERGSDGQDHIRVGKLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGG
  59                      GSGGGAGGERPKEASKINLSLSALGNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNA
  60                      KTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFANRAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKA
  61                      QLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPGYPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILE
  62                      SALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRSLVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATE
  63                      LLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEE
  64                      TMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKAEIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQT
  65                      RELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWKFQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAV
  66                      GYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPAVFEMEFSHDQEQDPRALHME
  67                      RLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPSTTHASLASASLRPATVADHE"
  68      misc_feature    199..1251
  69                      /gene="KIF3C"
  70                      /note="kinesin; Region: Kinesin motor domain"
  71                      /db_xref="CDD:pfam00225"
  72      misc_feature    442..465
  73                      /gene="KIF3C"
  74                      /note="encodes ATP/GTP-binding site motif"
  75      misc_feature    871..906
  76                      /gene="KIF3C"
  77                      /note="encodes kinesin motor domain signature"
  78      polyA_signal    4889..4894
  79                      /gene="KIF3C"
  80 BASE COUNT     1150 a   1342 c   1355 g   1066 t
  81 ORIGIN
  82         1 cctcccagcg tccccaccct aggaggctgc atgcggattg aagacgtgcg cctgggggct
  83        61 gggccggccc cgctgatccc gacctagcga gcaggatagc aggaccgccc aggctgcgga
  84       121 ggggctcggg ggcaggaagg tcagagcagc aagatggcca gtaagaccaa ggccagcgag
  85       181 gccctcaagg tggtggcccg gtgccgcccc ctcagcagga aggaggaggc tgctggtcac
  86       241 gagcagatcc tgaccatgga cgtgaaactg ggccaggtga ccctgcggaa cccccgcgcc
  87       301 gccccggggg agctgcccaa gaccttcacc tttgacgccg tgtatgatgc cagctccaag
  88       361 caggccgacc tgtatgacga aaccgtgagg cccctgatag actccgtgct ccagggtttc
  89       421 aatggcacgg tgtttgccta tggccagacg ggcactggca agacctatac catgcagggg
  90       481 acctgggtgg agcccgagct gcgcggggtc atcccgaatg cctttgagca catcttcacc
  91       541 cacatctccc gctcccagaa ccaacagtac ctggtccggg cctcctattt ggagatctac
  92       601 caggaagaga ttcgagacct gctctccaag gagccgggca agaggctaga gctgaaagag
  93       661 aaccccgaga ctggcgtcta catcaaggac ctctcctcct tcgtcaccaa gaatgtcaag
  94       721 gagattgagc atgtgatgaa cctggggaac cagacccggg ctgtgggcag cacccacatg
  95       781 aatgaggtca gctcccgctc ccatgccatc ttcatcatca ctgtggagtg cagcgaacgt
  96       841 ggctctgatg gccaggacca catccgagtg ggcaagctca acctcgtgga cctggctggc
  97       901 agcgagaggc agaacaaggc aggccccaac acagcgggag gggcagccac accatcctcg
  98       961 ggtggcggtg gtggcggtgg aggcagtggt ggtggtgctg gtggagagag gcctaaggaa
  99      1021 gcctccaaaa tcaacctctc attatctgcc ctgggcaacg tgattgctgc cctggcgggc
 100      1081 aacaggagca cccacattcc ctaccgggac tccaagctga cccggctgct ccaggactcc
 101      1141 ctggggggga atgcgaagac catcatggta gccacactgg ggccagcttc tcacagctac
 102      1201 gatgagagcc tctccacctt gcgctttgcc aaccgagcca agaacatcaa gaacaagccc
 103      1261 cgggtgaacg aggaccccaa ggacacactg ctgcgggaat tccaagagga gattgcccgc
 104      1321 ctgaaggccc agctggagaa gagggggatg ctggggaagc ggccccggag gaagagcagc
 105      1381 cgcaggaaga aggccgtgtc cgccccgcct gggtaccctg agggcccagt gattgaggct
 106      1441 tgggtggcag aagaggagga tgacaacaac aacaaccacc gcccgcccca gcccatcctg
 107      1501 gagtcagcct tggagaagaa catggagaat tacctgcagg aacagaagga gcggctggag
 108      1561 gaggagaagg cagccatcca ggatgaccgc agcctggtga gcgaggagaa gcagaagctg
 109      1621 ctggaggaga aggagaagat gctggaggac ctgcggcggg aacagcaggc cacagagctg
 110      1681 cttgcggcca agtacaaggc catggagagc aagctcctca tcgggggcag gaacatcatg
 111      1741 gatcacacca acgaacagca gaagatgttg gaactgaaga ggcaggagat tgccgagcag
 112      1801 aaacgtcgtg agcgggagat gcagcaggag atgatgctcc gggacgagga gactatggag
 113      1861 ctccggggca cctacacatc cctgcagcag gaggtggagg tcaaaaccaa gaaactcaag
 114      1921 aagctctacg ccaagctgca ggcggtgaag gcggagatcc aggaccagca tgatgagtat
 115      1981 atccgcgtgc ggcaggacct ggaggaggcg cagaacgagc agacccgcga actcaagctc
 116      2041 aagtacctaa tcatcgagaa cttcatcccg ccggaggaga agaacaagat catgaaccgg
 117      2101 cttttcctgg actgtgagga ggagcagtgg aagttccagc cactggtgcc agccggcgtc
 118      2161 agtagcagcc agatgaagaa gcggccaaca tctgcagtgg gctacaagag gcctatcagc
 119      2221 cagtatgctc gggttgccat ggcaatgggg tcccacccca ggtacagggc tgaaaacata
 120      2281 atgtttctgg agttggatgt gtcccctcca gctgtctttg agatggaatt ctctcacgac
 121      2341 caagaacaag accctcgtgc gctacacatg gagaggctca tgcgattgga cagctttctg
 122      2401 gaaagacctt ccacgtctaa agtccgaaag tccagatcct ggtgccagag tcctcagcgg
 123      2461 cctccacctt ccaccacaca tgcctccctg gcctctgctt ctctgcgccc tgcaacagtg
 124      2521 gcggaccatg agtgacaacc atcacgtcag gctgcccatc caatagactc ctgggatggg
 125      2581 gcagccaacc ctggctcatc tcatctgccg cttggtgcgt gtgcgtgtgc gtgcatgtgc
 126      2641 gtgtgcgtgt gtgcaggggt gagaatctgg cagatggtgc ctctgcctgc tcttcttcgc
 127      2701 ctcctttatt taattcatgt tatttattcg cggacgtctg ttcgtgttgg ggagatgccc
 128      2761 tcgcctgagc cgtctgggcc taccgtggtc actgcgtacg ctctttttct tctgacttga
 129      2821 gagctccccc agtcagatct caggcttgtc cccctgtcag ctgcctccag aagggaaggt
 130      2881 agccagtgcc tgagaagaca gtcccttttc tacccaccgc actccataac ctccatcttc
 131      2941 tcccacactg atggcgagca gcccctgagc actttctggg actgggagac tgcttggtgt
 132      3001 tccctgagga caagagacat cctgacagtg ttgggcatct gctccccgtg gacacagccc
 133      3061 cactctccac tttctgagcc tcagacaacc tcattcagcc tcttgggctc cttttcaagg
 134      3121 acattaataa cctcaccaac atagctcatg cccttcagct ttgacaagaa ctcacggctt
 135      3181 cccaaactct gctttctgcc caccttggat gggaactgtg gaccaagcaa ttaccatcgc
 136      3241 cttggaacct gcaggaaatg gaacagcaat tgagacaact tgaacagtca tcaacggaag
 137      3301 tccctccact ggattccttt gtttctgtcc cctccgagga gtcattttgg tcgacaggct
 138      3361 ctcaaggcaa ctccccattt tcaagaggct gctcctgcct gcttcgatca tttctccctg
 139      3421 cagctgccta gaccccgttc acagtgggag gagtcaatgt cattctaccc ctcgctaaac
 140      3481 gaagatatta acatctattg ctttttccct tcatctgtca caggaaacag aagcccaggc
 141      3541 acaatctttt ccagctttgc ctgttacccc tgtttctgaa ttgcatcttt aaggtattat
 142      3601 tttgttgaca atagatcctt tattcactag ttacgcaaat tggttcctag ggggatactc
 143      3661 cttaccttcc tttgtgatgg cccaaaatgt ctctaggtat ctcaagtgat aagtaaattt
 144      3721 ctacaaaaaa aaaatggtta atgttcattg actggctttt taagtgtata ttttggagga
 145      3781 cgggtgaaga ggtcataacg aaagcaagcg agtgaattag gatttcaaag tgccctaata
 146      3841 gtgtgagtct ccagttccta gaatatgaag agtgctgtcg ttggggtgaa accatgagac
 147      3901 tgacagatct gcctgaaatg gggggtgtgg gaggtggtgg cgggggttat tctctttcct
 148      3961 tcaggaaatg aacccttctt acatcattca agttctgctc tgaggatcaa gcttgggtct
 149      4021 gatttaactc agcgacactg tcatttctgc ttcattactg gactagaggg ttgagccacc
 150      4081 cacttgccat ttgctcctgt ccttccagga aatcacaatt ttcatcagag cccaagagat
 151      4141 tatttgagac tcaggattca gatcagaggt tcgactgtgg ctgggacagg agttgtgtgt
 152      4201 agaaattcac caggtggcct gagcgcaggg ggacctccag gctgcgttga gcagcctctc
 153      4261 ccactgacct ctttctcgtt tgtggacaaa gcagcacgta tcacctcatt catcacttgg
 154      4321 acacatcgcc tttgcattgt cttgtcacac ctccctcaca gtcttatagc acaatatacc
 155      4381 caaatcagcc cccccagtcc gaggctgggc ccaaggtatg gtcggaggag gagctcctgc
 156      4441 ctgcggtttt gtgtatgtgt gtatgtgtgt gcgtgtttgt gtgcgtgttt acctccacag
 157      4501 gggacactct acactcagtg taagatctgc tgggaacagg gccaccagga gtgcgtggat
 158      4561 ctcagtctct ctgtctctct ttctctcctt ttaattttgg tgtatcaaat atttgattga
 159      4621 caaagtaagg gccttgatta ggaccaaatt ctcgtgtgtt gctatggtct ttatttagga
 160      4681 caacaattaa caatgcagtg gcccattctt gtcactctac acatatgact atacgggaca
 161      4741 tatgtaatat ataaatatat atataaaaca ttcccctctg tccccttggc ttcggatgga
 162      4801 ggaatttctg ttgagctgaa atgcacctgc agctgggtgc tgccagcagc ttgcaggccc
 163      4861 cagccctgtt ccaatcaatg cagttgacaa taaaggaatg agtatcgtca cgg
 164 //
 165