branch-1-6/t/data/M12730.gb

   1 LOCUS       PNECG                   2355 bp    DNA     circular BCT 21-APR-1996
   2 DEFINITION  Plasmid pNE131 (from S.epidermidis), complete genome.
   3 ACCESSION   M12730
   4 VERSION     M12730.1  GI:150829
   5 KEYWORDS    MLS antibiotics resistance; complete genome;
   6             macrolide-lincosamide-streptogramin B resistance; plasmid;
   7             replication and maintenance protein.
   8 SOURCE      Plasmid pNE131
   9   ORGANISM  Plasmid pNE131
  10             other sequences; plasmids; Plasmid.
  11 REFERENCE   1  (bases 696 to 1586)
  12   AUTHORS   Lampson,B.C. and Parisi,J.T.
  13   TITLE     Naturally occurring Staphylococcus epidermidis plasmid expressing
  14             constitutive macrolide-lincosamide-streptogramin B resistance
  15             contains a deleted attenuator
  16   JOURNAL   J. Bacteriol. 166 (2), 479-483 (1986)
  17    PUBMED   3084450
  18 REFERENCE   2  (bases 1 to 2355)
  19   AUTHORS   Lampson,B.C. and Parisi,J.T.
  20   TITLE     Nucleotide sequence of the constitutive
  21             macrolide-lincosamide-streptogramin B resistance plasmid pNE131
  22             from Staphylococcus epidermidis and homologies with Staphylococcus
  23             aureus plasmids pE194 and pSN2
  24   JOURNAL   J. Bacteriol. 167 (3), 888-892 (1986)
  25    PUBMED   3091582
  26 COMMENT     Original source text: Plasmid pNE131 (clone: pNE131.) DNA. Draft
  27             entry and clean copy sequence for [2] kindly provided by
  28             J.T.Parisi, 04-AUG-1986. Ribosome binding sites are located at
  29             positions 754-759, 769-773, and 1944-1948; a -35 region at
  30             1889-1899, and -10 regions at 733-738, and 1927-1932.
  31 FEATURES             Location/Qualifiers
  32      source          1..2355
  33                      /db_xref="taxon:2608"
  34                      /mol_type="genomic DNA"
  35                      /clone="pNE131."
  36                      /specific_host="Staphylococcus epidermidis"
  37                      /plasmid="Plasmid pNE131"
  38                      /organism="Plasmid pNE131"
  39      CDS             join(1959..2355,1..92)
  40                      /db_xref="GI:150830"
  41                      /codon_start=1
  42                      /protein_id="AAA98295.1"
  43                      /translation="MKERYGTVYKGSQRLIDEESGEVIEVDKLYRKQTSGNFVKAYIV
  44                      QLISMLDMIGGKKLKIVNYILDNVHLSNNTMIATTREIAKATGTSLQTVITTLKILEE
  45                      GNIIKRKTGVLMLNPELLMRGDDQKQKYLLLEFGNFEQEANEKQENALYLIIILSRTS
  46                      IT"
  47                      /product="replication and maintenance protein"
  48                      /transl_table=11
  49      gene            706..1550
  50                      /gene="ermM"
  51      -35_signal      706..715
  52                      /gene="ermM"
  53      -10_signal      733..738
  54                      /gene="ermM"
  55      mRNA            746..1550
  56                      /gene="ermM"
  57      CDS             780..1514
  58                      /protein_id="AAA98296.1"
  59                      /gene="ermM"
  60                      /transl_table=11
  61                      /db_xref="GI:150831"
  62                      /codon_start=1
  63                      /product="macrolide-lincosamide-streptogramin
  64                      B-resistance protein"
  65                      /translation="MNEKNIKHSQNFITSKHNIDKIMTNIRLNEHDNIFEIGSGKGHF
  66                      TLELVQRCNFVTAIEIDHKLCKTTENKLVDHDNFQVLNKDILQFKFPKNQSYKIFGNI
  67                      PYNISTDIIRKIVFDSIADEIYLIVEYGFAKRLLNTKRSFALFLMAEVDISILSMVPR
  68                      EYFHPKPKVNSSLIRLNRKKSRISHKDKQKYNYFVMKWVNKEYKKIFTKNQFNNSLKH
  69                      AGIDDLNNISFEQFLSLFNSYKLFNK"
  70      terminator      1513..1546
  71                      /gene="ermM"
  72                      /note="putative"
  73 BASE COUNT      911 a    359 c    371 g    714 t
  74 ORIGIN      1 bp upstream of TaqI site.
  75         1 tcgaatttgg gaactttgag caagaggcaa atgaaaaaca agaaaatgca ctttatctga
  76        61 ttattattct ttcaaggact agtataacat aaatcgtcta caaatagaca aaaaacctgc
  77       121 acgcttaatg tagatcaaaa gcttaacgca aatgaaatag attgacctcc caataacacc
  78       181 acgttagtta ttgggagtca atctatgaaa tgcgattaag ctttttctaa ttcacataag
  79       241 cgtgcaggtt taaagtacat aaaaaatata atgaaaaaaa gcatcattat actaacgtta
  80       301 taccaacatt atactaattg cttattccaa tttcctattg gttggaacca acaggcgtta
  81       361 gtgtgttgtt gagttggtac tttcatggga ttaatcccat gaaaccccca accaactcgc
  82       421 caaagctttg gctaacacac acgccattcc aaccaatagt tttctcggca ttaaagccat
  83       481 gctctgacgc ttaaatgcac taatgcctta aaaaaacatt aaagtctaac acactagact
  84       541 tattttcatt cgtaattaag tcgttaaacc gtgtgctcta cgaccaaaag tataaaacct
  85       601 ttaagaactt tcttttttct tgtaaaaaaa gaaactagat aaatctctca tatcttttat
  86       661 tcaataatcg catcagattg cagtataaat ttaacgatca ctcatcatgt tcatatttat
  87       721 cagagctcgt gctataatta tactaatttt ataaggagga aaaaataaag agggttataa
  88       781 tgaacgagaa aaatataaaa cacagtcaaa actttattac ttcaaaacat aatatagata
  89       841 aaataatgac aaatataaga ttaaatgaac atgataatat ctttgaaatc ggctcaggaa
  90       901 aagggcattt tacccttgaa ttagtacaga ggtgtaattt cgtaactgcc attgaaatag
  91       961 accataaatt atgcaaaact acagaaaata aacttgttga tcacgataat ttccaagttt
  92      1021 taaacaagga tatattgcag tttaaatttc ctaaaaacca atcctataaa atatttggta
  93      1081 atatacctta taacataagt acggatataa tacgcaaaat tgtttttgat agtatagctg
  94      1141 atgagattta tttaatcgtg gaatacgggt ttgctaaaag attattaaat acaaaacgct
  95      1201 cattcgcatt atttttaatg gcagaagttg atatttctat attaagtatg gttccaagag
  96      1261 aatattttca tcctaaacct aaagtgaata gctcacttat cagattaaat agaaaaaaat
  97      1321 caagaatatc acacaaagat aaacagaagt ataattattt cgttatgaaa tgggttaaca
  98      1381 aagaatacaa gaaaatattt acaaaaaatc aatttaacaa ttccttaaaa catgcaggaa
  99      1441 ttgacgattt aaacaatatt agctttgaac aattcttatc tcttttcaat agctataaat
 100      1501 tatttaataa gtaagttaag ggatgcataa actgcatcct taacttgttt ttcgtgtacc
 101      1561 tattttttgt gaatcgatta tgtcttttgc gcattcactt cttttctata taaatatgag
 102      1621 cgacagataa gcgtcggaaa agcagcaaaa agtttccttt ttgctgttgg agcatggggg
 103      1681 ttcagggggt gcagtatctg acgtcaatgc cgagcgaaag cgagccgaag ggtagcattt
 104      1741 acgttagata accccctgat atgctccgac gctttatata gaaaagaaga ttcaactagg
 105      1801 taaaatctta atataggttg agatgataag gtttataagg aatttgtttg ttctaatttt
 106      1861 tcactcattt tgttctaatt tcttttaaca aatgttcttt tttttttaga acagttatga
 107      1921 tatagttaga atagtttaaa ataaggagtg agaaaaagat gaaagaaaga tatggaacag
 108      1981 tctataaagg ctctcagagg ctcatagacg aagaaagtgg agaagtcata gaggtagaca
 109      2041 agttataccg taaacaaacg tctggtaact tcgtaaaggc atatatagtg caattaataa
 110      2101 gtatgttaga tatgattggc ggaaaaaaac ttaaaatcgt taactatatc ctagataatg
 111      2161 tccacttaag taacaataca atgatagcta caacaagaga aatagcaaaa gctacaggaa
 112      2221 caagtctaca aacagtaata acaacactta aaatcttaga agaaggaaat attataaaaa
 113      2281 gaaaaactgg agtattaatg ttaaaccctg aactactaat gagaggcgac gaccaaaaac
 114      2341 aaaaatacct cttac
 115 //