tag fourth (and hopefully last) alpha
[bioperl-live.git] / branch-1-6 / t / data / CG2865.fasaln
blob0801eaa3da1f9b4c2d9766ae70c715b6b312f3da
1 >mel;CG2865-PA_X_EXON_2137737-2148845
2 ATGACCTTGCCCACAAACACACACGCATCTGCAAACGACGGCGGCAGCGGCAACAACAACCACAGCAATATCAGCAGTAACAACAGCAGCAGCAGCGACGAAGACTCAGACATGTTTGGACCACCCCGCTGCTCCCCGCCCATCGGCTATCACCATCACCGTTCCCGTGTGCCCATGATCTCGCCAAAGCTGCGGCAGCGCGAGGAGCGCAAGCGGATCCTCCAGCTCTGCGCCCACAAGATGGAGAGGATCAAGGACTCGGAGGCGAACCTGCGGCGCAGCGTCTGCATCAACAACACCTACTGCCGCCTGAATGACGAACTGCGGCGCGAGAAGCAGATGCGCTACCTCCAGAATCTGCCCAGAACCAGCGACAGCGGCGCAAGCACCGAACTGGCGCGTGAGAATCTCTTCCAGCCGAACATGGACGACGCCAAGCCGGCCGGCAATAGCACTAGCAATAATATCAACGCCAACGGCAAGCCTTCATCCTCTTTTGGCGATGCCTTTGGCTCCTCAAACGGATCATCGTCGGGTCGCGGCGGAATTTGCTCCCTGGAGAATCAACCGCCCGAGCGTCAGCAGTTGGGGACGCCCGCTGGTGCCTCCGCTCCCGAGGCGGCCAATTCGGCGCCCCTTTCCGTTTCGGGCTCGGCATCGGAACGCGTGAATAACCGAAAACGCCACCTGTCCAGCTGCAACTTGGTCAACGATCTGGAAATACTGGACAGGGAGCTGAGCGCCATCAATGCACCCATGCTGCTAATCGATCCAGAGATTACCCAAGGAGCCGAACAGCTGGAGAAGGCCGCCTTGTCCGCCAGCAGGAAGAGATTGAGGAGCAATAGCGGCAGCGAGGACGAAAGTGATCGCCTGGTGCGCGAGGCTCTGTCCCAGTTCTACATACCGCCACAGCGCCTCATCTCCGCCATTGAGGAGTGTCCCCTGGATGTGGTTGGCTTGGGTATGGGAATGAATGTGAATGTGAA
3  TGTGGGAGGAATTAGTGGAATCGGTGGCATCGGAGGAGCTGCAGGCGCTGGCGTCGAAATGCCCGGAGGCAAACGGATGAAGCTGAATGACCATCACCATCTCAATCACCATCACCATTTGCACCATCATCTGGAGCTGGTCGATTTCGACATGAACCAAAACCAAAAGGATTTCGAGGTGATCATGGACGCCTTGAGGCTGGGAACGGCGACACCGCCGAGCGGCGCCAGCAGCGATTCTTGCGGACAGGCGGCGATGATGAGCGAGTCGGCCAGCGTGTTCCACAATCTGGTGGTCACCTCGTTGGAGACA
4 >sim;c1674_CG2865-PA_EXON
5 ATGACCTTGCCCACAAACACACACGCNTCTGCAAANNNNNNNNNNNGCGGCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCCACAAGANNNNGAGGATCAANNNNNNGGAGGCGAANNNNNGGCGCAGNNNNNGCATCAACAACACNTACTGCCGCCTGAACGACGAGNTGCGGCGCGAGAAGCAGATGCGCTACCTCCAGAATCTGCCCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
6  NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
7 >sim;md199_CG2865-PA_EXON
8 ATGACCTTGCCCACAAACACACACGCATCTGCAAACGACGGCGGCAGCGGCAACAACAACCACAGCAATATTAGCAGCAACAACAACAGCAGCAGCGACGAAGACTCGGACATGTTTGGACCACCCCGCTGCTCCCCGCCCATCGGCTATCACCATCACCGATCCCGTGTGCCCATGATCTCGCCAAAGCTGCGGCAGCGCGAGGAGCGCAAGCGGATCCTCCAGCTGTGCGCCCACAAGATGGAGAGGATCAAGGACTCGGAGGCGAACCTGCGGCGCAGCGTCTGCATCAACAACACCTACTGCCGCCTGAACGACGAGCTGCGGCGCGAGAAGCAGATGCGCTACCTCCAGAATCTGCCCAGNNNNNNNNACAGCGGCNNNNGCACCGAANTGGCGCGTGANAATCTCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGCAATANNNNNNNNNNNNNNGGCAAGCCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
9  NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
10 >sim;w501+f_CG2865-PA_EXON
11 ATGACCTTGCCCACAAACACACACGCATCTGCAAACGACGGCGGCAGCGGCAACAACAACCATAGCAATATTAGCAGCAACAACAACAGCAGCAGCGACGAAGACTCGGACATGTTTGGACCACCCCGCTGCTCCCCGCCCATCGGCTATCACCATCACCGTTCCCGTGTGCCCATGATCTCGCCAAAGCTGCGGCAGCGCGAGGAGCGCAAGCGGATCCTCCAGCTGTGCGCCCACAAGATGGAGAGGATCAAGGACTCGGAGGCGAACCTGCGGCGCAGCGTCTGCATCAACAACACCTACTGCCGCCTGAACGACGAGCTGCGGCGCGAGAAGCAGATGCGCTACCTCCAGAATCTGCCCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGCCGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTGAGGAGCNNNNNNNNNNNNNAGGACGANNNNNNNNNCCTGGTGCGCNNGGCTCTGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATCTCCGCCATNGAGGAGTGTCCCCNNNATGTGGTTGGCTTGGGTATGGGAANNNNNNNNNNNNNGAA
12  TGTGGGAGGAATCGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGCTGGCGTCNNNNNNNNNGGAGGCAAANNNNNNAAGCTGANNGACCATCNNNNNNNNNNNNNNNATCACCATTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACCAAAANNNNNNNNAGGTGATCNTGGACGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACA
13 >sim;sim_CG2865-PA_EXON
14 ATGACCTTGCCCACAAACACACACGCATCTGCAAACGACGGCGGCAGCGGCAACAACAACCATAGCAATATTAGCAGCAACAACAACAGCAGCAGCGACGAAGACTCGGACATGTTTGGACCACCCCGCTGCTCCCCGCCCATCGGCTATCACCATCACCGTTCCCGTGTGCCCATGATCTCGCCAAAGCTGCGGCAGCGCGAGGAGCGCAAGCGGATCCTCCAGCTGTGCGCCCACAAGATGGAGAGGATCAAGGACTCGGAGGCGAACCTGCGGCGCAGCGTCTGCATCAACAACACCTACTGCCGCCTGAACGACGAGCTGCGGCGCGAGAAGCAGATGCGCTACCTCCAGAATCTGCCCAGAACCAGCGACAGCGGTGCAAGCACCGAACTGGCGCGTGAGAATCTCTTCCAGCCGAACATGGACGACGCCAAGCCGGCCGGCAATAGCACTAGCAATAATATCAACGCCAACGGCAAGCCTTCATCCTCCTTTGTCGATGCCTTTGGCTCCTCAAACGGATCGTCGTCGGGTCGCGGCGGAATTTGCTCCCTGGAGAATCAACCGCCCGAGCGTCAGCAGCTGGGGACACCCGCTGGAGCCTCCGCTCCCGAGGCGGCCAATTCGGCGCCCCTTTCCGTTTCGGGCTCGGCATCGGAACGCGTGAATAACCGGAAGCGCCACCTGTCCAGCTGCAACTTGGTCAACGATCTGGAAATACTGGACAGGGAGCTGAGCGCCATCAATGCACCCATGCTGCTAATCGATCCGGAGATTACCCAGGGAGCCGAGCAGCTGGAGAAGGCCGCCTTGTCCGCCAGCAGGAAGAGATTGAGGAGCAATAGCAGCAGCGAGGACGAAAGTGATCGCCTGGTGCGCGAGGCTCTGTCCCAGTTCTACATACCGCCACAGCGCCTGATCTCCGCCATTGAGGAGTGTCCCCTGGATGTGGTTGGCTTGGGTATGGGAANNNNNNTGAATGTGAA
15  TGTGGGAGGAATCGGTGGAATCGGTAGCATCGGAGGAGCTGCAGGCGCTGGCGTCGAAATGCCCGGAGGCAAACGGATGAAGCTGAATGACCATCACCATCTCAACCACCATCACCATTTGCACCACCATCTGGAGCTGGTCGATTTCGACATGAACCAAAACCAAAAGGATTTCGAGGTGATCATGGACGCCTTGAGACTGGGAACGGCGACGCCGCCGAGCGGCGCCAGCAGCGATTCTTGCGGACAGGCGGCGATGATGAGCGAGTCGGCCAGCGTGTTCCACAATCTGGTGGTCACCTCGTTGGAGACA
16 >yak;CG2865-PA_EXON
17 ATGACCTTGCCCACAAACACACACGCATCTGCAAACGACGGCGGCAGCGGCAACAACAACCACAGCAACATTAACAATAACAACAGCAGCAGCAGCGACGAAGACTCGGACATGTTTGGACCACCCCGCTGCTCGCCGCCCATCGGCTACCACCATCACCGTTCCCGGGTGCCCATGATCTCCCCCAAGCTGCGACAGCGCGAGGAGCGCAAGCGGATCCTCCAGCTCTGCGCCCACAAGCTGGAGCGGATCAAGGACTCGGAGGCGAACCTGCGCCGCAGCGTCTGCATCAACAACACCTACTGCCGCCTCACCGACGAGCTGCGGCGCGAGAAGCAGATGCGCTACCTCCAGAATCTGCCCAGAACCAGCGACAGCGGCACAACCACCGAACTGGCGCGTGAGAATCTCTTCCAGCCGAACATGGACGATGCCAAGCCGGCCAGCAATAGTACTAGCAATAATATCAATGCCAACGGCAAGCCTTCAACCGCCTTCGCCGATGCCTTTGGCTCCTCAAACGGATCGTCGTCGGGTCGCGGTGGCATTTGCTCCCTGGAGAATCAGCCGCCCGATCGTCAGCAGCTGGGAACGCCCGCTGGAGCCTCCGCGCCCGAGGCGGCCAATTCGGCGCCACTTTCCGTTTCCGGTTCGGCATCGGAACGCGTGAATAACCGGAAACGTCACCTGTCCAGCTGCAATTTGGTCAACGATCTGGAGATACTGGACAGAGAACTGAGCGCCATCAATGCACCCATGCTGCTAATCGATCCGGAGATTACCCAAGGTGCCGAGCAGCTGGAGAAGGCGGCCTTGTCCGCCAGCAGGAAGAGATTGAGGAGCAATAGCAGCAGCGAGGACGAAAGTGATCGCTTGGTCCGCGAGGCTCTGTCCCAGTTCTACATACCGCCTCAGCGCCTGATCTCCGCCATCGAGGAGTGTCCCCTGGATGTGGTCGGCTTGGGTATGGGAATGAATGTGNNNNNNAA
18  TGTGGGAGGAATCGGTGGCATCAGTGGCATCGGAGGAGCTGCAGGCGCTGGCGTCGAAGTGTCCGGAAGCAAACGGATGAAGCTGAACGACCATCACCATCTCAACCACCATCACCATTTGCACCATCATCTGGAGCTGGTCGATTTCGATATGAACCAAAACCAAAAGGATTTCGAGGTGATCATGGACGCCTTGAGGCTGGGAACGCCGACGCCGCCGAGCGGCGCAAGCAGCGATTCTTGCGGACAGGCGGCAATGATGAGCGAGTCGGCCAGCGTTTTCCACAATCTGGTGGTCACCTCGTTGGAGACA