branch-1-6/t/SeqIO/tab.t

   1 # -*-Perl-*- Test Harness script for Bioperl
   2 # $Id$
   3
   4 use strict;
   5
   6 BEGIN {
   7         use lib '.';
   8     use Bio::Root::Test;
   9
  10     test_begin(-tests => 8);
  11
  12         use_ok('Bio::SeqIO::tab');
  13 }
  14
  15 my $verbose = test_debug();
  16
  17 my $io = Bio::SeqIO->new(-format => 'tab',
  18                                                                  -verbose => $verbose,
  19                                                                  -file => test_input_file('test.tab'));
  20 isa_ok($io, 'Bio::SeqIO');
  21
  22 while (my $seq = $io->next_seq) {
  23         ok ( $seq && defined $seq, 'seq is defined' ) ;
  24         is ( $seq->length, 358, 'check seq length'  ) ;
  25         like ($seq->display_id, qr/^roa\d_drome$/, 'check matching' );
  26 }