Merge branch 'master' of ssh://repo.or.cz/srv/git/OpenFOAM-1.6.x

STYLE: removed unused static variable

ENH: Reuse any existing zones.

ENH: correct error message

Removed superfluous line concerning sets and zones.

New solver: rhoPorousMRFPimpleFoam

Added compressibility support to MRFZone.
Required generalisation of the oneField concept.
Simple mixerVessel2D tutorial case supplied.

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Reverted some premature changes.

Merge branch 'master' of ssh://repo.or.cz/srv/git/OpenFOAM-1.6.x

BUG: removed old (redundant) link libraries from options file

Reverted temporary change.

ParaFoam Reader: Corrected ordering of the components of the symmetric tensor to suit VTK.
    Correction supplied by M. Olesen.

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Removed MC TVD scheme as the implementation is equivalent to the MUSCL scheme.

ENH: sample nearest cell, not cell that contains triangle centre.

This is much more robust and faster.

BUG: Checking for triangles not on any processor was incorrect.

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MULES limitation removed: sub-cycling time now supported on morphing meshes

Support for cell-volume interpolation during time sub-cycling now provided
and used in the MULES VoF solver to allow sub-cycling on morphing meshes.

ENH: use reference to faceCentres instead of copy

BUG: faceZones files not closed (writeEnd) and incorrect variables registered.

STYLE: typo in warning message

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BUG: Updated include libs for tutorial cases

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New BCs: nutkWallFunction (equivalent to nutWallFunction)
    mutkWallFunction (equivalent to mutWallFunction)
    for forward compatibility.

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ENH: Sampling on triSurfaceMesh

Is like a cuttingPlane but now with a triSurface.

Cleanup of some entries in dictionaries.

Cosmetic improvements.

rhoPimpleFoam: Added density predictor.

Improvement to the Courant number calculation.

Corrected order of graph arguments.

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Corrected header formatting.

ENH: Implement flux boundary condition as a gradient condition.

solidWallHeatFluxTemperature used to be based on fixedValue. Switching
to gradient improves convergence.

BUG: findBox needs treeBoundBox, not boundBox

BUG: removed space after backslash

Merge branch 'master' of ssh://repo.or.cz/srv/git/OpenFOAM-1.6.x

ENH: Use Greg's combination of zerogradient and fixedValue in temperature coupled bcs.

ENH: (yet) further restructuring of decomposition methods

ENH: Further restructuring of decomposition methods

Merge branch 'master' of ssh://repo.or.cz/srv/git/OpenFOAM-1.6.x

ENH: re-structured decomposition methods

ENH: re-structured decomposition methods

STYLE: fixed typo

ENH: Moved csr calculation into scotch.

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ENH: have dummy versions for thirdparty libraries

The dummyThirdParty tree builds libraries which are drop-in
(but non-functional) versions of some thirdparty libraries. This will
make it easier to ship binary versions without having to ship thirdparty packs.

BUG: fvMotionSolver/pointPatchFields which store p0, the initial
position of patch points.  Adding autoMap and rmap functions to
correctly handle p0 on decomposition and reconstruction.

multiRegionHeater tutorial: Changed to generate the split-mesh and fields at time 0 rather than 0.001.

Thermodynamics: Corrected the boundary condition for Cp.

ENH: Added sensible enthalpy variants of psi and rho thermo packages

ENH: Added new tutorial case for porousExplicitSourceReactingParcelFoam

- verticalChannel

ENH: Added new tutorial case for porousExplicitSourceReactingParcelFoam

ENH: Updated rhoPisoParcelFoam tutorial solver example

ENH: Updated reactingParcelFoam evaporationTest tutorial

ENH: Updated porousExplicitSourceReacingParcelFoam filter tutorial case

- Now uses sensible enthalpy thermo
- Now uses reacting multiphase physics
- Also specofy mass, momentum and energy sources

ENH: Updated coalChemistryFoam simplifiedSiwek tutoral case

- Now uses sensible enthalpy thermo
- Cloud input properties updated
- Energy source description updated

ENH: Updated reactingFoam counterFlowFlame2D tutorial case

ENH: Updated dieselFoam aachenBomb tutorial case

ENH: updated rhoReactingFoam

- Now uses sensible enthalpy thermo

ENH: Updated reactingFoam

- Now uses sensible enthalpy thermo

ENH: Updated dieselFoam

- Now uses sensible enthalpy thermo

ENH: updated dieselEngineFoam

- Now uses sensible enthalpy thermo

ENH: Updated reactingParcelFoam

- Now uses sensible enthalpy thermo

ENH: Updated porousExplicitSourceReactingParcelFoam

- usdated to employ sensible enthalpy thermo
- now uses reacting multiphase thermo physics
- using new field sources:
  - can specify additional mass, momentum and energy sources

ENH: Updated liquids

- added diffusivity function

ENH: Updated coalChemistryFoam to employ sensible enthalpy

ENH: Updated chemistry models

- Now use sensible enthalpy thermo
- Corrected calculation for heat release

ENH: Updated lagrangian/coalCombustion library

- Sections re-written
- updated I/O

ENH: Multiple updates for lagrangian/intermediate library

- Re-written large chunks of the code
- Updated I/O
- Updated patchInteraction models
- Updated thermo for evaporation
- Look-up table injection models overhauled/re-written

- see tutorials for examples of new usage

ENH: Updated lagrangian/molecularDynamics I/O

ENH: Updated lagrangian/dsmc I/O

ENH: Updated lagrangian/solidParticle I/O

ENH: Updates to lagrangian/dieselSpray library

- Updated for new I/O
- Updated for use with sensible enthalpy thermo

ENH: Multiple updates to lagrangian/basic library

- Updated cloud I/O
- Updated particle counter

ENH: Further updates for sensible enthalpy thermo

- Added rho-based sensible enthalpy thermo packages
- Re-worked fireFoam thermo and moved to main source tree

ENH: Overhaul/re-write of field sources

- New TimeActivatedExplicitSource<Type> and
- New TimeActivatedExplicitSourceList<Type>
- where Type = scalar, vector, sphericalTensor, syyTensor, tensor

ENH: Updated buoyantBoussinesqPisoFoam to employ RAS/LES turbulence modelling

sixDoFMotion:  Adding restraints and constraints to the motion of objects.

Renaming variables in dictionary to be more understandable:

Q -> orientation
v -> velocity
a -> acceleration
pi -> angularMomentum
tau -> torque
refCentreOfMass ->initialCentreOfMass

Adding initialOrientation variable.

smallPoolFire2D fireFoam tutorial: improved stability of the BCs.

boundaryLaunderSharma tutorial: Added nut file to specify appropriate BC to support the calculation of yPlus.

ENH: Added Low-Re nut/mut BCs

ENH: Updated Low-Re RAS models to employ auto-created nut/mut

- assigns boundary value to zero
- provides interface to yPlus() function, for, e.g. yPlusRAS utility

Merge branch 'master' of ssh://repo.or.cz/srv/git/OpenFOAM-1.6.x

bugfix: lagrangian/intermediate - clause in table integration not handled

BUG: If no processor*/constant a parallel run would search up and read the undecomposed points file.

Added a check for size.

BUG: CatmullRomSpline was missing from Make/files.

ENH: Automatically increase the time precision to make timeNames differ.

Before two timesteps could get the same timeName and start overwriting old results.

Merge branch 'master' of ssh://opencfd@repo.or.cz/srv/git/OpenFOAM-1.6.x

ENH: balancing before refinement

if locally number of cells > maxLocalCells will switch from
refinement followed by balancing to weighted balancing first. This will
avoid temporary huge imbalance if all cells to be refined are on one proc.

ENH: non-blocking transfer on mesh distribution.

Temporary backport of dev CompactListList and fvMeshDistribute.

Added compilation of new BCs.

AverageIOField: Corrected initialisation value.

ENH: allow parMetis as decomposition method.

STYLE: Corrected comment in header

Extraneous U in description of Darcy coefficient.
(see http://www.cfd-online.com/Forums/openfoam-bugs/72236-bug-porouszone-h.html)

expDirectionMixed BC: Deleted.

Legacy BC superceded

ENH: Have weighted decomposition.

All decomposition methods now take an additional scalarField which is
the weight per cell. For some of the decomposition methods (scotch,metis)
this gets converted to an integer so can have only limited values.

timeVaryingMappedPressureDirectedInletVelocityFvPatchVectorField: new BC.

Velocity inlet boundary condition for patches where the pressure is
specified. The inflow velocity is obtained from the flux with the
"inletDirection" direction mapped from a time/space-varying table.

AverageIOField: Changed the average value to be member data.