Extend mtop_lookup.h
commite6b82dfd6a8c9c253b4a05280ffebafedecb8014
authorBerk Hess <hess@kth.se>
Thu, 13 Oct 2016 12:28:36 +0000 (13 14:28 +0200)
committerBerk Hess <hess@kth.se>
Thu, 13 Oct 2016 20:13:38 +0000 (13 22:13 +0200)
tree281a1da94281adf0600a7425ca3fa860c2313b35
parent18879ec0959357108882a7551cba062e8f5534cc
Extend mtop_lookup.h

Added three lookup functions that will be used in the selection code.
Harmonized the functions by making all functions that look up
a single object return a reference.
Replaced uses of mtopGetAtomParameters() that only used the mass
(which is nearly all) by mtopGetAtomMass().

Change-Id: Ibbe9729502038cd1f863433ce03a80dc544e4003
src/gromacs/essentialdynamics/edsam.cpp
src/gromacs/gmxana/gmx_clustsize.cpp
src/gromacs/mdlib/mdatoms.cpp
src/gromacs/mdlib/qmmm.cpp
src/gromacs/mdlib/shellfc.cpp
src/gromacs/pulling/pull.cpp
src/gromacs/pulling/pull_rotation.cpp
src/gromacs/swap/swapcoords.cpp
src/gromacs/topology/mtop_lookup.h