Remove mdrun -compact
commitc81468d80dbbd33808b0ee9ccde67af0844ffaee
authorMark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
Thu, 26 Nov 2015 18:31:22 +0000 (26 19:31 +0100)
committerMark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
Thu, 3 Dec 2015 09:45:53 +0000 (3 10:45 +0100)
tree994ed45d10f84ee5b0996e0bfde58c8f8c0483d3
parente12d3810d648b2ab9eaac55637e2fde331a1e8b0
Remove mdrun -compact

This defaulted to true, and was otherwise always hard-coded to true in
print_ebin() when in eprNORMAL mode, and always hard-coded to false in
eprAVER mode. The data printed looks like it should always be in the
energy file, which is how we should approach analysis tasks that might
make use of the non-compact data if it was written in eprNORMAL mode.

Change-Id: I1b7912cc6e87712cf71854bcd18b00e9ad25a9be
src/gromacs/mdlib/integrator.h
src/gromacs/mdlib/mdebin.cpp
src/gromacs/mdlib/mdebin.h
src/gromacs/mdlib/minimize.cpp
src/gromacs/mdlib/tpi.cpp
src/programs/mdrun/md.cpp
src/programs/mdrun/mdrun.cpp
src/programs/mdrun/runner.cpp
src/programs/mdrun/runner.h