Vibration spectra from velocity ACF or Normal modes.
commit5cd759f24e237f2e90e88895e5f0c4d37d421ea4
authorDavid van der Spoel <spoel@xray.bmc.uu.se>
Tue, 28 Feb 2012 20:53:28 +0000 (28 21:53 +0100)
committerDavid van der Spoel <spoel@xray.bmc.uu.se>
Sat, 10 Mar 2012 14:06:54 +0000 (10 15:06 +0100)
treecbfbf3c4885936522b4d8372d819cd2b29b0ca1a
parent827065b9e9d817c5779490b0b6e24f2cb5a95283
Vibration spectra from velocity ACF or Normal modes.

The velocity autocorrelation function can be converted into
a vibrational spectrum by performing a fourier transform
and plotting the amplitude squared as a function of
frequency or wavenumber. This has now been automated in
g_velacc with the -os flag. Likewise, an option -os
has been added to the g_nmeig program to produce a spectrum
based on the harmonic approximation.

Change-Id: I7e3d669b9108e3a91856ff20688f6216a035bf4a
src/tools/gmx_nmeig.c
src/tools/gmx_velacc.c