add proper duplicate peptide merging to -grind; plus dup db label fix
commit00f3901d7b0cd76658f65ac12dbc464e527c84c7
authorMichael Coleman <mkc@stowers-institute.org>
Fri, 20 Apr 2007 21:54:52 +0000 (20 16:54 -0500)
committerMichael Coleman <mkc@stowers-institute.org>
Fri, 20 Apr 2007 21:54:52 +0000 (20 16:54 -0500)
tree26aa0b21121b6a922eb9d5eee6bbe910c07f49f6
parent7d2c201252de39594edcc1470c803c32491c7436
add proper duplicate peptide merging to -grind; plus dup db label fix

Duplicate peptides (same score (fuzzy), same peptide, same mass trace)
are now merged.  (The mass trace test might not be exacty correct, if
the items in the mass trace list could be generated in alternate
orders.)

Fixed a problem with detection of duplicate locus names in the
sequence databases.
TODO
cgreylag.cpp
cgreylag.hpp
cgreylag.i
greylag-grind.py
greylag-sqt.py