t/data/genomic-seq.mzef

   1  ENTER NAME OF THE SEQUENCE FILE (in single quotes)
   2 genomic-seq.fasta
   3  ENTER 1 FOR FORWARD, 2 FOR REVERSE
   4 1
   5  ENTER PRIOR PROBABILITY (suggesting .04)
   6 .04
   7  ENTER OVER LAPPING NUMBER (suggesting 0)
   8 0
   9  Internal coding exons predicted by MZEF
  10  File_Name: genomic-se  Sequence_length: 168628  G+C_content:  0.492
  11   Coordinates    P    Fr1   Fr2   Fr3  Orf   3ss   Cds   5ss
  12   3192 -  3569 0.965 0.393 0.636 0.377 212 0.575 0.545 0.501
  13   4476 -  4728 0.885 0.436 0.396 0.593 221 0.521 0.540 0.586
  14   5744 -  6157 0.997 0.571 0.443 0.394 122 0.573 0.535 0.649
  15   8751 -  8800 0.553 0.368 0.428 0.627 221 0.515 0.559 0.547
  16  13638 - 13818 0.689 0.624 0.563 0.402 112 0.561 0.592 0.499
  17  35165 - 35248 0.774 0.400 0.344 0.488 121 0.545 0.461 0.642
  18  75943 - 76047 1.000 0.711 0.398 0.463 122 0.545 0.619 0.555
  19  76229 - 76288 1.000 0.359 0.712 0.511 211 0.548 0.601 0.691
  20  78250 - 78453 0.992 0.596 0.404 0.427 112 0.567 0.537 0.566
  21  78980 - 79093 1.000 0.395 0.660 0.354 111 0.521 0.569 0.658
  22  79333 - 79467 0.997 0.648 0.407 0.372 122 0.511 0.559 0.640
  23  80173 - 80290 0.995 0.587 0.341 0.395 122 0.565 0.506 0.651
  24  82589 - 82857 0.996 0.603 0.334 0.402 122 0.532 0.531 0.555
  25  83689 - 83887 1.000 0.703 0.376 0.480 122 0.541 0.605 0.412
  26  84017 - 84126 0.996 0.627 0.395 0.445 112 0.514 0.564 0.562
  27  84303 - 84484 0.936 0.356 0.411 0.543 221 0.529 0.508 0.571
  28  85346 - 85535 0.904 0.422 0.656 0.421 112 0.535 0.577 0.562
  29  85666 - 85841 0.970 0.426 0.420 0.592 221 0.581 0.552 0.532
  30  96381 - 96446 0.960 0.389 0.351 0.560 221 0.490 0.503 0.657
  31 115714 -115756 0.508 0.509 0.504 0.381 112 0.529 0.537 0.611
  32 125505 -125588 0.980 0.400 0.383 0.641 121 0.536 0.538 0.515
  33 135080 -135131 0.540 0.630 0.571 0.413 112 0.482 0.586 0.517
  34 147055 -147214 0.914 0.436 0.393 0.577 221 0.498 0.540 0.619