t/data/dcr1_sp.WUBLASTP

   1 BLASTP 2.0MP-WashU [04-May-2006] [linux26-x64-I32LPF64 2006-05-10T17:22:28]
   2
   3 Copyright (C) 1996-2006 Washington University, Saint Louis, Missouri USA.
   4 All Rights Reserved.
   5
   6 Reference:  Gish, W. (1996-2006) http://blast.wustl.edu
   7
   8 Query=  Celegans_dcr1
   9         (1845 letters)
  10
  11 Database:  swissprot
  12            353,658 sequences; 132,868,552 total letters.
  13 Searching....10....20....30....40....50....60....70....80....90....100% done
  14
  15                                                                      Smallest
  16                                                                        Sum
  17                                                               High  Probability
  18 Sequences producing High-scoring Segment Pairs:              Score  P(N)      N
  19
  20 sp|P34529.2|DCR1_CAEEL RecName: Full=Endoribonuclease dcr-1   9560  0.        1
  21 sp|Q9VCU9.1|DCR1_DROME RecName: Full=Endoribonuclease Dcr...  1792  1.5e-232  3
  22 sp|Q9UPY3.2|DICER_HUMAN RecName: Full=Endoribonuclease Di...  2152  6.4e-223  1
  23 sp|Q8R418.2|DICER_MOUSE RecName: Full=Endoribonuclease Di...  2120  1.6e-219  1
  24 sp|P84634.1|DCL4_ARATH RecName: Full=Dicer-like protein 4      471  8.6e-72   5
  25 sp|Q7S8J7.1|DCL1_NEUCR RecName: Full=Dicer-like protein 1...   505  3.0e-69   6
  26 sp|A4RKC3.2|DCL1_MAGGR RecName: Full=Dicer-like protein 1...   481  3.5e-69   6
  27 sp|Q0CW42.2|DCL1_ASPTN RecName: Full=Dicer-like protein 1...   464  4.8e-65   6
  28 sp|Q1DKI1.2|DCL1_COCIM RecName: Full=Dicer-like protein 1...   498  8.4e-64   6
  29 sp|A2RAF3.2|DCL1_ASPNC RecName: Full=Dicer-like protein 1...   466  5.3e-62   5
  30 sp|Q09884.1|DCR1_SCHPO RecName: Full=Protein Dicer; AltNa...   415  7.7e-61   4
  31 sp|A1CBC9.2|DCL1_ASPCL RecName: Full=Dicer-like protein 1...   428  1.2e-60   6
  32 sp|A1DE13.1|DCL1_NEOFI RecName: Full=Dicer-like protein 1...   457  1.6e-60   6
  33 sp|Q2VF19.1|DCL1_CRYPA RecName: Full=Dicer-like protein 1...   465  4.2e-60   4
  34 sp|Q0UI93.2|DCL1_PHANO RecName: Full=Dicer-like protein 1...   490  3.8e-59   5
  35 sp|Q4WVE3.3|DCL1_ASPFU RecName: Full=Dicer-like protein 1...   466  4.8e-59   6
  36 sp|Q2U6C4.2|DCL1_ASPOR RecName: Full=Dicer-like protein 1...   474  8.5e-58   4
  37 sp|Q2UNX5.1|DCL2_ASPOR RecName: Full=Dicer-like protein 2...   396  1.0e-53   5
  38 sp|Q4WA22.2|DCL2_ASPFU RecName: Full=Dicer-like protein 2...   369  1.7e-51   5
  39
  40
  41 >sp|P34529.2|DCR1_CAEEL RecName: Full=Endoribonuclease dcr-1
  42         Length = 1845
  43
  44  Score = 9560 (3370.3 bits), Expect = 0., P = 0.
  45  Identities = 1845/1845 (100%), Positives = 1845/1845 (100%)
  46  Links = (1)
  47
  48 Query:     1 MVRVRADLQCFNPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQ 60
  49              MVRVRADLQCFNPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQ
  50 Sbjct:     1 MVRVRADLQCFNPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQ 60
  51
  52 Query:    61 GGKRAFFVVEKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVI 120
  53              GGKRAFFVVEKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVI
  54 Sbjct:    61 GGKRAFFVVEKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVI 120
  55
  56 Query:   121 TAQCLLDLIRHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLT 180
  57              TAQCLLDLIRHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLT
  58 Sbjct:   121 TAQCLLDLIRHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLT 180
  59
  60 Query:   181 ASLIKAKVAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLG 240
  61              ASLIKAKVAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLG
  62 Sbjct:   181 ASLIKAKVAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLG 240
  63
  64 Query:   241 IPNFDTVIEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQ 300
  65              IPNFDTVIEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQ
  66 Sbjct:   241 IPNFDTVIEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQ 300
  67
  68 Query:   301 VWEKELGKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIR 360
  69              VWEKELGKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIR
  70 Sbjct:   301 VWEKELGKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIR 360
  71
  72 Query:   361 LFEILETFNPEFQKERMKLEKAEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPD 420
  73              LFEILETFNPEFQKERMKLEKAEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPD
  74 Sbjct:   361 LFEILETFNPEFQKERMKLEKAEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPD 420
  75
  76 Query:   421 YVVGASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDR 480
  77              YVVGASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDR
  78 Sbjct:   421 YVVGASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDR 480
  79
  80 Query:   481 PLDMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKDTAAYCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVT 540
  81              PLDMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKDTAAYCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVT
  82 Sbjct:   481 PLDMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKDTAAYCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVT 540
  83
  84 Query:   541 KYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELDDNLLPKGRESI 600
  85              KYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELDDNLLPKGRESI
  86 Sbjct:   541 KYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELDDNLLPKGRESI 600
  87
  88 Query:   601 AKLLEHIDEEPDEYAPGIAAKVGSSKRKQLYDKKIARALNESFVEADKECFIYAFELERF 660
  89              AKLLEHIDEEPDEYAPGIAAKVGSSKRKQLYDKKIARALNESFVEADKECFIYAFELERF
  90 Sbjct:   601 AKLLEHIDEEPDEYAPGIAAKVGSSKRKQLYDKKIARALNESFVEADKECFIYAFELERF 660
  91
  92 Query:   661 REAELTLNPKRRKFEDPFNYEYCFGFLSAKEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKKTTV 720
  93              REAELTLNPKRRKFEDPFNYEYCFGFLSAKEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKKTTV
  94 Sbjct:   661 REAELTLNPKRRKFEDPFNYEYCFGFLSAKEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKKTTV 720
  95
  96 Query:   721 TAAQLQEIQLFHNYLFTQVLQMCKTGNLEFDGTSNAPLNTLIVPLNKRKDDMSYTINMKY 780
  97              TAAQLQEIQLFHNYLFTQVLQMCKTGNLEFDGTSNAPLNTLIVPLNKRKDDMSYTINMKY
  98 Sbjct:   721 TAAQLQEIQLFHNYLFTQVLQMCKTGNLEFDGTSNAPLNTLIVPLNKRKDDMSYTINMKY 780
  99
 100 Query:   781 VSEVVANMENMPRIPKDEVRRQYKFNAEDYKDAIVMPWYRNLEQPVFYYVAEILPEWRPS 840
 101              VSEVVANMENMPRIPKDEVRRQYKFNAEDYKDAIVMPWYRNLEQPVFYYVAEILPEWRPS
 102 Sbjct:   781 VSEVVANMENMPRIPKDEVRRQYKFNAEDYKDAIVMPWYRNLEQPVFYYVAEILPEWRPS 840
 103
 104 Query:   841 SKFPDTHFETFNEYFIKKYKLEIYDQNQSLLDVDFTSTRLNLLQPRIQNQPRRSRTVSNS 900
 105              SKFPDTHFETFNEYFIKKYKLEIYDQNQSLLDVDFTSTRLNLLQPRIQNQPRRSRTVSNS
 106 Sbjct:   841 SKFPDTHFETFNEYFIKKYKLEIYDQNQSLLDVDFTSTRLNLLQPRIQNQPRRSRTVSNS 900
 107
 108 Query:   901 STSNIPQASASDSKESNTSVPHSSQRQILVPELMDIHPISATLWNVIAALPSIFYRVNQL 960
 109              STSNIPQASASDSKESNTSVPHSSQRQILVPELMDIHPISATLWNVIAALPSIFYRVNQL
 110 Sbjct:   901 STSNIPQASASDSKESNTSVPHSSQRQILVPELMDIHPISATLWNVIAALPSIFYRVNQL 960
 111
 112 Query:   961 LLTDELRETILVKAFGKEKTKLDDNVEWNSLAYATEYEEKQTIIVKKIQQLRDLNQKSIE 1020
 113              LLTDELRETILVKAFGKEKTKLDDNVEWNSLAYATEYEEKQTIIVKKIQQLRDLNQKSIE
 114 Sbjct:   961 LLTDELRETILVKAFGKEKTKLDDNVEWNSLAYATEYEEKQTIIVKKIQQLRDLNQKSIE 1020
 115
 116 Query:  1021 DQERETRENDKIDDGEELFNIGVWDPEEAVRIGVEISSRDDRMDGEDQDTVGLTQGLHDG 1080
 117              DQERETRENDKIDDGEELFNIGVWDPEEAVRIGVEISSRDDRMDGEDQDTVGLTQGLHDG
 118 Sbjct:  1021 DQERETRENDKIDDGEELFNIGVWDPEEAVRIGVEISSRDDRMDGEDQDTVGLTQGLHDG 1080
 119
 120 Query:  1081 NISDEDDELPFVMHDYTARLTSNRNGIGAWSGSESIVPSGWGDWDGPEPDNSPMPFQILG 1140
 121              NISDEDDELPFVMHDYTARLTSNRNGIGAWSGSESIVPSGWGDWDGPEPDNSPMPFQILG
 122 Sbjct:  1081 NISDEDDELPFVMHDYTARLTSNRNGIGAWSGSESIVPSGWGDWDGPEPDNSPMPFQILG 1140
 123
 124 Query:  1141 GPGGLNVQALMADVGRVFDPSTASSSLSQTVQESTVSPPKQLTKEEEQFKKLQNDLLKQA 1200
 125              GPGGLNVQALMADVGRVFDPSTASSSLSQTVQESTVSPPKQLTKEEEQFKKLQNDLLKQA
 126 Sbjct:  1141 GPGGLNVQALMADVGRVFDPSTASSSLSQTVQESTVSPPKQLTKEEEQFKKLQNDLLKQA 1200
 127
 128 Query:  1201 KERLEALEMSEDMEKPRRLEDTVNLEDYGDDQENQEDENTPTNFPKTIDEEIEELSIGAR 1260
 129              KERLEALEMSEDMEKPRRLEDTVNLEDYGDDQENQEDENTPTNFPKTIDEEIEELSIGAR
 130 Sbjct:  1201 KERLEALEMSEDMEKPRRLEDTVNLEDYGDDQENQEDENTPTNFPKTIDEEIEELSIGAR 1260
 131
 132 Query:  1261 KKQEIDDNAAKTDVLERENCEVLPVAINEKSRSFSFEKESKAINGRLIRQRSEEYVSHID 1320
 133              KKQEIDDNAAKTDVLERENCEVLPVAINEKSRSFSFEKESKAINGRLIRQRSEEYVSHID
 134 Sbjct:  1261 KKQEIDDNAAKTDVLERENCEVLPVAINEKSRSFSFEKESKAINGRLIRQRSEEYVSHID 1320
 135
 136 Query:  1321 SDIGLGVSPCLLLTALTTSNAADGMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSF 1380
 137              SDIGLGVSPCLLLTALTTSNAADGMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSF
 138 Sbjct:  1321 SDIGLGVSPCLLLTALTTSNAADGMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSF 1380
 139
 140 Query:  1381 ARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQLIVANKFDAHDSWLPPCYIPTCDFKAPNTDDAEEKDNE 1440
 141              ARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQLIVANKFDAHDSWLPPCYIPTCDFKAPNTDDAEEKDNE
 142 Sbjct:  1381 ARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQLIVANKFDAHDSWLPPCYIPTCDFKAPNTDDAEEKDNE 1440
 143
 144 Query:  1441 IERILDGQVIEEKPENKTGWDIGGDVSKSTTDGIETITFPKQARVGNDDISPLPYNLLTQ 1500
 145              IERILDGQVIEEKPENKTGWDIGGDVSKSTTDGIETITFPKQARVGNDDISPLPYNLLTQ
 146 Sbjct:  1441 IERILDGQVIEEKPENKTGWDIGGDVSKSTTDGIETITFPKQARVGNDDISPLPYNLLTQ 1500
 147
 148 Query:  1501 QHISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSDVPSPLLRFIDTPT 1560
 149              QHISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSDVPSPLLRFIDTPT
 150 Sbjct:  1501 QHISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSDVPSPLLRFIDTPT 1560
 151
 152 Query:  1561 NPNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNRVTGCYQRLEFLG 1620
 153              NPNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNRVTGCYQRLEFLG
 154 Sbjct:  1561 NPNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNRVTGCYQRLEFLG 1620
 155
 156 Query:  1621 DAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCPGLYHM 1680
 157              DAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCPGLYHM
 158 Sbjct:  1621 DAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCPGLYHM 1680
 159
 160 Query:  1681 IEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESVAGAIYLDSG 1740
 161              IEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESVAGAIYLDSG
 162 Sbjct:  1681 IEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESVAGAIYLDSG 1740
 163
 164 Query:  1741 RNLDTTWQVIFHMMRGTIELCCANPPRSPIRELMEFEQSKVRFSKMERILESGKVRVTVE 1800
 165              RNLDTTWQVIFHMMRGTIELCCANPPRSPIRELMEFEQSKVRFSKMERILESGKVRVTVE
 166 Sbjct:  1741 RNLDTTWQVIFHMMRGTIELCCANPPRSPIRELMEFEQSKVRFSKMERILESGKVRVTVE 1800
 167
 168 Query:  1801 VVNNMRFTGMGRNYRIAKATAAKRALKYLHQIEQQRRQSPSLTTV 1845
 169              VVNNMRFTGMGRNYRIAKATAAKRALKYLHQIEQQRRQSPSLTTV
 170 Sbjct:  1801 VVNNMRFTGMGRNYRIAKATAAKRALKYLHQIEQQRRQSPSLTTV 1845
 171
 172
 173 >sp|Q9VCU9.1|DCR1_DROME RecName: Full=Endoribonuclease Dcr-1; Short=Protein
 174             dicer-1
 175         Length = 2249
 176
 177  Score = 1792 (635.9 bits), Expect = 1.5e-232, Sum P(3) = 1.5e-232
 178  Identities = 522/1454 (35%), Positives = 748/1454 (51%)
 179  Links = 2-3-(1)
 180
 181 Query:   513 YCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQM 572
 182              YC++LPSD FT+L    +    E  GVT +   L LPINSP+KH IV   PMP +  A+
 183 Sbjct:   832 YCARLPSDTFTKLTALWRCTRNERAGVTLFQYTLRLPINSPLKHDIV-GLPMPTQTLARR 890
 184
 185 Query:   573 AVALEACRQLHLEGELDDNLLPKGRESIAKL---LEHIDEEP-DEYAPGIA--AKVGSSK 626
 186                AL+AC +LH  GELDD L P G+E    L    E  + EP DE    ++   + G++K
 187 Sbjct:   891 LAALQACVELHRIGELDDQLQPIGKEGFRALEPDWECFELEPEDEQIVQLSDEPRPGTTK 950
 188
 189 Query:   627 RKQLYDKKIARALNESFVEADKECFIYAFELERFREAELTLNPKRRKFEDPFNYEYCFGF 686
 190              R+Q Y K+IA    +    A   C++Y  +L          N + RK   P + +  FG
 191 Sbjct:   951 RRQYYYKRIASEFCDCRPVAGAPCYLYFIQLTLQCPIPEEQNTRGRKIYPPEDAQQGFGI 1010
 192
 193 Query:   687 LSAKEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKKTTVTAAQLQEIQLFHNYLFTQVLQMCKTG 746
 194              L+ K IPK+  F +F R G +KV L +A ++  +T+ Q+  I  F NY FT VL++ K
 195 Sbjct:  1011 LTTKRIPKLSAFSIFTRSGEVKVSLELAKERVILTSEQIVCINGFLNYTFTNVLRLQKFL 1070
 196
 197 Query:   747 NL-EFDGTSNAPLNTLIVPLNKRKDDMSYTINMKYVSEVVANMENMPRIPKDEVRRQYKF 805
 198               L + D T N      IVP  K      + I+ +++  + AN   MPR   DE R+   F
 199 Sbjct:  1071 MLFDPDSTENC---VFIVPTVKAPAGGKH-IDWQFLELIQANGNTMPRAVPDEERQAQPF 1126
 200
 201 Query:   806 NAEDYKDAIVMPWYRNLEQPVFYYVAEILPEWRPSSKFPDTHFETFNEYFIKKYKLEIYD 865
 202              + + ++DA+VMPWYRN +QP ++YVAEI P   P S FP  ++ TF  Y++ KY L I +
 203 Sbjct:  1127 DPQRFQDAVVMPWYRNQDQPQYFYVAEICPHLSPLSCFPGDNYRTFKHYYLVKYGLTIQN 1186
 204
 205 Query:   866 QNQSLLDVDFTSTRLNLLQPRIQNQPRRSRTVSNSSTSNIPQASASDSKESNTSVPHSSQ 925
 206               +Q LLDVD TS RLN L PR  N+   +   S+  T          +K  N       Q
 207 Sbjct:  1187 TSQPLLDVDHTSARLNFLTPRYVNRKGVALPTSSEETKR--------AKRENLE-----Q 1233
 208
 209 Query:   926 RQILVPELMDIHPISATLWNVIAALPSIFYRVNQLLLTDELRETILVK-AFGKEKTKLDD 984
 210              +QILVPEL  +HP  A+LW     LP I YR+N LLL D++R+ +      G+++ + D+
 211 Sbjct:  1234 KQILVPELCTVHPFPASLWRTAVCLPCILYRINGLLLADDIRKQVSADLGLGRQQIE-DE 1292
 212
 213 Query:   985 NVEWNSLAYATEYEE--KQTIIVKKIQQLRD--LNQKSIEDQERE-TRENDKID-DGEEL 1038
 214              + EW  L +     E  K++   K+ + L+D  +N K + D E++ T E  ++D D ++
 215 Sbjct:  1293 DFEWPMLDFGWSLSEVLKKSRESKQKESLKDDTINGKDLADVEKKPTSEETQLDKDSKD- 1351
 216
 217 Query:  1039 FNIGVWDPEEAVRIGVEISSRDDRMDGEDQDTVGL-TQGLHDGNIS------DEDD--EL 1089
 218                    D  E   I + I   +   + +D   +G  +  + D   S      DEDD   L
 219 Sbjct:  1352 ------DKVEKSAIELIIEGEEKLQEADDFIEIGTWSNDMADDIASFNQEDDDEDDAFHL 1405
 220
 221 Query:  1090 PFV-----MHDYTARLTSNR-----NGIGAWSGSESIV--PSGWGDWDGP-EP------- 1129
 222              P +       D   R  S       NG   + G +S      G G   GP +P
 223 Sbjct:  1406 PVLPANVKFCDQQTRYGSPTFWDVSNGESGFKGPKSSQNKQGGKGKAKGPAKPTFNYYDS 1465
 224
 225 Query:  1130 DNS-PMPFQILGGPGGLNVQA--LMADVGRVFDPSTASSSLSQTVQES-TVSPPKQLTKE 1185
 226              DNS    +      G LN       +D   V D   A      +  E+ T+   +++ K
 227 Sbjct:  1466 DNSLGSSYDDDDNAGPLNYMHHNYSSDDDDVADDIDAGRIAFTSKNEAETIETAQEVEKR 1525
 228
 229 Query:  1186 EEQFKKLQ----NDL-LKQAKERLEALEMS-EDMEKPR--RLEDTV-----NLEDYG--- 1229
 230              ++Q   +Q    N+   +Q K  L       ED ++P   R E+++      +E  G
 231 Sbjct:  1526 QKQLSIIQATNANERQYQQTKNLLIGFNFKHEDQKEPATIRYEESIAKLKTEIESGGMLV 1585
 232
 233 Query:  1230 -DDQEN--QEDENTPTNFPKT------------IDEEIEELSIGARKKQEIDD----NAA 1270
 234                DQ+   +  +       K             ++E++    +G R++  + D    NA
 235 Sbjct:  1586 PHDQQLVLKRSDAAEAQVAKVSMMELLKQLLPYVNEDVLAKKLGDRRELLLSDLVELNAD 1645
 236
 237 Query:  1271 KTDVLERENCEVLPVA-------------INEKSRSFSFEK-------ESKAINGRLIR- 1309
 238                   E+E   V+                ++EK     +E+        +KAI   ++
 239 Sbjct:  1646 WVARHEQETYNVMGCGDSFDNYNDHHRLNLDEKQLKLQYERIEIEPPTSTKAITSAILPA 1705
 240
 241 Query:  1310 ----QRSEEYVSHIDSDIGLGVSPCLLLTALTTSNAADGMSLERFETIGDSFLKFATTDY 1365
 242                   R  + V H       G SP ++L ALT SNA DG++LER ETIGDSFLK+A T Y
 243 Sbjct:  1706 GFSFDRQPDLVGHP------GPSPSIILQALTMSNANDGINLERLETIGDSFLKYAITTY 1759
 244
 245 Query:  1366 LYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQLIVANKFDAHDSWLPPCY-IPT- 1423
 246              LY T  + HEGKLS  RSK+V+N NLYRLG++  + + ++A KF+ HD+WLPPCY +P
 247 Sbjct:  1760 LYITYENVHEGKLSHLRSKQVANLNLYRLGRRKRLGEYMIATKFEPHDNWLPPCYYVPKE 1819
 248
 249 Query:  1424 -----CDFKAPNTDDAEEKDN-EIERILDGQVIEEKPE--NKTGWDIGGDVSKSTTDGIE 1475
 250                    + K P T   +  D  +I+ +   Q+ E   E  +  G +  G       D
 251 Sbjct:  1820 LEKALIEAKIP-THHWKLADLLDIKNLSSVQICEMVREKADALGLEQNGGAQNGQLDDSN 1878
 252
 253 Query:  1476 TITFPKQARVGNDDISPLPYNLLTQQHISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWM 1535
 254                         ND    +PYNL++Q  I DKSIAD VEALIG +L+  GP   L  M W+
 255 Sbjct:  1879 DSC--------NDFSCFIPYNLVSQHSIPDKSIADCVEALIGAYLIECGPRGALLFMAWL 1930
 256
 257 Query:  1536 GLKVI----QKD---QKSDVPS---PLLRFIDT-----PTNPNASLNFLNNLWQQFQ--- 1577
 258              G++V+    Q D   Q+  +P    P    + T     PT  +  L+F  N  ++
 259 Sbjct:  1931 GVRVLPITRQLDGGNQEQRIPGSTKPNAENVVTVYGAWPTPRSPLLHFAPNATEELDQLL 1990
 260
 261 Query:  1578 --FTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNRVTGCYQRLEFLGDAVLDYMITRYLFED 1635
 262                F + EE +GY+F++R+YL+QA THASY  NR+T CYQRLEFLGDAVLDY+ITR+L+ED
 263 Sbjct:  1991 SGFEEFEESLGYKFRDRSYLLQAMTHASYTPNRLTDCYQRLEFLGDAVLDYLITRHLYED 2050
 264
 265 Query:  1636 SRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCPGLYHMIEKFVKLCSERNFDT 1695
 266               RQ+SPG LTDLRSALVNNTIFASLAV+  F K F  + PGL  +I++FV++  E
 267 Sbjct:  2051 PRQHSPGALTDLRSALVNNTIFASLAVRHGFHKFFRHLSPGLNDVIDRFVRIQQENG--- 2107
 268
 269 Query:  1696 NFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESVAGAIYLDSGRNLDTTWQVIFHMMR 1755
 270              +  +E Y + +EEE D+   ED+EVPKA+GD+FES+AGAI+LDS  +LD  W V  +MM
 271 Sbjct:  2108 HCISEEYYLLSEEECDDA--EDVEVPKALGDVFESIAGAIFLDSNMSLDVVWHVYSNMMS 2165
 272
 273 Query:  1756 GTIELCCANPPRSPIRELMEFEQSKVRFSKMERILESGKVRVTVEVVNNMRFTGMGRNYR 1815
 274                IE    + P+SPIREL+E E    +F K E++ +  +VRVTV+V     F G+GRNYR
 275 Sbjct:  2166 PEIEQFSNSVPKSPIRELLELEPETAKFGKPEKLADGRRVRVTVDVFCKGTFRGIGRNYR 2225
 276
 277 Query:  1816 IAKATAAKRALKYL 1829
 278              IAK TAAK AL+ L
 279 Sbjct:  2226 IAKCTAAKCALRQL 2239
 280
 281  Score = 253 (94.1 bits), Expect = 1.5e-232, Sum P(3) = 1.5e-232
 282  Identities = 95/376 (25%), Positives = 169/376 (44%)
 283  Links = (2)-3-1
 284
 285 Query:    11 FNPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQGGKRAFFVVE 70
 286              F PRD+QVELL  A ++NTI+ LG  S K FIA+ LL+E   +       G    +   E
 287 Sbjct:    15 FTPRDFQVELLATAYERNTIICLGHRSSKEFIALKLLQELSRRARR---HGRVSVYLSCE 71
 288
 289 Query:    71 KVNLVEQQAIHIEV-H-TSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDL 128
 290                   E  +I+  + H T  +V Q          D +   D     +HV ++  +  L L
 291 Sbjct:    72 VGTSTEPCSIYTMLTHLTDLRVWQEQP-------DMQIPFDHCWTDYHVSILRPEGFLYL 124
 292
 293 Query:   129 IRHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLTASLIKAKV 188
 294              +    L +  + +++ ++CH +   Q   R +  ++ +       PR+LGL   L  A
 295 Sbjct:   125 LETRELLLSSVELIVLEDCHDSAVYQR-IRPLFENHIMPAPPADRPRILGLAGPLHSAGC 183
 296
 297 Query:   189 APEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTVI 248
 298                ++L   L  LE ++   IETASD+V++ +Y ++P+E ++ C  FE+  L +   D +
 299 Sbjct:   184 ELQQLSAMLATLEQSVLCQIETASDIVTVLRYCSRPHEYIVQCAPFEMDELSLVLADVLN 243
 300
 301 Query:   249 E----IFDETVA--FVNTTTEFHPDL-DL-DPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQ 300
 302                   + D       +  T +F  +L D+ DP+    + + +   V  ++GPW   R A
 303 Sbjct:   244 THKSFLLDHRYDPYEIYGTDQFMDELKDIPDPKVDPLNVINSLLVVLHEMGPWCTQRAAH 303
 304
 305 Query:   301 VWEKELGKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKK-----IKSIEALRPYVP 355
 306               +  +  + +K +   ++      +  T++I +  L E    +       S + +  Y
 307 Sbjct:   304 HFY-QCNEKLKVKTPHERHYLLYCLVSTALIQLYSLCEHAFHRHLGSGSDSRQTIERYSS 362
 308
 309 Query:   356 QRVIRLFEILETFNPE 371
 310               +V RL + L  F PE
 311 Sbjct:   363 PKVRRLLQTLRCFKPE 378
 312
 313  Score = 238 (88.8 bits), Expect = 1.5e-232, Sum P(3) = 1.5e-232
 314  Identities = 51/125 (40%), Positives = 76/125 (60%)
 315  Links = 2-(3)-1
 316
 317 Query:   382 AEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPDYVVG-ASGRNLASSDSQGLHK 440
 318              ++ L A+I+ +Q + A  L  ++  I   +P  KF+   Y     +       +++  H+
 319 Sbjct:   490 SDTLCALIYCNQNHTARVLFELLAEISRRDPDLKFLRCQYTTDRVADPTTEPKEAELEHR 549
 320
 321 Query:   441 RQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPLDMRSYVQSKGRARRAGSR 500
 322              RQ EVL+RF  ++ N LI TSVLEEG+DV +CNLV+++D P   RSYVQ KGRAR A +
 323 Sbjct:   550 RQEEVLKRFRMHDCNVLIGTSVLEEGIDVPKCNLVVRWDPPTTYRSYVQCKGRARAAPAY 609
 324
 325 Query:   501 YVITV 505
 326              +VI V
 327 Sbjct:   610 HVILV 614
 328
 329  Score = 44 (20.5 bits), Expect = 4.4e-212, Sum P(3) = 4.4e-212
 330  Identities = 10/34 (29%), Positives = 17/34 (50%)
 331  Links = 2-(4)-1
 332
 333 Query:   580 RQLHLEGELDDNLLPKGRESIAKLLEHIDEEPDE 613
 334              R  H   + D N L    ES  ++++ +D+ P E
 335 Sbjct:   389 RMRHQVDQADFNRLSHTLESKCRMVDQMDQPPTE 422
 336
 337
 338 >sp|Q9UPY3.2|DICER_HUMAN RecName: Full=Endoribonuclease Dicer; AltName:
 339             Full=Helicase with RNase motif; Short=Helicase MOI
 340         Length = 1912
 341
 342  Score = 2152 (762.6 bits), Expect = 6.4e-223, P = 6.4e-223
 343  Identities = 706/2058 (34%), Positives = 1011/2058 (49%)
 344  Links = (1)
 345
 346 Query:    11 FNPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQGGKRAFFVVE 70
 347              + PR YQVELL+ A   NTIV L TGSGKTFIAVLL KE   Q+     + GKR  F+V
 348 Sbjct:    32 YTPRKYQVELLEAALDHNTIVCLNTGSGKTFIAVLLTKELSYQIRGDFSRNGKRTVFLVN 91
 349
 350 Query:    71 KVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDLIR 130
 351                N V QQ   +  H+  KVG+      +  W +KE+ +Q   +H V+++T    L++++
 352 Sbjct:    92 SANQVAQQVSAVRTHSDLKVGEYSNLEVNASW-TKERWNQEFTKHQVLIMTCYVALNVLK 150
 353
 354 Query:   131 HAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLTASLIKAKVAP 190
 355              + YL + D+ +L+FDECH A+   HPYR IM   KL +     PR+LGLTAS++  K  P
 356 Sbjct:   151 NGYLSLSDINLLVFDECHLAI-LDHPYREIM---KLCENCPSCPRILGLTASILNGKCDP 206
 357
 358 Query:   191 EKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTVIEI 250
 359              E+L E+++KLE  + S  ETA+DLV L +Y ++P E+V+ C  F     G+  ++ ++
 360 Sbjct:   207 EELEEKIQKLEKILKSNAETATDLVVLDRYTSQPCEIVVDCGPFTDRS-GL--YERLLME 263
 361
 362 Query:   251 FDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEKELGKII 310
 363               +E + F+N         + D     K  L   RAV   LGPW A + A +  +EL K I
 364 Sbjct:   264 LEEALNFINDCNISVHSKERDSTLISKQILSDCRAVLVVLGPWCADKVAGMMVRELQKYI 323
 365
 366 Query:   311 KSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEM------------KKIKSIEALRPYVPQRV 358
 367              K +   +   +FL    T +  I  L E               K IK +E LR Y P
 368 Sbjct:   324 KHEQ-EELHRKFLLFTDTFLRKIHALCEEHFSPASLDLKFVTPKVIKLLEILRKYKPYER 382
 369
 370 Query:   359 IRLFEILETFN------------PEFQKERMKLEKAEH------------LSAIIFVDQR 394
 371               + FE +E +N             E   E  ++E+ E             L  IIFV++R
 372 Sbjct:   383 -QQFESVEWYNNRNQDNYVSWSDSEDDDEDEEIEEKEKPETNFPSPFTNILCGIIFVERR 441
 373
 374 Query:   395 YIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPDYVVGAS-GRNLA-SSDSQGLHKRQTEVLRRFHRN 452
 375              Y A  L  +++     +P+  +++ +++ G   G+N   +   +   ++Q EVLR+F  +
 376 Sbjct:   442 YTAVVLNRLIKEAGKQDPELAYISSNFITGHGIGKNQPRNKQMEAEFRKQEEVLRKFRAH 501
 377
 378 Query:   453 EINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPLDMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVE------ 506
 379              E N LIATS++EEGVD+ +CNLV++FD P + RSYVQSKGRAR   S Y++  +
 380 Sbjct:   502 ETNLLIATSIVEEGVDIPKCNLVVRFDLPTEYRSYVQSKGRARAPISNYIMLADTDKIKS 561
 381
 382 Query:   507 -EKD-----------------------------------------------------TAA 512
 383               E+D                                                     TA
 384 Sbjct:   562 FEEDLKTYKAIEKILRNKCSKSVDTGETDIDPVMDDDDVFPPYVLRPDDGGPRVTINTAI 621
 385
 386 Query:   513 -----YCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNK 567
 387                   YC++LPSD FT L P  +   + +   T Y + L LPINSP++ +IV   PM
 388 Sbjct:   622 GHINRYCARLPSDPFTHLAPKCRTRELPDG--TFY-STLYLPINSPLRASIV-GPPMSCV 677
 389
 390 Query:   568 KTAQMAVALEACRQLHLEGELDDNLLPKGRESIAKLLEHIDEEPDEYAPGIAAKVGSSKR 627
 391              + A+  VAL  C +LH  GELDD+L+P G+E++ K  E +D   DE    +  + GS+KR
 392 Sbjct:   678 RLAERVVALICCEKLHKIGELDDHLMPVGKETV-KYEEELDLH-DEEETSVPGRPGSTKR 735
 393
 394 Query:   628 KQLYDKKIARALNESFVEADKECFIYAFELERFREAELTLNPKRRKFEDPFNYEYCFGFL 687
 395              +Q Y K I   L +S+   D+ C++Y   +         LN +RRK   P +   CFG L
 396 Sbjct:   736 RQCYPKAIPECLRDSYPRPDQPCYLYVIGMVLTTPLPDELNFRRRKLYPPEDTTRCFGIL 795
 397
 398 Query:   688 SAKEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKKTTVTAAQLQEIQLFHNYLFTQVLQMCKTGN 747
 399              +AK IP+IP FPV+ R G + + + +      ++   L+ I   H Y+F+ +L++ K
 400 Sbjct:   796 TAKPIPQIPHFPVYTRSGEVTISIELKKSGFMLSLQMLELITRLHQYIFSHILRLEKPA- 854
 401
 402 Query:   748 LEFDGTSNAPLNTLIVPLNKRKDDMSYTINMKYVSEVVANMENMPRIPKDEVRRQ--YKF 805
 403              LEF  T +A     ++PLN   D  +  I+ K++ ++  + E    IP  +  ++  + F
 404 Sbjct:   855 LEFKPT-DADSAYCVLPLNVVNDSSTLDIDFKFMEDIEKS-EARIGIPSTKYTKETPFVF 912
 405
 406 Query:   806 NAEDYKDAIVMPWYRNLEQPVFYYVAEILPEWRPSSKFPDTHFETFNEYFIKKYKLEIYD 865
 407                EDY+DA+++P YRN +QP  +YVA++  +  P SKFP   +ETF EY+  KY L++ +
 408 Sbjct:   913 KLEDYQDAVIIPRYRNFDQPHRFYVADVYTDLTPLSKFPSPEYETFAEYYKTKYNLDLTN 972
 409
 410 Query:   866 QNQSLLDVDFTSTRLNLLQPRIQNQPRRSRTVSNSSTSNIPQASASDSKESNTSVPHSSQ 925
 411               NQ LLDVD TS+RLNLL PR  NQ  ++          +P +SA   K    S+ +
 412 Sbjct:   973 LNQPLLDVDHTSSRLNLLTPRHLNQKGKA----------LPLSSAEKRKAKWESLQN--- 1019
 413
 414 Query:   926 RQILVPELMDIHPISATLWNVIAALPSIFYRVNQLLLTDELRETILVKAFGKEKTKLDDN 985
 415              +QILVPEL  IHPI A+LW     LPSI YR++ LL  +ELR           +T  D
 416 Sbjct:  1020 KQILVPELCAIHPIPASLWRKAVCLPSILYRLHCLLTAEELRA----------QTASDAG 1069
 417
 418 Query:   986 VEWNSLAYATEYEEKQTIIVKKIQQLRDLNQKSIEDQERETRENDKIDDGEELFNIGVWD 1045
 419              V   SL     Y        K I      ++  I      + END       +
 420 Sbjct:  1070 VGVRSLPADFRYPNLDFGWKKSID-----SKSFISISNSSSAENDNYCKHSTIV------ 1118
 421
 422 Query:  1046 PEEAVRIGVEISSRDDRMDGEDQDTVGLTQGLHDGNISDEDDELPFVMHDYTARLTSNRN 1105
 423              PE A   G   ++R   ++  DQ +V     L
 424 Sbjct:  1119 PENAAHQG---ANRTSSLENHDQMSVNCRTLL---------------------------- 1147
 425
 426 Query:  1106 GIGAWSGSESIVPSGWGDWDGPEPDNSPMPFQILGGPGGLNVQALMADVGRVFDPSTASS 1165
 427                     SES                          PG L+V+ + AD+       TA +
 428 Sbjct:  1148 -------SES--------------------------PGKLHVE-VSADL-------TAIN 1166
 429
 430 Query:  1166 SLSQTVQESTVSPPKQLTKEEEQFKKLQNDLLKQAKERLEALEMSEDMEKPRRLEDTVNL 1225
 431               LS    ++  +    L   +  F   Q + L   K+ +          +P       NL
 432 Sbjct:  1167 GLSYN--QNLANGSYDLANRD--F--CQGNQLNYYKQEIPV--------QPTTSYSIQNL 1212
 433
 434 Query:  1226 EDYGDDQENQEDENTPTNFPKTIDEEIEELSIGARKKQEIDDNAAKTDVLERENCEVLPV 1285
 435                Y    ENQ         P+  DE     ++ + K   +D NA K+         V+P
 436 Sbjct:  1213 YSY----ENQ---------PQPSDE----CTLLSNKY--LDGNANKSTSDGSPVMAVMPG 1253
 437
 438 Query:  1286 AINEKSRSFSFEKESKAINGRLIRQRSEEYVSHIDSDIGLGVSPCLLLTALTTSNAADGM 1345
 439                +            + + GR+  ++S   + +  S   LG +P L+L ALT SNA+DG
 440 Sbjct:  1254 TTDT----------IQVLKGRMDSEQSPS-IGY--SSRTLGPNPGLILQALTLSNASDGF 1300
 441
 442 Query:  1346 SLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQLIV 1405
 443              +LER E +GDSFLK A T YL+ T  D HEG+LS+ RSK+VSNCNLYRLGKK G+P  +V
 444 Sbjct:  1301 NLERLEMLGDSFLKHAITTYLFCTYPDAHEGRLSYMRSKKVSNCNLYRLGKKKGLPSRMV 1360
 445
 446 Query:  1406 ANKFDAHDSWLPPCYIPTCDFKAPNTD--------------------DAEEKDNEIERIL 1445
 447               + FD   +WLPP Y+   D K+ NTD                    D EE+D E E ++
 448 Sbjct:  1361 VSIFDPPVNWLPPGYVVNQD-KS-NTDKWEKDEMTKDCMLANGKLDEDYEEEDEEEESLM 1418
 449
 450 Query:  1446 ----------DGQVIEEKPENKTGWD-----IGGDVSK------STTDGIETITFPKQAR 1484
 451                        +   +E   E+    D      G  V K      STTD       PK++
 452 Sbjct:  1419 WRAPKEEADYEDDFLEYDQEHIRFIDNMLMGSGAFVKKISLSPFSTTDSAYEWKMPKKSS 1478
 453
 454 Query:  1485 VGN-----------------------------DDI-----SP-------------LPYNL 1497
 455              +G+                             DD      +P             + Y+L
 456 Sbjct:  1479 LGSMPFSSDFEDFDYSSWDAMCYLDPSKAVEEDDFVVGFWNPSEENCGVDTGKQSISYDL 1538
 457
 458 Query:  1498 LTQQHISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSD-----VP--- 1549
 459               T+Q I+DKSIAD VEAL+G +L + G       +  +GLKV+   +++D      P
 460 Sbjct:  1539 HTEQCIADKSIADCVEALLGCYLTSCGERAAQLFLCSLGLKVLPVIKRTDREKALCPTRE 1598
 461
 462 Query:  1550 ----------------------SPLLR-----FIDTPT-----NPNASLNFLNNLWQQFQ 1577
 463                                    S +L+      +  P      +P+A    LN+L   F+
 464 Sbjct:  1599 NFNSQQKNLSVSCAAASVASSRSSVLKDSEYGCLKIPPRCMFDHPDADKT-LNHLISGFE 1657
 465
 466 Query:  1578 FTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNRVTGCYQRLEFLGDAVLDYMITRYLFEDSR 1637
 467                  E+KI YRFK +AYL+QAFTHASY  N +T CYQRLEFLGDA+LDY+IT++L+ED R
 468 Sbjct:  1658 --NFEKKINYRFKNKAYLLQAFTHASYHYNTITDCYQRLEFLGDAILDYLITKHLYEDPR 1715
 469
 470 Query:  1638 QYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCPGLYHMIEKFVKLCSERNFDTNF 1697
 471              Q+SPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVK+++ K+F A+ P L+H+I+ FV+   E+N
 472 Sbjct:  1716 QHSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKYDYHKYFKAVSPELFHVIDDFVQFQLEKNEMQGM 1775
 473
 474 Query:  1698 NAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESVAGAIYLDSGRNLDTTWQVIFHMMRGT 1757
 475              ++E+    +EE  DE +EEDIEVPKAMGDIFES+AGAIY+DSG +L+T WQV + MMR
 476 Sbjct:  1776 DSELRR--SEE--DEEKEEDIEVPKAMGDIFESLAGAIYMDSGMSLETVWQVYYPMMRPL 1831
 477
 478 Query:  1758 IELCCANPPRSPIRELMEFEQSKVRFSKMERILESGKVRVTVEVVNNMRFTGMGRNYRIA 1817
 479              IE   AN PRSP+REL+E E    +FS  ER  + GKVRVTVEVV   +F G+GR+YRIA
 480 Sbjct:  1832 IEKFSANVPRSPVRELLEMEPETAKFSPAERTYD-GKVRVTVEVVGKGKFKGVGRSYRIA 1890
 481
 482 Query:  1818 KATAAKRALKYLHQIEQQ 1835
 483              K+ AA+RAL+ L   + Q
 484 Sbjct:  1891 KSAAARRALRSLKANQPQ 1908
 485
 486
 487 >sp|Q8R418.2|DICER_MOUSE RecName: Full=Endoribonuclease Dicer; AltName:
 488             Full=Double-strand-specific ribonuclease mDCR-1
 489         Length = 1906
 490
 491  Score = 2120 (751.3 bits), Expect = 1.6e-219, P = 1.6e-219
 492  Identities = 698/2050 (34%), Positives = 1005/2050 (49%)
 493  Links = (1)
 494
 495 Query:    11 FNPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQGGKRAFFVVE 70
 496              + PR YQVELL+ A   NTIV L TGSGKTFIAVLL KE   Q+   L+   KR  F+V
 497 Sbjct:    32 YTPRKYQVELLEAALDHNTIVCLNTGSGKTFIAVLLTKELAHQIRGDLNPHAKRTVFLVN 91
 498
 499 Query:    71 KVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDLIR 130
 500                N V QQ   +  H+  KVG+      +  W +KE+  Q   +H V+++T    L +++
 501 Sbjct:    92 SANQVAQQVSAVRTHSDLKVGEYSDLEVNASW-TKERWSQEFTKHQVLIMTCYVALTVLK 150
 502
 503 Query:   131 HAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLTASLIKAKVAP 190
 504              + YL + D+ +L+FDECH A+   HPYR IM   KL +     PR+LGLTAS++  K  P
 505 Sbjct:   151 NGYLSLSDINLLVFDECHLAI-LDHPYREIM---KLCESCPSCPRILGLTASILNGKCDP 206
 506
 507 Query:   191 EKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTVIEI 250
 508              E+L E+++KLE  + S  ETA+DLV L +Y ++P E+V+ C  F     G+  ++ ++
 509 Sbjct:   207 EELEEKIQKLERILRSDAETATDLVVLDRYTSQPCEIVVDCGPFTDRS-GL--YERLLME 263
 510
 511 Query:   251 FDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEKELGKII 310
 512               +  + F+N         + D     K  L   RAV   LGPW A + A +  +EL K I
 513 Sbjct:   264 LEAALDFINDCNVAVHSKERDSTLISKQILSDCRAVLVVLGPWCADKVAGMMVRELQKYI 323
 514
 515 Query:   311 KSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLE----P---EMKKI-----KSIEALRPYVPQRV 358
 516              K +   +   +FL    T +  I  L E    P   ++K +     K +E LR Y P
 517 Sbjct:   324 KHEQ-EELHRKFLLFTDTLLRKIHALCEEYFSPASLDLKYVTPKVMKLLEILRKYKPYER 382
 518
 519 Query:   359 IRLFEILETFNPEFQ---------------KERMKLEKAEH---------LSAIIFVDQR 394
 520               + FE +E +N   Q               +E  + EK E          L  IIFV++R
 521 Sbjct:   383 -QQFESVEWYNNRNQDNYVSWSDSEDDDDDEEIEEKEKPETNFPSPFTNILCGIIFVERR 441
 522
 523 Query:   395 YIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPDYVVGAS-GRNLA-SSDSQGLHKRQTEVLRRFHRN 452
 524              Y A  L  +++     +P+  +++ +++ G   G+N   S   +   ++Q EVLR+F  +
 525 Sbjct:   442 YTAVVLNRLIKEAGKQDPELAYISSNFITGHGIGKNQPRSKQMEAEFRKQEEVLRKFRAH 501
 526
 527 Query:   453 EINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPLDMRSYVQSKGRARRAGSRYVIT-------- 504
 528              E N LIATSV+EEGVD+ +CNLV++FD P + RSYVQSKGRAR   S YV+
 529 Sbjct:   502 ETNLLIATSVVEEGVDIPKCNLVVRFDLPTEYRSYVQSKGRARAPISNYVMLADTDKIKS 561
 530
 531 Query:   505 ---------------------------------VEEKD-------------------TAA 512
 532                                               V+++D                   TA
 533 Sbjct:   562 FEEDLKTYKAIEKILRNKCSKSADGAEADVHAGVDDEDAFPPYVLRPDDGGPRVTINTAI 621
 534
 535 Query:   513 -----YCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNK 567
 536                   YC++LPSD FT L P  +   + +   T Y + L LPINSP++ +IV   PM +
 537 Sbjct:   622 GHINRYCARLPSDPFTHLAPKCRTRELPDG--TFY-STLYLPINSPLRASIV-GPPMDSV 677
 538
 539 Query:   568 KTAQMAVALEACRQLHLEGELDDNLLPKGRESIAKLLEHIDEEPDEYAPGIAAKVGSSKR 627
 540              + A+  VAL  C +LH  GELD++L+P G+E++ K  E +D   DE    +  + GS+KR
 541 Sbjct:   678 RLAERVVALICCEKLHKIGELDEHLMPVGKETV-KYEEELDLH-DEEETSVPGRPGSTKR 735
 542
 543 Query:   628 KQLYDKKIARALNESFVEADKECFIYAFELERFREAELTLNPKRRKFEDPFNYEYCFGFL 687
 544              +Q Y K I   L ES+ + D+ C++Y   +         LN +RRK   P +   CFG L
 545 Sbjct:   736 RQCYPKAIPECLRESYPKPDQPCYLYVIGMVLTTPLPDELNFRRRKLYPPEDTTRCFGIL 795
 546
 547 Query:   688 SAKEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKKTTVTAAQLQEIQLFHNYLFTQVLQMCKTGN 747
 548              +AK IP+IP FPV+ R G + + + +     T++   L+ I   H Y+F+ +L++ K
 549 Sbjct:   796 TAKPIPQIPHFPVYTRSGEVTISIELKKSGFTLSQQMLELITRLHQYIFSHILRLEKPA- 854
 550
 551 Query:   748 LEFDGTSNAPLNTLIVPLNKRKDDMSYTINMKYVSEVVANMENMPRIPKDEVRRQ--YKF 805
 552              LEF  T  A     ++PLN   D  +  I+ K++ ++  + E    IP  +  ++  + F
 553 Sbjct:   855 LEFKPTG-AESAYCVLPLNVVNDSGTLDIDFKFMEDIEKS-EARIGIPSTKYSKETPFVF 912
 554
 555 Query:   806 NAEDYKDAIVMPWYRNLEQPVFYYVAEILPEWRPSSKFPDTHFETFNEYFIKKYKLEIYD 865
 556                EDY+DA+++P YRN +QP  +YVA++  +  P SKFP   +ETF EY+  KY L++ +
 557 Sbjct:   913 KLEDYQDAVIIPRYRNFDQPHRFYVADVYTDLTPLSKFPSPEYETFAEYYKTKYNLDLTN 972
 558
 559 Query:   866 QNQSLLDVDFTSTRLNLLQPRIQNQPRRSRTVSNSSTSNIPQASASDSKESNTSVPHSSQ 925
 560               NQ LLDVD TS+RLNLL PR  NQ  ++          +P +SA   K    S+ +
 561 Sbjct:   973 LNQPLLDVDHTSSRLNLLTPRHLNQKGKA----------LPLSSAEKRKAKWESLQN--- 1019
 562
 563 Query:   926 RQILVPELMDIHPISATLWNVIAALPSIFYRVNQLLLTDELRETILVKAFGKEKTKLDDN 985
 564              +QILVPEL  IHPI A+LW     LPSI YR++ LL  +ELR      A G     L  +
 565 Sbjct:  1020 KQILVPELCAIHPIPASLWRKAVCLPSILYRLHCLLTAEELRAQTASDA-GVGVRSLPVD 1078
 566
 567 Query:   986 VEWNSLAYATEYEEKQTIIVKKIQQLRDLNQKSIEDQERETRENDKIDDGEELFNIGVWD 1045
 568                + +L    ++  K++I  K    +   N  S+ + +   + +  +
 569 Sbjct:  1079 FRYPNL----DFGWKKSIDSKSF--ISTCNS-SLAESDNYCKHSTTVV------------ 1119
 570
 571 Query:  1046 PEEAVRIGVEISSRDDRMDGEDQDTVGLTQGLHDGNISDEDDELPFVMHDYTARLTSNRN 1105
 572              PE A   G    S    ++  DQ +V                           RL
 573 Sbjct:  1120 PEHAAHQGATRPS----LENHDQMSVNCK------------------------RL----- 1146
 574
 575 Query:  1106 GIGAWSGSESIVPSGWGDWDGPEPDNSPMPFQILGGPGGLNVQALMADVGRVFDPSTASS 1165
 576                                     P  SP   Q            +  D+       TA +
 577 Sbjct:  1147 -----------------------PAESPAKLQ----------SEVSTDL-------TAIN 1166
 578
 579 Query:  1166 SLSQTVQESTVSPPKQLTKEEEQFKKLQNDLLKQAKERLEALEMSEDMEKPRRLEDTVNL 1225
 580               LS    ++  +    L   +  F   Q + L   K+ +          +P       NL
 581 Sbjct:  1167 GLSYN--KNLANGSYDLVNRD--F--CQGNQLNYFKQEIPV--------QPTTSYPIQNL 1212
 582
 583 Query:  1226 EDYGDDQENQEDENTPTNFPKTIDEEIEELSIGARKKQEIDDNAAKTDVLERENCEVLPV 1285
 584               +Y    ENQ     P+N       E   LS        +D NA  +          +P
 585 Sbjct:  1213 YNY----ENQPK---PSN-------ECPLLS-----NTYLDGNANTSTSDGSPAVSTMPA 1253
 586
 587 Query:  1286 AINEKSRSFSFEKESKAINGRLIRQRSEEYVSHIDSDIGLGVSPCLLLTALTTSNAADGM 1345
 588               +N            KA+  R+  ++S   V +  S   LG +P L+L ALT SNA+DG
 589 Sbjct:  1254 MMNAV----------KALKDRMDSEQSPS-VGY--SSRTLGPNPGLILQALTLSNASDGF 1300
 590
 591 Query:  1346 SLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQLIV 1405
 592              +LER E +GDSFLK A T YL+ T  D HEG+LS+ RSK+VSNCNLYRLGKK G+P  +V
 593 Sbjct:  1301 NLERLEMLGDSFLKHAITTYLFCTYPDAHEGRLSYMRSKKVSNCNLYRLGKKKGLPSRMV 1360
 594
 595 Query:  1406 ANKFDAHDSWLPPCYI----------------------------PTCD------FKAPNT 1431
 596               + FD   +WLPP Y+                              C+      ++AP
 597 Sbjct:  1361 VSIFDPPVNWLPPGYVVNQDKSNSEKWEKDEMTKDCLLANGKLGEACEEEEDLTWRAPK- 1419
 598
 599 Query:  1432 DDAEEKDNEIE------RILDGQVI---------------------EEKPENK------- 1457
 600              ++AE++D+ +E      + +D  ++                     E K   K
 601 Sbjct:  1420 EEAEDEDDFLEYDQEHIQFIDSMLMGSGAFVRKISLSPFSASDSAYEWKMPKKASLGSMP 1479
 602
 603 Query:  1458 ----------TGWDIGG--DVSKSTTDGIETITF--PKQARVGNDD-ISPLPYNLLTQQH 1502
 604                        + WD     D SK+  +    + F  P +   G D     + Y+L T+Q
 605 Sbjct:  1480 FASGLEDFDYSSWDAMCYLDPSKAVEEDDFVVGFWNPSEENCGVDTGKQSISYDLHTEQC 1539
 606
 607 Query:  1503 ISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKV---IQKDQKSDVPSP-------- 1551
 608              I+DKSIAD VEAL+G +L + G       +  +GLKV   I++  +     P
 609 Sbjct:  1540 IADKSIADCVEALLGCYLTSCGERAAQLFLCSLGLKVLPVIKRTSREKALDPAQENGSSQ 1599
 610
 611 Query:  1552 ---LLRFIDTPTNPNAS----LNF-------------------LNNLWQQFQFTQLEEKI 1585
 612                 L      P  P +S    L +                   LN+L   F+    E+KI
 613 Sbjct:  1600 QKSLSGSCAAPVGPRSSAGKDLEYGCLKIPPRCMFDHPDAEKTLNHLISGFE--TFEKKI 1657
 614
 615 Query:  1586 GYRFKERAYLVQAFTHASYINNRVTGCYQRLEFLGDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLT 1645
 616               YRFK +AYL+QAFTHASY  N +T CYQRLEFLGDA+LDY+IT++L+ED RQ+SPGVLT
 617 Sbjct:  1658 NYRFKNKAYLLQAFTHASYHYNTITDCYQRLEFLGDAILDYLITKHLYEDPRQHSPGVLT 1717
 618
 619 Query:  1646 DLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCPGLYHMIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVT 1705
 620              DLRSALVNNTIFASLAVK+++ K+F A+ P L+H+I+ FVK   E+N     ++E+
 621 Sbjct:  1718 DLRSALVNNTIFASLAVKYDYHKYFKAVSPELFHVIDDFVKFQLEKNEMQGMDSELRR-- 1775
 622
 623 Query:  1706 TEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESVAGAIYLDSGRNLDTTWQVIFHMMRGTIELCCANP 1765
 624              +EE  DE +EEDIEVPKAMGDIFES+AGAIY+DSG +L+  WQV + MM+  IE   AN
 625 Sbjct:  1776 SEE--DEEKEEDIEVPKAMGDIFESLAGAIYMDSGMSLEVVWQVYYPMMQPLIEKFSANV 1833
 626
 627 Query:  1766 PRSPIRELMEFEQSKVRFSKMERILESGKVRVTVEVVNNMRFTGMGRNYRIAKATAAKRA 1825
 628              PRSP+REL+E E    +FS  ER  + GKVRVTVEVV   +F G+GR+YRIAK+ AA+RA
 629 Sbjct:  1834 PRSPVRELLEMEPETAKFSPAERTYD-GKVRVTVEVVGKGKFKGVGRSYRIAKSAAARRA 1892
 630
 631 Query:  1826 LKYLHQIEQQ 1835
 632              L+ L   + Q
 633 Sbjct:  1893 LRSLKANQPQ 1902
 634
 635
 636 >sp|P84634.1|DCL4_ARATH RecName: Full=Dicer-like protein 4
 637         Length = 1589
 638
 639  Score = 471 (170.9 bits), Expect = 8.6e-72, Sum P(5) = 8.6e-72
 640  Identities = 201/689 (29%), Positives = 323/689 (46%)
 641  Links = (1)-4-3-2-5
 642
 643 Query:    14 RDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQGGKRAFFVVEKVN 73
 644              R YQVEL  KAT++N IV LGTG GKT IAV+L+ E G  + +P         F+   V
 645 Sbjct:   125 RRYQVELCKKATEENVIVYLGTGCGKTHIAVMLIYELGHLVLSPKKSV---CIFLAPTVA 181
 646
 647 Query:    74 LVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDLIRHAY 133
 648              LVEQQA  I    +FKV  +H      +  S  + ++ +  + V+V+T Q LL  ++H +
 649 Sbjct:   182 LVEQQAKVIADSVNFKVA-IHCG-GKRIVKSHSEWEREIAANEVLVMTPQILLHNLQHCF 239
 650
 651 Query:   134 LKIEDMCVLIFDECHHALG-SQHPYRSIM-VDYKLLKKDKPVPRVLGLTASLIKAKVAPE 191
 652              +K+E + +LIFDECHHA   S HPY  IM V YK     +P  R+ G+TAS +  K  P
 653 Sbjct:   240 IKMECISLLIFDECHHAQQQSNHPYAEIMKVFYKSESLQRP--RIFGMTASPVVGKDGPP 297
 654
 655 Query:   192 KLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKY-GAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTV-IE 249
 656                ++       +  S    +  + SL     AK Y V     +  +   G  +   V +
 657 Sbjct:   298 --LDSFTYFSGSFQSE-NLSKSINSLENLLNAKVYSV-----ESNVQLDGFVSSPLVKVY 349
 658
 659 Query:   250 IFDETVAFVNTTTEFHPDL--DLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEKELG 307
 660               +   ++  + +T  + ++  D+  RR     L+   A   QL          V ++ +G
 661 Sbjct:   350 YYRSALSDASQSTIRYENMLEDIKQRRANVYCLRFLEAAKIQLNS-----DHNVQDEPVG 404
 662
 663 Query:   308 KIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMIT-IKRLLEPEMKKIKSIEALR-PYVPQRVIRLFEIL 365
 664              K  KS++       +L+MA  ++ + + +  +     + S+ AL+ P   +++++L +IL
 665 Sbjct:   405 KNPKSKICDT----YLSMAAEALSSGVAK--DENASDLLSLAALKEPLFSRKLVQLIKIL 458
 666
 667 Query:   366 ETFNPEFQKERMKLEKAEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHI---KSWEPKFKFVNPDYV 422
 668                F         +LE   H+  IIFV++   A +L  ++ ++   +SW+        D++
 669 Sbjct:   459 SVF---------RLEP--HMKCIIFVNRIVTARTLSCILNNLELLRSWKS-------DFL 500
 670
 671 Query:   423 VGASGRNLASSDSQGLHKRQTE-VLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRP 481
 672              VG S      S  + + +R  E +L+RF   E+N L+AT V EEG+D++ C LVI++D P
 673 Sbjct:   501 VGLS------SGLKSMSRRSMETILKRFQSKELNLLVATKVGEEGLDIQTCCLVIRYDLP 554
 674
 675 Query:   482 LDMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVE---EKD----------------------------- 509
 676                + S++QS+GRAR   S Y   V+   EK+
 677 Sbjct:   555 ETVTSFIQSRGRARMPQSEYAFLVDSGNEKEMDLIENFKVNEDRMNLEITYRSSEETCPR 614
 678
 679 Query:   510 ----------TAA-------------YCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVTKYCAEL 546
 680                        T A             YCS+LP D F +  P  Q  P++E G T  C  +
 681 Sbjct:   615 LDEELYKVHETGACISGGSSISLLYKYCSRLPHDEFFQPKPEFQFKPVDEFGGT-IC-RI 672
 682
 683 Query:   547 LLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELDDNLLPKGRESIAKLLEH 606
 684               LP N+PI    +  + +P+ + A+    L+A  +LH  G L+D LLP  ++ I   L
 685 Sbjct:   673 TLPANAPISE--IESSLLPSTEAAKKDACLKAVHELHNLGVLNDFLLPDSKDEIEDELS- 729
 686
 687 Query:   607 IDEEPDEYAPGIAAKVGSSKRKQLYDKKI 635
 688               D+E D     I  + G S R  LY+ ++
 689 Sbjct:   730 -DDEFD--FDNIKGE-GCS-RGDLYEMRV 753
 690
 691  Score = 290 (107.1 bits), Expect = 8.6e-72, Sum P(5) = 8.6e-72
 692  Identities = 76/182 (41%), Positives = 99/182 (54%)
 693  Links = 1-4-3-(2)-5
 694
 695 Query:  1506 KSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKV-IQKDQKSDVPSPLLRFIDTPTNPNA 1564
 696              K+IAD VEAL+G  L+  G    +K + W+G+ V  +  Q  D      R++   T
 697 Sbjct:  1162 KTIADVVEALVGAFLVDSGFKGAVKFLKWIGVNVDFESLQVQDACIASRRYLPLTTR--- 1218
 698
 699 Query:  1565 SLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNRVTGCYQRLEFLGDAVL 1624
 700                   NNL        LE ++ Y+F  +  LVQAF H SY N    GCYQRLEFLGDAVL
 701 Sbjct:  1219 -----NNL------ETLENQLDYKFLHKGLLVQAFIHPSY-NRHGGGCYQRLEFLGDAVL 1266
 702
 703 Query:  1625 DYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCPGLY-H-MIE 1682
 704              DY++T Y F    +  PG LTDLRS  VNN   A++AV F   K F+  C  +Y H +IE
 705 Sbjct:  1267 DYLMTSYFFTVFPKLKPGQLTDLRSLSVNNEALANVAVSFSL-KRFL-FCESIYLHEVIE 1324
 706
 707 Query:  1683 KF 1684
 708               +
 709 Sbjct:  1325 DY 1326
 710
 711  Score = 109 (43.4 bits), Expect = 8.6e-72, Sum P(5) = 8.6e-72
 712  Identities = 28/59 (47%), Positives = 38/59 (64%)
 713  Links = 1-4-(3)-2-5
 714
 715 Query:  1327 VSPCLLLTALTTSNAADGMSLERFETIGDSFLKFATTDYLY--HTLLDQHEGKLSFARS 1383
 716              VS   +L ALTT    + +SLER E +GD+FLKFA + +L+  H  LD  EG+L+  RS
 717 Sbjct:  1044 VSGHRVLEALTTEKCHERLSLERLEVLGDAFLKFAVSRHLFLHHDSLD--EGELTRRRS 1100
 718
 719  Score = 58 (25.5 bits), Expect = 8.6e-72, Sum P(5) = 8.6e-72
 720  Identities = 14/42 (33%), Positives = 25/42 (59%)
 721  Links = 1-(4)-3-2-5
 722
 723 Query:   931 PEL--MDIHPISATLWNVIAALPSIFYRVNQLLLTDELRETI 970
 724              PEL  + I  +S  + + ++ LPSI +R+  LL+  EL+  +
 725 Sbjct:   993 PELSHLKIKGLSKDIGSSLSLLPSIMHRMENLLVAIELKHVL 1034
 726
 727  Score = 57 (25.1 bits), Expect = 8.6e-72, Sum P(5) = 8.6e-72
 728  Identities = 22/79 (27%), Positives = 33/79 (41%)
 729  Links = 1-4-3-2-(5)
 730
 731 Query:  1765 PPRSPIRELMEFEQSKVRFSKMERILESGKVRVTVEVVNN---MRFTGMGRNYRIAKATA 1821
 732              P  SPI+EL+E  QS     ++    + G   V ++V  N   +  +  GRN R     A
 733 Sbjct:  1346 PKISPIKELIELCQSYKWDREISATKKDGAFTVELKVTKNGCCLTVSATGRNKREGTKKA 1405
 734
 735 Query:  1822 AKRALKYLHQIEQQRRQSP 1840
 736              A+  +  L   E      P
 737 Sbjct:  1406 AQLMITNLKAHENITTSHP 1424
 738
 739
 740 >sp|Q7S8J7.1|DCL1_NEUCR RecName: Full=Dicer-like protein 1; Includes: RecName:
 741             Full=Endoribonuclease dcl-1; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
 742             helicase dcl-1
 743         Length = 1584
 744
 745  Score = 505 (182.8 bits), Expect = 3.0e-69, Sum P(6) = 3.0e-69
 746  Identities = 164/507 (32%), Positives = 269/507 (53%)
 747  Links = (1)-4-6-3-2-8
 748
 749 Query:    12 NPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQGGKR--AFFVV 69
 750              +PR+YQVEL ++A ++NTI  L TGSGKT IA +LL+          ++G  R  AFF+V
 751 Sbjct:   121 SPREYQVELFERAKQQNTIAVLDTGSGKTLIAAMLLRWVITGELEDREKGLPRRIAFFLV 180
 752
 753 Query:    70 EKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDLI 129
 754              +KV LV QQ   +  +  F + ++ G+   G+ +SK    + ++++ VVV TA+ L   +
 755 Sbjct:   181 DKVALVFQQHSFLTKNLDFPMEKLCGEMVEGV-ESKAFWKEALEQNEVVVCTAEILSTAL 239
 756
 757 Query:   130 RHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLTASLIKAKVA 189
 758               H++++++ + +LIFDE HH     HPY  I+ ++ + ++ +  PR+LGLTAS + AKV
 759 Sbjct:   240 HHSWIRMDQINLLIFDEAHHTK-KDHPYARIIKNFYIDEQLERRPRILGLTASPVDAKVD 298
 760
 761 Query:   190 PEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTVIE 249
 762              P +   +L   E+ + S I TA+D  +L     KP   +++  ++     G P+ +TV+
 763 Sbjct:   299 PRRAAAEL---EALLHSQIATAADPAALQHTICKPKTELVV--EY---VRGRPDSETVLN 350
 764
 765 Query:   250 IFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEKELGKI 309
 766                 +    V     F        ++P+     TT A  + LG W A R  Q++ K+   I
 767 Sbjct:   351 --KQLRKLVGGQELF--------KKPLNF---TTSAASK-LGTWCADRYWQLFFKQ-EDI 395
 768
 769 Query:   310 IKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMIT---IKRLLEP-EMKKIKSIE--ALRP-YVPQRVIRLF 362
 770              +K +   ++ L  + +A    IT   +K++ E  E+    +    AL P  +  +VI L
 771 Sbjct:   396 VKLESRTERDL--MKVAALDEITEKHVKQVREAHELVNAHTFSPAALDPTMLSSKVIMLV 453
 772
 773 Query:   363 EILETFNPEFQKERMKLEKAEHLSAIIFVDQRYIAYSL--LLMMRHIKSWEPKFKFVNPD 420
 774               IL     +F++       A+    IIFV QR  A  L  LL    IKS  P    +  +
 775 Sbjct:   454 RILRD---QFERG----VGAQR--CIIFVRQRNTAMLLADLLQQPEIKSHIPS---IAAE 501
 776
 777 Query:   421 YVVGASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDR 480
 778               +VG      +  +++   ++Q  ++R+F   EINCL ATSV EEG+D+  CN+VI+FD
 779 Sbjct:   502 VLVGGGTTGSSYVNAKINFQQQNRIIRKFKLGEINCLFATSVAEEGLDIPDCNIVIRFDL 561
 780
 781 Query:   481 PLDMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEE 507
 782                 +   +QS+GRARR  SRY+  +E+
 783 Sbjct:   562 YDTLIQCIQSRGRARRPDSRYIQMIEK 588
 784
 785  Score = 233 (87.1 bits), Expect = 3.0e-69, Sum P(6) = 3.0e-69
 786  Identities = 81/263 (30%), Positives = 117/263 (44%)
 787  Links = 1-4-6-3-(2)-8
 788
 789 Query:  1500 QQHI-SDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSDVPS--PLLRFI 1556
 790              Q+H+ +DKSIAD  EALIG   LT G       M    +  + KD+K  + S
 791 Sbjct:  1182 QRHVLADKSIADVCEALIGAAYLT-GQEKGSFDMAIKAVTAMVKDKKHRMISYGDYYAVY 1240
 792
 793 Query:  1557 DTPTNPNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASY--INNRVTGCYQ 1614
 794                PT    S N      Q+    +  E++GY+FK    L  AF H +Y  +  R+   YQ
 795 Sbjct:  1241 QKPTWQTESANSA----QRDMAKKFSERMGYKFKHPRLLRAAFQHPTYPSLYERLPS-YQ 1295
 796
 797 Query:  1615 RLEFLGDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMC 1674
 798              RLEFLGDA+ D +   YLF       P  LT+ + A+V+N     L+    F K    M
 799 Sbjct:  1296 RLEFLGDALFDMVAVDYLFRKFPAADPQWLTEHKMAMVSNQFLCCLSFHLGFNKCIATMS 1355
 800
 801 Query:  1675 PGLYHMIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDI----EVPKAMGDIFES 1730
 802              P +   I ++V    E   +T     +    T +E        I     +PK + D+ E+
 803 Sbjct:  1356 PSILKDIAEYVTEIEEA-LETAKQEAINAGKTADEYSRDYWVHITHASRLPKCLSDVVEA 1414
 804
 805 Query:  1731 VAGAIYLDSGRNLDTTWQVIFHM 1753
 806                GAI++DS  +     Q  F+M
 807 Sbjct:  1415 YIGAIFVDSEYDYSVV-QNFFNM 1436
 808
 809  Score = 109 (43.4 bits), Expect = 3.0e-69, Sum P(6) = 3.0e-69
 810  Identities = 49/187 (26%), Positives = 86/187 (45%)
 811  Links = 1-4-6-(3)-2-8
 812
 813 Query:  1249 DEEIEELSIGARKKQEIDDNAAKTDVLERENCEVL--PVAINEKSRSFSFEKESKAINGR 1306
 814              D+ + E ++ + ++  +DD     DV E + C ++  P+ I+        +  +  +
 815 Sbjct:   987 DQPVVEAALISTRRDFLDDTLRDEDV-EPQQCFLILEPMRISP----IPADVVAMLLCFP 1041
 816
 817 Query:  1307 LIRQRSEEYVSHIDSD--IGLGVSPCLLLTALTT-SNAAD-----------GM--SLERF 1350
 818               I  R E  +  +D+   +GL + P L L A T  S+ +D           GM  + ER
 819 Sbjct:  1042 SIIHRVESNLVALDACKLLGLDLRPDLALEAFTKDSDNSDEHDAEKENFQTGMGDNYERL 1101
 820
 821 Query:  1351 ETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQLIVANKFD 1410
 822              E +GDSFLK ATT  +Y  + D+ E +    R   + N NL+    ++G+ + I +  F+
 823 Sbjct:  1102 EFLGDSFLKMATTIAIYTLIPDKGEFEYHVERMLLICNKNLFNNALEIGLEEYIRSMSFN 1161
 824
 825 Query:  1411 AHDSWLP 1417
 826                  W P
 827 Sbjct:  1162 RRQ-WYP 1167
 828
 829  Score = 69 (29.3 bits), Expect = 3.0e-69, Sum P(6) = 3.0e-69
 830  Identities = 28/82 (34%), Positives = 40/82 (48%)
 831  Links = 1-(4)-6-3-2-8
 832
 833 Query:   511 AAYCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTA 570
 834              A + + LP    T L P   I  +   G    C E+++P  SPIK A+  K  + +K  A
 835 Sbjct:   659 ANFTATLPHPPETSLSPEYYITTVP-GGFQ--C-EVVMPDASPIKSAVG-KVHL-SKGVA 712
 836
 837 Query:   571 QMAVALEACRQLHLEGELDDNL 592
 838              + A A E C  L   G LD++L
 839 Sbjct:   713 KCAAAFELCLALLKAGHLDNHL 734
 840
 841  Score = 65 (27.9 bits), Expect = 1.0e-64, Sum P(6) = 1.0e-64
 842  Identities = 21/69 (30%), Positives = 36/69 (52%)
 843  Links = 1-4-6-(5)-2-8
 844
 845 Query:   925 QRQILVPELMDIHPISATLWNVIAALPSIFYRV-NQLLLTD-------ELRETILVKAFG 976
 846              Q+  L+ E M I PI A +  ++   PSI +RV + L+  D       +LR  + ++AF
 847 Sbjct:  1015 QQCFLILEPMRISPIPADVVAMLLCFPSIIHRVESNLVALDACKLLGLDLRPDLALEAFT 1074
 848
 849 Query:   977 KEKTKLDDN 985
 850              K+    D++
 851 Sbjct:  1075 KDSDNSDEH 1083
 852
 853  Score = 49 (22.3 bits), Expect = 3.0e-69, Sum P(6) = 3.0e-69
 854  Identities = 44/220 (20%), Positives = 84/220 (38%)
 855  Links = 1-4-(6)-3-2-8
 856
 857 Query:   687 LSAKEIPKIPPFPVFLRQGNM-KVRLIVAPKKTTVTAAQLQEIQLFHNYLFTQVLQMCKT 745
 858              LS   +P++  FP+F       KVR +  P         ++++  F    F  V
 859 Sbjct:   801 LSRSALPEVASFPLFFGTKRFSKVRCVPIPGSVQADDTLVEQLTRFTLKAFMDVFSK--- 857
 860
 861 Query:   746 GNLEFDGTS-NAPLNTLIVPLN-------KRKDDMSYTINMKYVSEVVANMENMPR--IP 795
 862                 E++ T+ N P    + P++       +     ++ I+ K ++ V  N E +P   +
 863 Sbjct:   858 ---EYEATAVNLPY--FLSPMDGGHGFDFRLAKSPAHLIDRKALAYVSEN-EKVPYTFLE 911
 864
 865 Query:   796 KDEVRRQYKFNAEDYKDAI-VMPWYRNLEQPVFYYVAE--ILPEWRPSSKFPDTH--FET 850
 866               D+   Q KF  + Y  A      +R  +      V +  + P  R       TH
 867 Sbjct:   912 PDDFF-QDKFVVDPYDGARKFFTHHRRHDMKPTDPVPDGIVAPNHRAWRGLGTTHDILNY 970
 868
 869 Query:   851 FNEYFIKKYKLEIYDQNQSLLDVDFTSTRLNLLQPRIQNQ 890
 870               N  + K     I+  +Q +++    STR + L   ++++
 871 Sbjct:   971 SNSLWSKSRGFMIFQADQPVVEAALISTRRDFLDDTLRDE 1010
 872
 873  Score = 45 (20.9 bits), Expect = 4.1e-60, Sum P(4) = 4.1e-60
 874  Identities = 25/88 (28%), Positives = 41/88 (46%)
 875  Links = 1-(7)-2-8
 876
 877 Query:   535 EENGVTKYCAELLLPIN-SPIKH---AIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELDD 590
 878              +E+   + C  +L P+  SPI     A++L  P    +     VAL+AC+ L L+   D
 879 Sbjct:  1009 DEDVEPQQCFLILEPMRISPIPADVVAMLLCFPSIIHRVESNLVALDACKLLGLDLRPDL 1068
 880
 881 Query:   591 NLLPKGRESIAKLLEHIDEEPDEYAPGI 618
 882               L    ++S     EH D E + +  G+
 883 Sbjct:  1069 ALEAFTKDS-DNSDEH-DAEKENFQTGM 1094
 884
 885  Score = 40 (19.1 bits), Expect = 3.0e-69, Sum P(6) = 3.0e-69
 886  Identities = 10/26 (38%), Positives = 16/26 (61%)
 887  Links = 1-4-6-3-2-(8)
 888
 889 Query:  1815 RIAKATAAKRALKYLH--QIEQQRRQ 1838
 890              R AK+  AK+A+K L    +E+ R +
 891 Sbjct:  1529 RYAKSAMAKKAIKLLEGMSVEEFRER 1554
 892
 893
 894 >sp|A4RKC3.2|DCL1_MAGGR RecName: Full=Dicer-like protein 1; Includes: RecName:
 895             Full=Endoribonuclease DCL1; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
 896             helicase DCL1
 897         Length = 1591
 898
 899  Score = 481 (174.4 bits), Expect = 3.5e-69, Sum P(6) = 3.5e-69
 900  Identities = 152/502 (30%), Positives = 238/502 (47%)
 901  Links = (1)-4-5-7-3-2
 902
 903 Query:    13 PRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEY-GVQLFAPLDQGGKR-AFFVVE 70
 904              PR+YQ+EL ++A +KNTI  L TG+GKT IA+LL++    ++L A      KR  FF+V+
 905 Sbjct:   108 PREYQIELFERAKQKNTIAVLDTGTGKTLIAILLIRHIIELELGARWQGREKRITFFLVD 167
 906
 907 Query:    71 KVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDLIR 130
 908              KV LV QQ  HI  +  F V  +HG T   LW SKE  ++ ++   VVV TA+ L   +
 909 Sbjct:   168 KVALVRQQTDHIRANLDFPVTGLHGDTVRNLWYSKEYFEKLLQEQEVVVCTAEILYRCLH 227
 910
 911 Query:   131 HAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKD-KPVPRVLGLTASLIKAKVA 189
 912               +YL I  + +++FDE HHA    H Y  I+ D+ L+++D +  PR+ G+TAS I  K
 913 Sbjct:   228 RSYLNISQVSLVVFDEAHHAK-KNHVYARIIKDFYLMEEDCQKRPRIFGMTASPIDTKDT 286
 914
 915 Query:   190 PEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTVIE 249
 916                       +LES + S I T SD   L   G++P EV               ++  V+
 917 Sbjct:   287 CISYERATHELESLLHSEIATISDRDLLKVIGSRPQEVR-------------KSYARVLR 333
 918
 919 Query:   250 IFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPI-KDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQV-WEKELG 307
 920                 E     N   E      L    P+ K +  +      +LG W A +  ++ + +E
 921 Sbjct:   334 --QENTELCNQLRE------LVGNHPLFKQTFDSAEFAVTELGAWCADKLWELCFREEAV 385
 922
 923 Query:   308 KIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIRLFEILET 367
 924                +  +V   +  R  +    S   +    E  +  ++      P       +  +++E
 925 Sbjct:   386 STLDGRVEGSRA-RDPDEVGESSHEVSNAREA-LSLVQQWSFSPPEDGSLSTKTHKLIEI 443
 926
 927 Query:   368 FNPEFQKERMKLEKAEHLSAIIFVDQRYIAYSL--LLMMRHIKSWEPKFKFVNPDYVVGA 425
 928                  F +          +  I+FV +R  A  L  L     I++  P  K     +++GA
 929 Sbjct:   444 LAECFSQA----SAGNAIQCIVFVKRRDTAVLLNALCEQAEIRTKIPDLKGA---FLIGA 496
 930
 931 Query:   426 S-GRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPLDM 484
 932                G N A + +    ++Q + + RF   EINCL ATS+ EEG+D+  CN+VI+FD
 933 Sbjct:   497 GRGGNAAFTTT----RQQEQTVSRFRDGEINCLFATSIAEEGLDIPGCNVVIRFDLHGTT 552
 934
 935 Query:   485 RSYVQSKGRARRAGSRYVITVE 506
 936                Y+QS+GRAR   S ++   E
 937 Sbjct:   553 IQYIQSRGRARMRNSWFIHMTE 574
 938
 939  Score = 251 (93.4 bits), Expect = 3.5e-69, Sum P(6) = 3.5e-69
 940  Identities = 83/256 (32%), Positives = 125/256 (48%)
 941  Links = 1-4-5-7-3-(2)
 942
 943 Query:  1501 QH-ISDKSIADAVEALIGVHLLTL----GPN-----PTLKVMNWMGLKVIQ--KDQKSDV 1548
 944              +H + DKSIAD  EALIG   LT      PN       + VM       +Q   D  +
 945 Sbjct:  1166 EHALGDKSIADVCEALIGAAYLTAQAQSSPNFDLAVKAVTVMTHSKTHTMQAWSDYYASY 1225
 946
 947 Query:  1549 PSPLLRFIDTPTNPNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNR 1608
 948                P   ++ TP  P+ +        Q    +Q++ K+GYRFK    L  AF H SY
 949 Sbjct:  1226 QCP--EWLSTP--PSQT--------QLELCSQIKNKMGYRFKNPRLLRCAFMHPSYPRQY 1273
 950
 951 Query:  1609 VT-GCYQRLEFLGDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQ 1667
 952                   YQRLEFLGD++LD +   YLF+      P  LT+ + A+V+N  F  +AV   F
 953 Sbjct:  1274 ENIPSYQRLEFLGDSLLDMVCVDYLFKKHPDKDPQWLTEHKMAMVSNQFFGCVAVGLGFH 1333
 954
 955 Query:  1668 KHFIAMCPGLYHMIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEV---PKAM 1724
 956              +H I M P L   I ++ +L +++  +     ++ +   + E D  ++  IEV   PK +
 957 Sbjct:  1334 RHLIHMQPALGGSITEWAELVTKKREEAR---QLAVRRGQREEDYARDFWIEVHHPPKCL 1390
 958
 959 Query:  1725 GDIFESVAGAIYLDSG 1740
 960               DI E+  GA+++D+G
 961 Sbjct:  1391 PDILEAYVGALFVDTG 1406
 962
 963  Score = 99 (39.9 bits), Expect = 3.5e-69, Sum P(6) = 3.5e-69
 964  Identities = 25/75 (33%), Positives = 39/75 (52%)
 965  Links = 1-4-5-7-(3)-2
 966
 967 Query:  1344 GMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQL 1403
 968              G + ER E +GD FLK AT+  LY TL++  E +    R  ++ N NL     +  + +
 969 Sbjct:  1079 GQNYERLEFLGDCFLKMATSIALY-TLVEGDEFEYHVERMLDICNKNLLNWALESNLQEH 1137
 970
 971 Query:  1404 IVANKFDAHDSWLPP 1418
 972              I +  F+   +W PP
 973 Sbjct:  1138 IRSKSFNRR-TWYPP 1151
 974
 975  Score = 70 (29.7 bits), Expect = 3.5e-69, Sum P(6) = 3.5e-69
 976  Identities = 20/60 (33%), Positives = 34/60 (56%)
 977  Links = 1-(4)-5-7-3-2
 978
 979 Query:   545 ELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELDDNLLPKGRESIAKLL 604
 980              E+ LP +SP++ A  +     +K+ A+ A A   C QL+    LDD+L    + ++AK+L
 981 Sbjct:   674 EVYLPASSPLRSA--MGGVYRSKQLAKCAAAYAMCIQLYNSNYLDDHL----KSTLAKVL 727
 982
 983  Score = 65 (27.9 bits), Expect = 3.5e-69, Sum P(6) = 3.5e-69
 984  Identities = 35/168 (20%), Positives = 70/168 (41%)
 985  Links = 1-4-(5)-7-3-2
 986
 987 Query:   687 LSAKEIPKIPPFPVFLRQGNMK---VRLIVAPKKTTVTAAQLQEIQLFHNYLFTQVLQMC 743
 988              L+ K +P+I  FP+F  +G+ +   VR I      + T  Q++ I  F   +F  +
 989 Sbjct:   786 LTRKPLPEIAQFPLFFGKGSSRRSNVRCIPLAHPWSPTTTQVEGICAFTLCIFRDIFSK- 844
 990
 991 Query:   744 KTGNLEFDGTSNAPLNTLIVPLN--KRKDDMSYTINMKYVSE--VVANMENMPRIPKDEV 799
 992                 + +  GT + P    + P    +   D+S  +N + + +   V       R+P
 993 Sbjct:   845 ---DFQASGT-DMPY--FLAPSTGIEHGTDLSSLVNPERIIDWATVHRTTTTDRVP---- 894
 994
 995 Query:   800 RRQYKFNAED--YKDAIVMPWYRNLEQPVFYYVAEILPEWRPSSKFPD 845
 996                 Y FN  D  ++D  V   +    +   +++ ++  + +P  K P+
 997 Sbjct:   895 ---YNFNEPDEFFQDKYVSDPFDGSRK---FFMRKVRRDLKPQDKVPE 936
 998
 999  Score = 51 (23.0 bits), Expect = 3.9e-66, Sum P(4) = 3.9e-66
1000  Identities = 33/139 (23%), Positives = 58/139 (41%)
1001  Links = 1-(6)-3-2
1002
1003 Query:   490 SKGRA-RRAGSRYVITVEEKDTAAYCSKLPSDIF-TRLVPHNQIIPIEENGV------TK 541
1004              SK RA       Y +++ +K  A + S+    +    L P  + +  E +G       T
1005 Sbjct:   942 SKWRAVEHTILNYSVSLWKKSRAGHNSRQDQPVVEAELAPLRRNLLDETDGENSTGPQTC 1001
1006
1007 Query:   542 YCA-ELLLPINSPIKHAIVLKN-PMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELDDNLLPKGRES 599
1008              Y   E LL    P+   ++    P    +     ++LEAC+ L L+  +D  L+   ++S
1009 Sbjct:  1002 YLVLETLLISQIPVDTVVMAYTFPAIIYRLENSLISLEACQNLGLDIPIDIALIAMTKDS 1061
1010
1011 Query:   600 IAKLLEHIDEEPDEYAPGI 618
1012                   +H DE P  +  G+
1013 Sbjct:  1062 -DNSDDH-DEAPINFQSGM 1078
1014
1015  Score = 40 (19.1 bits), Expect = 3.5e-69, Sum P(6) = 3.5e-69
1016  Identities = 8/26 (30%), Positives = 13/26 (50%)
1017  Links = 1-4-5-(7)-3-2
1018
1019 Query:  1231 DQENQED-ENTPTNFPKTIDEEIEEL 1255
1020              D +N +D +  P NF   + +  E L
1021 Sbjct:  1060 DSDNSDDHDEAPINFQSGMGQNYERL 1085
1022
1023
1024 >sp|Q0CW42.2|DCL1_ASPTN RecName: Full=Dicer-like protein 1; Includes: RecName:
1025             Full=Endoribonuclease dcl1; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
1026             helicase dcl1
1027         Length = 1519
1028
1029  Score = 464 (168.4 bits), Expect = 4.8e-65, Sum P(6) = 4.8e-65
1030  Identities = 159/512 (31%), Positives = 242/512 (47%)
1031  Links = (1)-4-5-9-3-2
1032
1033 Query:    12 NPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEY-GVQLFAPLDQGGKR-AFFVV 69
1034              NPR+YQ+EL ++A  +NTI  L TGSGKT IAVLLLK     +L    +    R +FF+V
1035 Sbjct:   108 NPREYQIELFERAKVQNTIAVLDTGSGKTLIAVLLLKHVIQTELIDRANGNPPRISFFLV 167
1036
1037 Query:    70 EKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDLI 129
1038              + V LV QQA  +  +    V    G     LW+ +   + F K + V+V TA+ L   +
1039 Sbjct:   168 DSVTLVYQQASVLRNNLDQNVAHFFGAMGVDLWNKQTWAEHFEK-NMVIVCTAEILNQCL 226
1040
1041 Query:   130 RHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLTASLIKAKVA 189
1042               +AY+ ++ + +L+FDE HH     HPY  I+ D  L       PR+ G+TAS +  K
1043 Sbjct:   227 LNAYITMQQINLLVFDEAHHTK-KDHPYARIIRDSYLRVPPSSRPRIFGMTASPVDTK-- 283
1044
1045 Query:   190 PEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTVIE 249
1046                 ++E  + LE+ +DS I T S L  L +   +P E V I    +      P F + +
1047 Sbjct:   284 -GDVLEAARNLEALLDSKIATTSKLTILRQVVNRPNEEVWIYDKLQ------PTFTSDLY 336
1048
1049 Query:   250 IFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEKELGKI 309
1050                 E+         F     L+P        +  R    +LG W A R   VW   L
1051 Sbjct:   337 KLMES--------RFGDISHLEPM------FRFARHATSELGTWCADR---VWVSALADD 379
1052
1053 Query:   310 IKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIRLFEILETFN 369
1054              +  +V  + ++     + T +  + + +  ++ +IK    L    P       E L +
1055 Sbjct:   380 VLPKV--EGSIGGKRQS-TGLGQLPKDVHRDITRIKEASELVESHPPNDPGAPEALSSKV 436
1056
1057 Query:   370 PEFQKERMKLEKAE-HLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPDYVVGASGR 428
1058                  KE  +    E +   I+F ++RY A  L  +   +    P  +   P  ++G
1059 Sbjct:   437 RVLWKEISQCFGQETNTKCIVFTEKRYTAKVLFDLFTVLNV--PGLR---PGVLIG---- 487
1060
1061 Query:   429 NLASSDSQGLH---KRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPLDMR 485
1062               + SSD  G++   ++Q   + RF   EINCL AT+V EEG+D+  CNLV++FD    +
1063 Sbjct:   488 -VRSSDRIGMNVTFRQQILTMVRFRTGEINCLFATAVAEEGLDIPDCNLVVRFDLYKTLI 546
1064
1065 Query:   486 SYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKDTAAYCSKL 517
1066               YVQS+GRAR A S Y   +E KD A + S L
1067 Sbjct:   547 QYVQSRGRARHADSTYASMIE-KDNADHESIL 577
1068
1069  Score = 208 (78.3 bits), Expect = 4.8e-65, Sum P(6) = 4.8e-65
1070  Identities = 91/350 (26%), Positives = 148/350 (42%)
1071  Links = 1-4-5-9-3-(2)
1072
1073 Query:  1503 ISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQK--DQKSDVPSPLLRFIDTPT 1560
1074              +++K+IAD  EALIG  LLT GP         MG++ +    D      +    +I   +
1075 Sbjct:  1163 LAEKTIADVCEALIGAALLTPGPQHRFD----MGVRAVSAVVDSNEHNAASWRDYISLYS 1218
1076
1077 Query:  1561 NPNASLNFLNNLWQQFQFTQ-LEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINN--RVTGCYQRLE 1617
1078               P       +    +    + +EEK+GY F+    L  AFTH SY +   RV  CYQ LE
1079 Sbjct:  1219 IPKYQEQAPDG--SEIDLCRRVEEKLGYHFRYPRLLHSAFTHPSYPSAWARVP-CYQSLE 1275
1080
1081 Query:  1618 FLGDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCPGL 1677
1082              FLGDA+LD +    LF       P  LT+ + A+V+N    +LAVK     H       L
1083 Sbjct:  1276 FLGDALLDMVCVEDLFRRFPDRDPQWLTEHKMAMVSNKFLGALAVKLGLHTHLSYFSSAL 1335
1084
1085 Query:  1678 YHMIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKA-MGDIFESVAGAIY 1736
1086                 I  + +        ++   + + +T +             PK  + D+ E+  GA++
1087 Sbjct:  1336 QSQITHYAEEAQAAASQSDVAVDYWTLTQDP------------PKVCLPDMVEAYLGAVF 1383
1088
1089 Query:  1737 LDSG---RNLDTTWQV----IFHMMRGTIELCCANPPRSPIRELMEFEQSKVRFS-KMER 1788
1090              +DS      ++  +Q      FH M    +      P + +   +  E   + +  K
1091 Sbjct:  1384 VDSNFRFEEVEVFFQQHIKPYFHDM-AIYDTFANRHPTTFLHNKLTNEYGCLNYCLKAGE 1442
1092
1093 Query:  1789 IL----ESGKVRVTVEVVNNMRFTGMGRNYRIAKATAAKRALKYLHQIEQ 1834
1094              I     ++  V   V V + +  TG+  + R AK  A++ AL  L  I++
1095 Sbjct:  1443 IPGADGDASTVLAAVIVHDTILTTGVASSGRYAKVKASENALTELLHIDR 1492
1096
1097  Score = 94 (38.1 bits), Expect = 4.8e-65, Sum P(6) = 4.8e-65
1098  Identities = 25/74 (33%), Positives = 37/74 (50%)
1099  Links = 1-4-5-9-(3)-2
1100
1101 Query:  1344 GMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQL 1403
1102              G + ER E +GD FLK AT+  L++   D +E      R   + N NL+    K  + Q
1103 Sbjct:  1068 GKNYERLEFLGDCFLKMATSISLFNQHPDDNEFDYHVNRMCLICNRNLFNSAVKKELYQF 1127
1104
1105 Query:  1404 IVANKFDAHDSWLP 1417
1106              I +  F + D+W P
1107 Sbjct:  1128 IRSRGF-SRDTWYP 1140
1108
1109  Score = 85 (35.0 bits), Expect = 4.8e-65, Sum P(6) = 4.8e-65
1110  Identities = 27/82 (32%), Positives = 38/82 (46%)
1111  Links = 1-(4)-5-9-3-2
1112
1113 Query:   511 AAYCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTA 570
1114              A Y S L  +  T       ++P+ +     Y  E++LP  SPI+ A  +  P   K TA
1115 Sbjct:   639 ARYASSLQYENDTSAQVTYVVLPVND----AYVCEVILPEKSPIRGATGM--PAMKKSTA 692
1116
1117 Query:   571 QMAVALEACRQLHLEGELDDNL 592
1118              +   A EACR L     LD+ L
1119 Sbjct:   693 KRYAAFEACRLLRKHRLLDEYL 714
1120
1121  Score = 76 (31.8 bits), Expect = 4.8e-65, Sum P(6) = 4.8e-65
1122  Identities = 50/220 (22%), Positives = 88/220 (40%)
1123  Links = 1-4-(5)-9-3-2
1124
1125 Query:   692 IPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKKTTV--TAAQLQEIQLFHNYLFTQVLQMCKTGNLE 749
1126              +P+ P FP+FL + +++  ++  P    +  +A +L  +  F   +F  V +  KT + E
1127 Sbjct:   788 LPQFPTFPIFLGE-DVETIVLTVPVNMELQPSADELDYMTTFTLRIFRDVFR--KTYDKE 844
1128
1129 Query:   750 FDGTSNAPLNTLIVPLNKRKDDMSYTINMKYVSEVVANMENMPRIPKDEVRRQYKFNAED 809
1130               +      L  +  P N+  D     +N + +S V           +D++  Q     E
1131 Sbjct:   845 PEKLPYWLLPAISFPCNQEADPRD-VVNWEILSSVHE---------RDDIEYQADMPPEM 894
1132
1133 Query:   810 YKDAIVMPWYRNLEQPVFYYVAEILPEWRPSSKFPD-----THFETFNEYFIKKYK---- 860
1134                D  V   Y + +    Y+   +    +PSS  P       H +T   Y I   K
1135 Sbjct:   895 LVDRFV---YDHWDGRYRYFTLAVDENLQPSSPPPSHVARRRHMDTIMNYSISLSKNSRA 951
1136
1137 Query:   861 --LEIYDQNQSLLDVDFTSTRLNLLQPRIQNQPRRSRTVS 898
1138                L   + NQ +L  +    R NLL  R+ ++ R+  T S
1139 Sbjct:   952 KFLSRCNWNQPVLHAELVRLRRNLLD-RMTDKERKLETRS 990
1140
1141  Score = 49 (22.3 bits), Expect = 3.5e-58, Sum P(5) = 3.5e-58
1142  Identities = 20/74 (27%), Positives = 31/74 (41%)
1143  Links = 1-(6)-10-3-2
1144
1145 Query:  1028 ENDKIDDGEELFNIGVWDPEEAVRIGVEISSRDDRMDGEDQDTVGLTQGLHDGNISDEDD 1087
1146              E D  D   E   + V D E+ ++   ++   D  + G D DT        D  +  E+
1147 Sbjct:   567 EKDNAD--HESILVQVNDAEKIMQSFCQLLPEDRILHGNDDDT--------DAVLDREEW 616
1148
1149 Query:  1088 ELPFVMHDYTARLT 1101
1150              E P+ +    ARLT
1151 Sbjct:   617 EEPYTLPSTAARLT 630
1152
1153  Score = 41 (19.5 bits), Expect = 2.2e-58, Sum P(4) = 2.2e-58
1154  Identities = 8/16 (50%), Positives = 12/16 (75%)
1155  Links = 1-(7)-3-2
1156
1157 Query:   574 VALEACRQLHLEGELD 589
1158              + LEAC++L LE  L+
1159 Sbjct:  1025 IGLEACKKLGLEISLE 1040
1160
1161  Score = 39 (18.8 bits), Expect = 3.8e-57, Sum P(5) = 3.8e-57
1162  Identities = 15/79 (18%), Positives = 35/79 (44%)
1163  Links = 1-(8)-9-3-2
1164
1165 Query:   729 QLFHNYLFTQVLQMCKTGNLEFDGTSNAPLNTLIVPLNKRKDDMSYTINMKYVSEVVANM 788
1166              +L H+   T + +   +  L+++  ++A +  +++P+N   D     + +   S +
1167 Sbjct:   628 RLTHHSAITVLARYASS--LQYENDTSAQVTYVVLPVN---DAYVCEVILPEKSPI-RGA 681
1168
1169 Query:   789 ENMPRIPKDEVRRQYKFNA 807
1170                MP + K   +R   F A
1171 Sbjct:   682 TGMPAMKKSTAKRYAAFEA 700
1172
1173  Score = 38 (18.4 bits), Expect = 4.8e-65, Sum P(6) = 4.8e-65
1174  Identities = 10/37 (27%), Positives = 18/37 (48%)
1175  Links = 1-4-5-(9)-3-2
1176
1177 Query:   926 RQILVPELMDIHPISATLWNVIAALPSIFYRVNQLLL 962
1178              R ++  E + I  I A +     A P+I  R++  L+
1179 Sbjct:   989 RSVICIEPLKISAIPAAIAATCLAFPAIISRLDAYLI 1025
1180
1181  Score = 38 (18.4 bits), Expect = 6.7e-62, Sum P(5) = 6.7e-62
1182  Identities = 9/35 (25%), Positives = 18/35 (51%)
1183  Links = 1-4-(10)-3-2
1184
1185 Query:  1241 PTNFPKTIDEEIEELSIGARKKQEIDDNAAKTDVL 1275
1186              PT FP  + E++E + +      E+  +A + D +
1187 Sbjct:   792 PT-FPIFLGEDVETIVLTVPVNMELQPSADELDYM 825
1188
1189
1190 >sp|Q1DKI1.2|DCL1_COCIM RecName: Full=Dicer-like protein 1; Includes: RecName:
1191             Full=Endoribonuclease DCL1; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
1192             helicase DCL1
1193         Length = 1464
1194
1195  Score = 498 (180.4 bits), Expect = 8.4e-64, Sum P(6) = 8.4e-64
1196  Identities = 159/507 (31%), Positives = 260/507 (51%)
1197  Links = (1)-3-5-8-4-2
1198
1199 Query:    12 NPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQGGKR----AFF 67
1200              +PR+YQVEL +KA K N I  L TGSGKT IAVLLLK    Q    +D+  ++    +FF
1201 Sbjct:    98 DPREYQVELFEKAKKDNIIAVLDTGSGKTLIAVLLLKHIIEQEL--IDRSAEKPHRVSFF 155
1202
1203 Query:    68 VVEKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLD 127
1204              +V+ V LV QQA  ++ + + +V +  G   + LW+  E  ++ + ++ V+V TA+ L
1205 Sbjct:   156 LVDSVTLVFQQAAVLQNNINQRVDKFCGAMETDLWNG-ETWERHLAKNMVIVCTAEVLYQ 214
1206
1207 Query:   128 LIRHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLTASLIKAK 187
1208               + HA++K+E++ +LIFDE H+A    HPY  I+ D+ L   +   P++ G+TAS + AK
1209 Sbjct:   215 CLLHAFVKMENINLLIFDEAHNAK-KDHPYARIVKDFYLKDGNAKRPKIFGMTASPVDAK 273
1210
1211 Query:   188 VAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTV 247
1212              +    +++  + LE+ ++S I TAS+L  L +   +P E V              ++D +
1213 Sbjct:   274 M---DVVKAARNLETLLNSQIATASNLSLLRQSVPRPNEEVW-------------SYDRL 317
1214
1215 Query:   248 IEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAA-WRTAQVWEKEL 306
1216               + F ET  +    + F  DL     R ++     +      LG W A W    VW   L
1217 Sbjct:   318 DQPF-ETRLYKELRSRFG-DL-----RALEKLFTFSLKASSNLGAWCADW----VWSYAL 366
1218
1219 Query:   307 GKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSM--ITIKRLLEPE--MKKIKSI-EALRPY-VPQRVIR 360
1220               +    + LP    R    A+T+M  + I +++ PE  +++I+   E +R +      +R
1221 Sbjct:   367 TE----ESLPKLEGR---AARTAMGNLPIAKIVRPEAEIQRIREASEIIRSHKFGDPAVR 419
1222
1223 Query:   361 LFEILETFNPEFQKERMK-LEKAEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNP 419
1224                E+L         E +K  E+      I+F +QR+ A  L  +   I +     K + P
1225 Sbjct:   420 P-ELLSPKVRRLHHELLKYFERHTDTKCIVFTEQRHTARILCDLFSRIGT-----KHLRP 473
1226
1227 Query:   420 DYVVGASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFD 479
1228                ++G   R+ AS       ++Q   +  F + E+NCL ATSV EEG+D+  CNL+++FD
1229 Sbjct:   474 GVLIGV--RSDASGGMNISFRQQVLAVVSFRKGEVNCLFATSVAEEGLDIPDCNLIVRFD 531
1230
1231 Query:   480 RPLDMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVE 506
1232                  +  Y+QS+GRAR   S +   VE
1233 Sbjct:   532 LASTLTQYIQSRGRARHMNSTFAHLVE 558
1234
1235  Score = 218 (81.8 bits), Expect = 8.4e-64, Sum P(6) = 8.4e-64
1236  Identities = 68/241 (28%), Positives = 108/241 (44%)
1237  Links = 1-3-5-8-4-(2)
1238
1239 Query:  1503 ISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSDVP-SPLLRFIDTPTN 1561
1240              ++DK+IAD  EALIG   L    N    +       ++  D  + +      R    P
1241 Sbjct:  1115 LADKTIADVCEALIGACCLLASKNHRFDIAVKAVTALVSSDDHNVLNWEQYSRLYSIPKY 1174
1242
1243 Query:  1562 PNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINN--RVTGCYQRLEFL 1619
1244                A ++      +     Q+++K+GY FK    L  AFTH SY +   RV  CYQRLEFL
1245 Sbjct:  1175 QTAVVDAA----ELDLAAQVKKKLGYDFKYPKLLRSAFTHPSYPSAWARVP-CYQRLEFL 1229
1246
1247 Query:  1620 GDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCPGLYH 1679
1248              GDA+LD     +++       P  LT+ + A+V+N    S+AV+     H       L
1249 Sbjct:  1230 GDALLDMACVEHIYHKHPDKDPQWLTEHKMAMVSNKFLGSVAVRLGLHSHLNHFSTSLQS 1289
1250
1251 Query:  1680 MIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESVAGAIYLDS 1739
1252               I  +V+       ++    + + +T++             PK + D+ E+  GAI++DS
1253 Sbjct:  1290 QITNYVEEIEAAELESGDPPDAWTLTSDP------------PKCLPDMVEAYIGAIFIDS 1337
1254
1255 Query:  1740 G 1740
1256              G
1257 Sbjct:  1338 G 1338
1258
1259  Score = 75 (31.5 bits), Expect = 8.4e-64, Sum P(6) = 8.4e-64
1260  Identities = 20/52 (38%), Positives = 28/52 (53%)
1261  Links = 1-(3)-5-8-4-2
1262
1263 Query:   542 YCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELDDNLL 593
1264              +  E++LP  SPI+  IV K P   K  A+ + A E C  L   G LDD+ +
1265 Sbjct:   655 FVCEVVLPEKSPIR-GIVGK-PASKKLIAKQSAAFETCLLLRKHGLLDDHFV 704
1266
1267  Score = 66 (28.3 bits), Expect = 8.4e-64, Sum P(6) = 8.4e-64
1268  Identities = 28/84 (33%), Positives = 40/84 (47%)
1269  Links = 1-3-5-8-(4)-2
1270
1271 Query:  1308 IRQRSEEYVSHIDS--DIGLGVSPCLLLTALTT-SNAAD-------------GMSLERFE 1351
1272              I  R E Y+  +++  ++ L +SP L L ALT  S+  D             G + ER E
1273 Sbjct:  1005 IISRIESYLIALEACQELDLPISPELALEALTKDSDNTDEHRAQQIHFQRGMGKNYERLE 1064
1274
1275 Query:  1352 TIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHE 1375
1276               +GD FLK AT+  L+    D  E
1277 Sbjct:  1065 FLGDCFLKMATSISLFAMNPDNDE 1088
1278
1279  Score = 55 (24.4 bits), Expect = 8.4e-64, Sum P(6) = 8.4e-64
1280  Identities = 44/218 (20%), Positives = 88/218 (40%)
1281  Links = 1-3-(5)-8-4-2
1282
1283 Query:   687 LSAKEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKKT--TVTAAQLQEIQLFHNYLFTQVLQMCK 744
1284              L+ +++P  P FP++L + +++  +I +   +   V++  L+ +  F   +F  +
1285 Sbjct:   772 LTREKLPHFPEFPLYL-EDDIECDVICSSISSGFQVSSHDLEVLTTFTLRIFQDIFHKVY 830
1286
1287 Query:   745 TGNLEFDGTSNAPLN-TLIVPLNKRKDDMSYTINMKYVSEVVANMENMPRIPKDEVRRQY 803
1288                ++       APLN +  +  +  +D + + I +++V       +N P IP
1289 Sbjct:   831 DRDVGMMTYWLAPLNLSCDISSSASRDLLDWGI-LQFV------FDN-PEIPWSSSN--- 879
1290
1291 Query:   804 KFNAEDYKDAIVMPWYRNLEQPVFYYVAEILPEWRPSSKFPDT-----HFETFNEYFIKK 858
1292                +A  + +  V   Y   +    Y+   I P  RPS   P +     H     +Y +
1293 Sbjct:   880 --SAAFFANRFV---YDRWDGRYRYFTHGIDPSLRPSDPPPSSMARRRHMGNIMDYCLSL 934
1294
1295 Query:   859 YK------LEIYDQNQSLLDVDFTSTRLNLLQPRIQNQ 890
1296              +K      LE  D  Q ++  +    R NLL  R   +
1297 Sbjct:   935 FKNARKKFLENCDWTQPVIKAEIIQLRRNLLDKRTNKE 972
1298
1299  Score = 39 (18.8 bits), Expect = 4.1e-60, Sum P(4) = 4.1e-60
1300  Identities = 12/49 (24%), Positives = 24/49 (48%)
1301  Links = 1-(6)-4-2
1302
1303 Query:   957 VNQLLLTDELRETILVKAFGKEKTKLDDNVEWNSLAYATEYEEKQTIIV 1005
1304              V+ L  +D  R++  V+  G + T     V     A + +YE++ + +V
1305 Sbjct:   596 VDALYESDRNRKSYTVQTTGAKLTYSSSLVVLAHFANSLQYEKETSTVV 644
1306
1307  Score = 39 (18.8 bits), Expect = 2.0e-58, Sum P(3) = 2.0e-58
1308  Identities = 7/11 (63%), Positives = 10/11 (90%)
1309  Links = 1-(7)-2
1310
1311 Query:   574 VALEACRQLHL 584
1312              +ALEAC++L L
1313 Sbjct:  1014 IALEACQELDL 1024
1314
1315  Score = 37 (18.1 bits), Expect = 8.4e-64, Sum P(6) = 8.4e-64
1316  Identities = 9/20 (45%), Positives = 11/20 (55%)
1317  Links = 1-3-5-(8)-4-2
1318
1319 Query:   965 ELRETILVKAFGKEKTKLDD 984
1320              +LR  +L K   KEK K  D
1321 Sbjct:   959 QLRRNLLDKRTNKEKIKEGD 978
1322
1323
1324 >sp|A2RAF3.2|DCL1_ASPNC RecName: Full=Dicer-like protein 1; Includes: RecName:
1325             Full=Endoribonuclease dcl1; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
1326             helicase dcl1
1327         Length = 1525
1328
1329  Score = 466 (169.1 bits), Expect = 5.3e-62, Sum P(5) = 5.3e-62
1330  Identities = 154/501 (30%), Positives = 233/501 (46%)
1331  Links = (1)-4-5-3-2
1332
1333 Query:    12 NPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKE-YGVQLFAPLDQGGKR-AFFVV 69
1334              +PR+YQ+EL ++A  +NTI  L TGSGKT IAVLLLK     +L   ++    R AFF+V
1335 Sbjct:   116 DPREYQLELFERAKVQNTIAVLDTGSGKTLIAVLLLKHTLEKELNDRMEGKPHRIAFFLV 175
1336
1337 Query:    70 EKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDLI 129
1338              + V L  QQA  +  +    VG   G   + LW SK   DQ  +++ V+V TA+ L   +
1339 Sbjct:   176 DSVTLAYQQAAVLRNNLDQSVGHFFGAMGTDLW-SKSVWDQHFQKNMVIVCTAEILNQCL 234
1340
1341 Query:   130 RHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLTASLIKAKVA 189
1342               ++Y+K+  + +LIFDE HH     HPY  I+ D  L +     PR+ G+TAS I  K
1343 Sbjct:   235 LNSYIKMSQINILIFDEAHHTK-KDHPYARIIRDSYLEEVYSKRPRIFGMTASPIDTK-- 291
1344
1345 Query:   190 PEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTVIE 249
1346                 ++++  +LE  +DS I T S++  L +   +P E V              +F+ + +
1347 Sbjct:   292 -GDIVDEATRLEKLLDSRIATTSNMSLLRQVARRPVERVW-------------SFNKLEQ 337
1348
1349 Query:   250 IFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEKELGKI 309
1350               F  T  + +    F  D+       ++   +       +LG W + R    W + L
1351 Sbjct:   338 PF-ATSLYKHLEDRFG-DMAC-----LEGIFRFAWQASSELGRWCSDRA---WARALA-- 385
1352
1353 Query:   310 IKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIRLFEILETFN 369
1354                  VLP         A +   T   + E   K+I  I      V        E     +
1355 Sbjct:   386 --DDVLPKLEGSVRKTANSE--TSSNVPESAYKEILRITEASEIVKSYAFSSPETFGQLS 441
1356
1357 Query:   370 PEFQKERMKLEK----AEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPDYVVGA 425
1358              P+ Q  R +L +          I+F  +RY A  L  + + +        F+ P  ++G
1359 Sbjct:   442 PKVQVLREELARYFGRQTETKCIVFTQKRYTALILAELFQTLN-----IPFLRPGVLIGV 496
1360
1361 Query:   426 SGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPLDMR 485
1362                 +LA  +     ++Q   L +F   EINCL ATSV EEG+D+  CNLV++FD    +
1363 Sbjct:   497 RSGDLAGMNIT--FRQQFISLVKFRTGEINCLFATSVAEEGLDIPDCNLVVRFDLYQTLI 554
1364
1365 Query:   486 SYVQSKGRARRAGSRYVITVE 506
1366               YVQS+GRAR   S Y   VE
1367 Sbjct:   555 QYVQSRGRARHFNSTYASMVE 575
1368
1369  Score = 220 (82.5 bits), Expect = 5.3e-62, Sum P(5) = 5.3e-62
1370  Identities = 67/244 (27%), Positives = 112/244 (45%)
1371  Links = 1-4-5-3-(2)
1372
1373 Query:  1503 ISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKV-MNWMGLKVIQKDQKSDVPSPLLRFIDTPTN 1561
1374              +++K+IAD  EALIG  LL+ GP+    + +  +   V     K++     + F   P
1375 Sbjct:  1171 LAEKTIADVCEALIGAALLSGGPDHRFDMAVKAVTTLVNSPSHKAERWKDYISFYTIPKY 1230
1376
1377 Query:  1562 PNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNRV-TGCYQRLEFLG 1620
1378                 + +      + +   ++EEK+ YRF+    L  AFTH SY +      CYQRLEFLG
1379 Sbjct:  1231 QRRAADGA----ELYLSRKIEEKLSYRFRYPTLLGSAFTHPSYPSAWAKVPCYQRLEFLG 1286
1380
1381 Query:  1621 DAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCPGLYHM 1680
1382              D+++D +    LF       P  LT+ + A+V+N    +LAVK     H       L
1383 Sbjct:  1287 DSLIDMVCVEDLFARFPDRDPQWLTEHKMAMVSNKFLGALAVKLGLHTHLKYFSAPLQSQ 1346
1384
1385 Query:  1681 IEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESVAGAIYLDSG 1740
1386              I ++ +       ++    + + VT +             PK + D+ E+  GA+++DS
1387 Sbjct:  1347 ITQYAEEIQTAEGESEGAVDYWTVTKDP------------PKCLPDMVEAYVGAVFVDSD 1394
1388
1389 Query:  1741 RNLD 1744
1390               N +
1391 Sbjct:  1395 FNFE 1398
1392
1393  Score = 81 (33.6 bits), Expect = 5.3e-62, Sum P(5) = 5.3e-62
1394  Identities = 24/74 (32%), Positives = 33/74 (44%)
1395  Links = 1-4-5-(3)-2
1396
1397 Query:  1344 GMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQL 1403
1398              G + ER E +GD FLK AT+  L+    D  E      R   + N NL+       I +
1399 Sbjct:  1076 GRNYERLEFLGDCFLKMATSIALFTQNPDDDEFDYHVNRMCLICNKNLFNAAVDKEIYKY 1135
1400
1401 Query:  1404 IVANKFDAHDSWLP 1417
1402              I +  F  H +W P
1403 Sbjct:  1136 IRSRGFSRH-TWYP 1148
1404
1405  Score = 71 (30.1 bits), Expect = 5.3e-62, Sum P(5) = 5.3e-62
1406  Identities = 32/122 (26%), Positives = 52/122 (42%)
1407  Links = 1-(4)-5-3-2
1408
1409 Query:   474 LVIKFDRPLD---MRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKDTAAYCSKLPSDI-FTRLVPHN 529
1410              L+  FD  LD    +       R +  G++          A Y S L  +  F+  V +
1411 Sbjct:   606 LLYGFDHDLDTVLQKDEGNRTFRIKSTGAKLTYHSATAILARYASSLQYEKEFSAQVTY- 664
1412
1413 Query:   530 QIIPIEENGVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELD 589
1414               ++PI  NG   +  E++LP  SPI+   +  +P   K  A+ + A + C  L     LD
1415 Sbjct:   665 VVLPI--NGA--FVCEVILPEKSPIRG--LTGSPAMKKSIAKRSAAFDTCLLLRKNKLLD 718
1416
1417 Query:   590 DN 591
1418              D+
1419 Sbjct:   719 DH 720
1420
1421  Score = 52 (23.4 bits), Expect = 5.3e-62, Sum P(5) = 5.3e-62
1422  Identities = 12/52 (23%), Positives = 27/52 (51%)
1423  Links = 1-4-(5)-3-2
1424
1425 Query:   690 KEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAP--KKTTVTAAQLQEIQLFHNYLFTQV 739
1426              + +P  P FP+FL   +++  +I  P  K+  ++  ++  + +F   +F  V
1427 Sbjct:   793 ERLPHFPEFPIFL-DDDVETTIITTPLEKQLLLSEKEVDALTVFTLRVFRDV 843
1428
1429
1430 >sp|Q09884.1|DCR1_SCHPO RecName: Full=Protein Dicer; AltName: Full=Cell cycle
1431             control protein dcr1; AltName: Full=RNA interference pathway
1432             protein dcr1; Includes: RecName: Full=Endoribonuclease dcr1;
1433             Includes: RecName: Full=ATP-dependent helicase dcr1
1434         Length = 1374
1435
1436  Score = 415 (151.1 bits), Expect = 7.7e-61, Sum P(4) = 7.7e-61
1437  Identities = 147/509 (28%), Positives = 247/509 (48%)
1438  Links = (1)-4-3-2
1439
1440 Query:    14 RDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKE-YGVQLFAPLD--QGGKRAFFVVE 70
1441              R YQ ++ + A+K+NT++ + TG+GKT +AV L+K+    Q+       +  K + F+V
1442 Sbjct:    13 RKYQQDVYNIASKQNTLLVMRTGAGKTLLAVKLIKQKLEEQILIQESNLEHKKISVFLVN 72
1443
1444 Query:    71 KVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDLIR 130
1445              KV LV QQA +I      KVG  +G+ S  +  S++     + +++V+VITA      +
1446 Sbjct:    73 KVPLVFQQAEYIRSQLPAKVGMFYGELSIEM--SEQLLTNIILKYNVIVITADLFYLFLA 130
1447
1448 Query:   131 HAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYK------LLKKDKPVPRVLGLTASLI 184
1449                +L I D+ ++IFDECHHA+G+   Y  IM D+       L KK   +PR+ G+TAS
1450 Sbjct:   131 RGFLSINDLNLIIFDECHHAIGND-AYARIMNDFYHRAKAVLSKKHFTLPRIFGMTASPF 189
1451
1452 Query:   185 KAKVAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNF 244
1453                K     L  +L + E   DS     S+   L+ Y   P E  ++  +     L +P
1454 Sbjct:   190 TGKKG--NLYHRLYQWEQLFDSKAHVVSEN-ELADYFCLPEESYVMYSNK----LVVPPS 242
1455
1456 Query:   245 DTVIEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEK 304
1457              D++I+  +ET               L   + I  ++KT  A    +G W      QVW
1458 Sbjct:   243 DSIIKKCEET---------------LQGCKLISRAVKTALAETIDMGLWFG---EQVW-L 283
1459
1460 Query:   305 ELGKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRL-LEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIRLFE 363
1461               L   ++++ L  K L    ++    + I RL +  E  K        P +P     +F+
1462 Sbjct:   284 YLVDFVETKRLKKKALG-KQLSDDEELAIDRLKIFVEDWKNNKYSDNGPRIP-----VFD 337
1463
1464 Query:   364 ILETFNPEFQK-ERMKL--EKAEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPD 420
1465                +  +  F+  E +K    K++ +  +IFV+++  A++L L M+ +    P    +
1466 Sbjct:   338 STDVTDKVFKLLELLKATYRKSDSVRTVIFVERKATAFTLSLFMKTLNL--PN---IRAH 392
1467
1468 Query:   421 YVVGASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDR 480
1469                +G    +    +     +RQ + L +F   + N LIAT+V EEG+DV  CNLVI+F+
1470 Sbjct:   393 SFIGHGPSD--QGEFSMTFRRQKDTLHKFKTGKYNVLIATAVAEEGIDVPSCNLVIRFNI 450
1471
1472 Query:   481 PLDMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKD 509
1473                 +  YVQS+GRAR   S+++I +  ++
1474 Sbjct:   451 CRTVTQYVQSRGRARAMASKFLIFLNTEE 479
1475
1476  Score = 224 (83.9 bits), Expect = 7.7e-61, Sum P(4) = 7.7e-61
1477  Identities = 81/254 (31%), Positives = 123/254 (48%)
1478  Links = 1-4-3-(2)
1479
1480 Query:  1501 QHISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSDVPSPLLRFIDTPT 1560
1481              Q +S K IAD VEA IG  LL  G +  LK+   + + ++      +  +    + D  T
1482 Sbjct:  1015 QKLSVKRIADMVEASIGACLLDSGLDSALKICKSLSVGLLDISNWDEWNN----YFDLNT 1070
1483
1484 Query:  1561 NPNASLNFLNNLWQQFQFTQ-LEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNR-VTGCYQRLEF 1618
1485                ++    L N+  QF ++  +EE IGY FK +  L  AF H S ++ + +   YQ+LEF
1486 Sbjct:  1071 YADS----LRNV--QFPYSSYIEETIGYSFKNKKLLHLAFIHPSMMSQQGIYENYQQLEF 1124
1487
1488 Query:  1619 LGDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHF----IAMC 1674
1489              LGDAVLDY+I +YL++     + G LTD +S  V N   + +       K+      AMC
1490 Sbjct:  1125 LGDAVLDYIIVQYLYKKYPNATSGELTDYKSFYVCNKSLSYIGFVLNLHKYIQHESAAMC 1184
1491
1492 Query:  1675 PGLYH---MIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESV 1731
1493                ++    +IE F +  SE       N   +      EID         PK + D  E++
1494 Sbjct:  1185 DAIFEYQELIEAFRETASE-------NPWFWF-----EIDS--------PKFISDTLEAM 1224
1495
1496 Query:  1732 AGAIYLDSGRNLDT 1745
1497                AI+LDSG +L +
1498 Sbjct:  1225 ICAIFLDSGFSLQS 1238
1499
1500  Score = 118 (46.6 bits), Expect = 7.7e-61, Sum P(4) = 7.7e-61
1501  Identities = 34/136 (25%), Positives = 61/136 (44%)
1502  Links = 1-4-(3)-2
1503
1504 Query:  1282 VLPVAINEKSRSFSFEKESKAINGRLIRQRSEEYVSHIDSDIGLGVSPCLLLTALTTSNA 1341
1505              +LPV+ + K+ +         I   L+   +  ++ H   D  +  + C    ALT++ +
1506 Sbjct:   871 ILPVSRHLKNSALLIPSILYHIENLLV---ASSFIEHFRLDCKIDTA-C---QALTSAES 923
1507
1508 Query:  1342 ADGMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIP 1401
1509                    +R E  GD FLK   +  ++    D  E +L F R K +SNCNLY++     +P
1510 Sbjct:   924 QLNFDYDRLEFYGDCFLKLGASITVFLKFPDTQEYQLHFNRKKIISNCNLYKVAIDCELP 983
1511
1512 Query:  1402 QLIVANKFDAHDSWLP 1417
1513              +  ++   +    W P
1514 Sbjct:   984 KYALSTPLEIRH-WCP 998
1515
1516  Score = 73 (30.8 bits), Expect = 7.7e-61, Sum P(4) = 7.7e-61
1517  Identities = 32/104 (30%), Positives = 43/104 (41%)
1518  Links = 1-(4)-3-2
1519
1520 Query:   513 YCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQM 572
1521              +C+ L  D++TR  P     P        YC E+ LP     K      +P  + + A+
1522 Sbjct:   544 FCNTLSRDVYTRYYPTFTAQPCLSGW---YCFEVELP--KACKVPAAQGSPAKSIRKAKQ 598
1523
1524 Query:   573 AVALEACRQLHLEGELDDNLLPKG-RESIAKL--LEHIDEEPDE 613
1525                A   C  L   G +D +L P   R  IA L  LE  DE  DE
1526 Sbjct:   599 NAAFIMCLDLIRMGLIDKHLKPLDFRRKIADLETLEE-DELKDE 641
1527
1528  Score = 66 (28.3 bits), Expect = 1.9e-55, Sum P(4) = 1.9e-55
1529  Identities = 18/51 (35%), Positives = 25/51 (49%)
1530  Links = 1-4-(5)-2
1531
1532 Query:   919 SVPHSSQ-RQILVPELMDIHPISATLWNVIAALPSIFYRVNQLLLTDELRE 968
1533              S+P S Q R   + +L  I P+S  L N    +PSI Y +  LL+     E
1534 Sbjct:   854 SIPKSQQVRSFYINDLY-ILPVSRHLKNSALLIPSILYHIENLLVASSFIE 903
1535
1536  Score = 57 (25.1 bits), Expect = 4.2e-52, Sum P(3) = 4.2e-52
1537  Identities = 21/72 (29%), Positives = 29/72 (40%)
1538  Links = 1-(6)-2
1539
1540 Query:  1324 GLGVSPCLLLTALTTSNAADG--MSLERFETIGDSFLKFATTD-YLYHTLLDQHEGKLSF 1380
1541              G+ V  C L+              S  R   +   FL F  T+  L H  +   E  L F
1542 Sbjct:   436 GIDVPSCNLVIRFNICRTVTQYVQSRGRARAMASKFLIFLNTEELLIHERILHEEKNLKF 495
1543
1544 Query:  1381 ARSKEVSNCNLY 1392
1545              A S E+SN N++
1546 Sbjct:   496 ALS-ELSNSNIF 506
1547
1548  Score = 56 (24.8 bits), Expect = 4.5e-59, Sum P(4) = 4.5e-59
1549  Identities = 19/66 (28%), Positives = 36/66 (54%)
1550  Links = 1-(7)-3-2
1551
1552 Query:   499 SRYVITVEEKDTA--AYCSKLPSDIFTRLVPHN-QIIPIEENGVTKYCAEL-LLPINSPI 554
1553              S ++I  ++KD A  A C KLP  +   L  +  + IP  +   + Y  +L +LP++  +
1554 Sbjct:   819 SEFMIPAKKKDKAPSALCKKLPLRLNYSLWGNRAKSIPKSQQVRSFYINDLYILPVSRHL 878
1555
1556 Query:   555 KHAIVL 560
1557              K++ +L
1558 Sbjct:   879 KNSALL 884
1559
1560
1561 >sp|A1CBC9.2|DCL1_ASPCL RecName: Full=Dicer-like protein 1; Includes: RecName:
1562             Full=Endoribonuclease dcl1; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
1563             helicase dcl1
1564         Length = 1534
1565
1566  Score = 428 (155.7 bits), Expect = 1.2e-60, Sum P(6) = 1.2e-60
1567  Identities = 151/514 (29%), Positives = 241/514 (46%)
1568  Links = (1)-4-5-7-3-2
1569
1570 Query:    12 NPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQGGKR---AFFV 68
1571              +PR+YQ+EL ++A  +NTI  L TGSGKT IAVLLL+   +Q        GK    +FF+
1572 Sbjct:   122 DPREYQIELFERAKAQNTIAVLDTGSGKTLIAVLLLRHV-LQNELNDRANGKPHRVSFFL 180
1573
1574 Query:    69 VEKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDL 128
1575              V+ V L  QQA  +  +    V    G   + LWD ++  ++ ++++ V+V TA+ L
1576 Sbjct:   181 VDSVTLAYQQAAVLRNNIDQNVAHFFGAMGTDLWD-RQVWEEHLQQNMVIVCTAEILNQC 239
1577
1578 Query:   129 IRHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPV-PRVLGLTASLIKAK 187
1579              + ++++++  + +LIFDE HH     HPY  I+ D    K   P  PR+ G+TAS I  K
1580 Sbjct:   240 LLNSHVRMNQINLLIFDEAHHTK-KDHPYARIIRD-SYFKASPPQRPRIFGMTASPIDTK 297
1581
1582 Query:   188 VAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTV 247
1583                   ++    +LE+ +DS I T S +  L +  ++P E V     +    L  P F T
1584 Sbjct:   298 ---GDIIAAATRLETLLDSRIATTSKITLLRQVVSRPIEKV-----WAYDRLESP-FKTN 348
1585
1586 Query:   248 IEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEKELG 307
1587              +    E   F N              + ++   +       +LG W + R    W   L
1588 Sbjct:   349 LHKLMEN-RFGNV-------------KALEGVFRFAWYASSELGRWCSDRA---WLYALA 391
1589
1590 Query:   308 KIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIRLFEILET 367
1591                    VLP        +A+++    +R  +   K+I  I+     V        E
1592 Sbjct:   392 ----DDVLPKLEGHVNKLAESTAAATER--DMAFKEITLIKEASNIVKAHTFNDPEFPGE 445
1593
1594 Query:   368 FNPEFQKERMKLEK----AEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPDYVV 423
1595               +P+ +  + +L K    A     IIF  +RY A +L  +   +    P  +   P  ++
1596 Sbjct:   446 LSPKVRLLQTELSKHFSHAPETKCIIFTQKRYTAKTLHELFTILSI--PHLR---PGVLI 500
1597
1598 Query:   424 GASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPLD 483
1599              G    ++   +     ++Q   L +F + EINCL ATSV EEG+D+  CNLV++FD
1600 Sbjct:   501 GVRSGDIGGMNIT--FRQQFLALVKFRKGEINCLFATSVAEEGLDIPDCNLVVRFDLYHT 558
1601
1602 Query:   484 MRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKDTAAYCSKL 517
1603              +  YVQS+GRAR   S Y   VE KD + + ++L
1604 Sbjct:   559 LIQYVQSRGRARHYHSTYASMVE-KDNSDHEARL 591
1605
1606  Score = 244 (91.0 bits), Expect = 1.2e-60, Sum P(6) = 1.2e-60
1607  Identities = 85/261 (32%), Positives = 122/261 (46%)
1608  Links = 1-4-5-7-3-(2)
1609
1610 Query:  1497 LLTQ-QH-ISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQK--DQKSDVPSPL 1552
1611              +L+Q +H + +K+IAD  EALIG  LL+ GP         MG+K +    D  S   S
1612 Sbjct:  1170 MLSQAKHALGEKTIADVCEALIGACLLSGGPEHRFD----MGVKAVSVFVDSPSHAVSRW 1225
1613
1614 Query:  1553 LRFIDTPTNPNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINN---RV 1609
1615                +I     PN  +             Q+EEK+GY F+    L  A TH S  +    RV
1616 Sbjct:  1226 KEYIGLYKPPNYQVRKAEGAETNLAL-QVEEKLGYHFRYPRLLCSAVTHPSTPSTWYFRV 1284
1617
1618 Query:  1610 TGCYQRLEFLGDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKH 1669
1619                CYQRLEFLGD++LD +    LF       P  LT+ + A+V+N    +LAVK  F KH
1620 Sbjct:  1285 P-CYQRLEFLGDSLLDMVCVEDLFHRFPDRDPQWLTEHKMAMVSNKFLGALAVKLGFHKH 1343
1621
1622 Query:  1670 FIAMCPGLYHMIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFE 1729
1623                A    L   I  +V+       ++   A  Y V  ++            PK + D+ E
1624 Sbjct:  1344 IKAFSNPLQAQITYYVEEIETAEAESE-GAVDYWVVAKDP-----------PKCLPDMVE 1391
1625
1626 Query:  1730 SVAGAIYLDSGRNLDTTWQVI 1750
1627              +  GAI++DS    D +++VI
1628 Sbjct:  1392 AYLGAIFVDS----DFSFEVI 1408
1629
1630  Score = 93 (37.8 bits), Expect = 1.2e-60, Sum P(6) = 1.2e-60
1631  Identities = 26/74 (35%), Positives = 34/74 (45%)
1632  Links = 1-4-5-7-(3)-2
1633
1634 Query:  1344 GMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQL 1403
1635              G + ER E +GD FLK AT+  L+    D  E      R   + N NL+   KK  I +
1636 Sbjct:  1083 GKNYERLEFLGDCFLKMATSIALFTQNPDDDEFDYHVNRMCLICNKNLFNTAKKRQIYRY 1142
1637
1638 Query:  1404 IVANKFDAHDSWLP 1417
1639              I +  F  H  W P
1640 Sbjct:  1143 IRSRSFSRH-VWYP 1155
1641
1642  Score = 66 (28.3 bits), Expect = 1.2e-60, Sum P(6) = 1.2e-60
1643  Identities = 31/113 (27%), Positives = 48/113 (42%)
1644  Links = 1-(4)-5-7-3-2
1645
1646 Query:   483 DMRSYVQ-SKGR----ARRAGSRYVITVEEKDTAAYCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEEN 537
1647              D+ S +Q  +GR     +  G+R          A Y S L  +  T   P    + ++
1648 Sbjct:   620 DLDSLLQHEEGRRTFTVKSTGARLTYHSAIAILARYASSLQYEKET--TPQATYV-VQSV 676
1649
1650 Query:   538 GVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELDD 590
1651              G T  C E++LP  SPI+   +  +P   K  A+ + A + C  L     LDD
1652 Sbjct:   677 GNTYVC-EVILPEKSPIRG--LTGSPAIRKSIAKQSAAFDTCLLLRRHKLLDD 726
1653
1654  Score = 50 (22.7 bits), Expect = 1.2e-60, Sum P(6) = 1.2e-60
1655  Identities = 12/55 (21%), Positives = 31/55 (56%)
1656  Links = 1-4-(5)-7-3-2
1657
1658 Query:   687 LSAKEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKKT--TVTAAQLQEIQLFHNYLFTQV 739
1659              L+ +++P  P FP++L + +++ +++     T   ++A +L+ +  F   +F  V
1660 Sbjct:   797 LTREKLPDFPAFPIYLDE-DIETKVVPRSLDTGMELSAEELRALTTFTLRIFRDV 850
1661
1662  Score = 45 (20.9 bits), Expect = 4.1e-54, Sum P(3) = 4.1e-54
1663  Identities = 39/168 (23%), Positives = 66/168 (39%)
1664  Links = 1-(6)-2
1665
1666 Query:  1232 QENQEDENTPTNFPKTIDEEIEELSIGARKKQEID-----DNAAKTDVLERENCEVL--- 1283
1667              +E +E E T  NF +T+ E+   +  G     ++D     +   +T  ++     +
1668 Sbjct:   592 REVREAEKTMQNFCETLPED--RILHG--NDHDLDSLLQHEEGRRTFTVKSTGARLTYHS 647
1669
1670 Query:  1284 PVAINEK-SRSFSFEKESKAINGRLIRQRSEEYVSHI----DSDI-GLGVSPCLLLTALT 1337
1671               +AI  + + S  +EKE+      +++     YV  +     S I GL  SP +  +
1672 Sbjct:   648 AIAILARYASSLQYEKETTPQATYVVQSVGNTYVCEVILPEKSPIRGLTGSPAIRKSIAK 707
1673
1674 Query:  1338 TSNAADGMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLD-QHEGKLSFARSK 1384
1675               S A D   L R   + D F K      +YH  L      KL+    K
1676 Sbjct:   708 QSAAFDTCLLLRRHKLLDDFFKS-----IYHKRLPAMRNAKLAITSKK 750
1677
1678  Score = 44 (20.5 bits), Expect = 1.2e-60, Sum P(6) = 1.2e-60
1679  Identities = 17/61 (27%), Positives = 30/61 (49%)
1680  Links = 1-4-5-(7)-3-2
1681
1682 Query:   932 ELMDIHPISATLWNVIAALPSIFYRVNQLLLT----DELRETILVKAFGKEK-TKLDDNV 986
1683              E + I  I  ++ +   A P+I  R++  L++    DEL + ++   +  E  TK  DN
1684 Sbjct:  1010 EPLKISAIPPSIASTCLAFPAIITRLDSYLISIEACDEL-DLVIRSDYALEAVTKDSDNT 1068
1685
1686 Query:   987 E 987
1687              E
1688 Sbjct:  1069 E 1069
1689
1690  Score = 39 (18.8 bits), Expect = 6.9e-58, Sum P(4) = 6.9e-58
1691  Identities = 19/76 (25%), Positives = 31/76 (40%)
1692  Links = 1-(8)-3-2
1693
1694 Query:   933 LMDIHPISATLWNVIAALPS--IFYR----VNQLLLTDELRETILVKAFGKEKTKLDDNV 986
1695              L ++     T+ N    LP   I +     ++ LL  +E R T  VK+ G   T
1696 Sbjct:   591 LREVREAEKTMQNFCETLPEDRILHGNDHDLDSLLQHEEGRRTFTVKSTGARLTYHSAIA 650
1697
1698 Query:   987 EWNSLAYATEYEEKQT 1002
1699                   A + +YE++ T
1700 Sbjct:   651 ILARYASSLQYEKETT 666
1701
1702
1703 >sp|A1DE13.1|DCL1_NEOFI RecName: Full=Dicer-like protein 1; Includes: RecName:
1704             Full=Endoribonuclease dcl1; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
1705             helicase dcl1
1706         Length = 1538
1707
1708  Score = 457 (165.9 bits), Expect = 1.6e-60, Sum P(6) = 1.6e-60
1709  Identities = 157/517 (30%), Positives = 237/517 (45%)
1710  Links = (1)-4-6-5-3-2
1711
1712 Query:    12 NPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQ--GGKR---AF 66
1713              +PR+YQ+EL ++A  +NTI  L TGSGKT IAVLLL+     +   LD    GK    +F
1714 Sbjct:   126 DPREYQIELFERAKTQNTIAVLDTGSGKTLIAVLLLRH---TILNELDNRANGKPHRVSF 182
1715
1716 Query:    67 FVVEKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLL 126
1717              F+V+ V L  QQA  +  +    V    G   + LWD K   D+ ++R+ V+V TA+ L
1718 Sbjct:   183 FLVDSVTLAYQQAAVLRNNIDQNVAHFFGAMGTDLWD-KRTWDEHLQRNMVIVCTAEILN 241
1719
1720 Query:   127 DLIRHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLTASLIKA 186
1721                + ++Y+K++ + +LIFDE HHA    HPY  I+ D     +    PRV G+TAS I
1722 Sbjct:   242 QCLLNSYVKMDQINLLIFDEAHHAK-KDHPYARIIRDSYFKAQPSQRPRVFGMTASPIDT 300
1723
1724 Query:   187 KVAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDT 246
1725              K     + E   +LE+ +DS I T S +  L +  ++P E V     +    L  P
1726 Sbjct:   301 K---GDITEAATRLETLLDSRIATTSKITLLREVVSRPIEKV-----WAYNRLESPFATE 352
1727
1728 Query:   247 VIEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEKEL 306
1729              + ++ D     +                 ++   +       +LG W + R    W   L
1730 Sbjct:   353 LYKLMDTRYGNIKV---------------LEGVYRFAWHASSELGKWCSDRA---WWHAL 394
1731
1732 Query:   307 GKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIRLFEILE 366
1733                     VLP        + +++ +  +       K I  I      V        E+
1734 Sbjct:   395 A----DDVLPKLEGNISKLVESNTLNAEH--GAVFKDIIRIREASETVKNYSFADPELPG 448
1735
1736 Query:   367 TFNPEFQKERMKLEKAEHLS------AIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPD 420
1737                +P+ Q  RM+L K  H S       I+F  +RY A  L  +   +    P  +   P
1738 Sbjct:   449 ELSPKVQLLRMELSK--HFSDTTGTKCIVFTQKRYTAKILNELFTVLNI--PHLR---PG 501
1739
1740 Query:   421 YVVGASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDR 480
1741               ++G    ++   +     ++Q   L +F   EINCL ATSV EEG+D+  CNLV++FD
1742 Sbjct:   502 VLIGVRPGDIGGMNVT--FRQQFLALVKFRTGEINCLFATSVAEEGLDIPDCNLVVRFDL 559
1743
1744 Query:   481 PLDMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKDTAAYCSKL 517
1745                 +  YVQS+GRAR   S Y I VE KD A +  +L
1746 Sbjct:   560 YRTLIQYVQSRGRARHCTSTYAIMVE-KDNAEHEGRL 595
1747
1748  Score = 210 (79.0 bits), Expect = 1.6e-60, Sum P(6) = 1.6e-60
1749  Identities = 74/248 (29%), Positives = 111/248 (44%)
1750  Links = 1-4-6-5-3-(2)
1751
1752 Query:  1497 LLTQ-QH-ISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSDVPSPLLR 1554
1753              LL++ +H + +K+IAD  EALIG  LL+ GP     +       ++  D  S   S
1754 Sbjct:  1174 LLSEGKHALGEKTIADVCEALIGASLLSGGPENRFDMATKAVTALV--DSPSHRVSCWKE 1231
1755
1756 Query:  1555 FIDTPTNPNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINN---RVTG 1611
1757              +I   T P                  +EE++GY F     L  A TH S  +    RV
1758 Sbjct:  1232 YITLYTMPKYQTEKPRGSEDDLA-RHVEEELGYHFTYPRLLASAITHPSLPSTWGYRVP- 1289
1759
1760 Query:  1612 CYQRLEFLGDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFI 1671
1761              CYQRLEFLGD++LD +    LF       P  LT+ + A+V+N    +L+VK  F +  +
1762 Sbjct:  1290 CYQRLEFLGDSLLDMVCVEDLFRRFPDRDPQWLTEHKMAMVSNKFLGALSVKLGFHRRIM 1349
1763
1764 Query:  1672 AMCPGLYHMIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESV 1731
1765              A    L   I  +V+       ++   A  Y V  ++            PK + D+ E+
1766 Sbjct:  1350 AFSNPLQAQITHYVEEIESAQAESR-GAVDYWVVAKDP-----------PKCLPDMVEAY 1397
1767
1768 Query:  1732 AGAIYLDS 1739
1769               GAI++DS
1770 Sbjct:  1398 LGAIFVDS 1405
1771
1772  Score = 87 (35.7 bits), Expect = 1.6e-60, Sum P(6) = 1.6e-60
1773  Identities = 26/74 (35%), Positives = 33/74 (44%)
1774  Links = 1-4-6-5-(3)-2
1775
1776 Query:  1344 GMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQL 1403
1777              G + ER E +GD FLK AT+  LY    D  E      R   + N NL+    K  I +
1778 Sbjct:  1087 GKNYERLEFLGDCFLKMATSIALYTQNPDDDEFDYHVNRMCLICNKNLFNTAIKKQIYRY 1146
1779
1780 Query:  1404 IVANKFDAHDSWLP 1417
1781              I +  F  H  W P
1782 Sbjct:  1147 IRSRGFSRH-IWYP 1159
1783
1784  Score = 65 (27.9 bits), Expect = 1.6e-60, Sum P(6) = 1.6e-60
1785  Identities = 24/80 (30%), Positives = 36/80 (45%)
1786  Links = 1-(4)-6-5-3-2
1787
1788 Query:   511 AAYCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTA 570
1789              A Y S L  +  T  VP  Q+  +  +    Y  E++LP  SPI+   +  +P   K  A
1790 Sbjct:   657 ARYASSLQYEKET--VP--QVTYVVGHVSNAYVCEVILPEKSPIRG--LTGSPAIRKAVA 710
1791
1792 Query:   571 QMAVALEACRQLHLEGELDD 590
1793              + + A + C  L     LDD
1794 Sbjct:   711 KQSAAFDTCLLLRKHRLLDD 730
1795
1796  Score = 52 (23.4 bits), Expect = 1.6e-60, Sum P(6) = 1.6e-60
1797  Identities = 35/136 (25%), Positives = 48/136 (35%)
1798  Links = 1-4-6-(5)-3-2
1799
1800 Query:  1108 GAWSGSESIVPSGWGDWDGPE--PDNSPMPFQILGGPGGLNVQALMADV--GRVFDPSTA 1163
1801              G  SG+    P  W DWD      +N  +PF     P  L V   + D   GR F   T
1802 Sbjct:   878 GPGSGTN---PRDWTDWDTVSFVHNNDEIPFTRDLNPDSL-VNRFIFDNWDGR-FRYFTV 932
1803
1804 Query:  1164 SSSLSQTVQESTVSPPKQLTKEEEQFKKLQNDLLKQAKERLEALEMSEDMEKPRRLEDTV 1223
1805              +  ++ T+Q S   PP            + N  L  +K          D  +P    + V
1806 Sbjct:   933 A--VADTLQPSDPPPPS--VPRRRHMNNIMNYTLSLSKNSRARFFSGCDWNQPVLQAELV 988
1807
1808 Query:  1224 NLE-DYGDDQENQEDE 1238
1809               L  +  D    QE E
1810 Sbjct:   989 RLRRNLLDKMTTQEKE 1004
1811
1812  Score = 51 (23.0 bits), Expect = 1.6e-60, Sum P(6) = 1.6e-60
1813  Identities = 11/55 (20%), Positives = 31/55 (56%)
1814  Links = 1-4-(6)-5-3-2
1815
1816 Query:   687 LSAKEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKK--TTVTAAQLQEIQLFHNYLFTQV 739
1817              L+ +++P+ P F ++L + +++ +++  P K    ++  +LQ +  F   +F  +
1818 Sbjct:   801 LTREKLPEFPAFSIYLDE-DVETKVLSYPLKHGLQISVDELQSLTTFTLRIFRDI 854
1819
1820  Score = 46 (21.3 bits), Expect = 5.2e-60, Sum P(6) = 5.2e-60
1821  Identities = 16/48 (33%), Positives = 24/48 (50%)
1822  Links = 1-4-(7)-5-3-2
1823
1824 Query:   824 QPVFYYVAEILPEWRPSSKFPDTHFETFNEYFIKKYKLEI-YDQNQSL 870
1825              +P+     E LPE+   S + D   ET    +  K+ L+I  D+ QSL
1826 Sbjct:   796 RPILLLTREKLPEFPAFSIYLDEDVETKVLSYPLKHGLQISVDELQSL 843
1827
1828  Score = 39 (18.8 bits), Expect = 7.3e-57, Sum P(4) = 7.3e-57
1829  Identities = 17/46 (36%), Positives = 22/46 (47%)
1830  Links = 1-(8)-3-2
1831
1832 Query:   543 CAELLLPIN-SPIKHAIV---LKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHL 584
1833              CAE   P+  S I  +IV   L  P    +     +ALEAC +L L
1834 Sbjct:  1012 CAE---PLRISAIPTSIVSTCLAFPAIISRLDSYLIALEACDELEL 1054
1835
1836
1837 >sp|Q2VF19.1|DCL1_CRYPA RecName: Full=Dicer-like protein 1; Includes: RecName:
1838             Full=Endoribonuclease DCL-1; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
1839             helicase DCL-1
1840         Length = 1548
1841
1842  Score = 465 (168.7 bits), Expect = 4.2e-60, Sum P(4) = 4.2e-60
1843  Identities = 146/501 (29%), Positives = 246/501 (49%)
1844  Links = (1)-4-3-2
1845
1846 Query:    12 NPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQGGKR--AFFVV 69
1847              +PRDYQ+EL ++A ++NTI  L TGSGKT IA LLL     Q      +G  R  AFF+V
1848 Sbjct:    98 SPRDYQMELFERAKQQNTIAVLDTGSGKTLIAALLLDHTVNQELEDRAKGLPRRIAFFLV 157
1849
1850 Query:    70 EKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDLI 129
1851              EKV L  QQ   +E + +  V    G++    W +K   +  +  H V+V TA+ L   +
1852 Sbjct:   158 EKVALAFQQHAVLECNLAHSVAVFSGESIKNTW-TKGFWETQLADHEVIVCTAEILNQCL 216
1853
1854 Query:   130 RHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPV--PRVLGLTASLIKAK 187
1855              ++AY++I+ + +L+FDE HH     HPY  I+ DY    KD+ +  PR+ G+TAS + A
1856 Sbjct:   217 QYAYIRIDQINLLVFDEAHHTK-KNHPYARIIKDYYASGKDRGLRLPRIFGMTASPVDAL 275
1857
1858 Query:   188 VAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTV 247
1859              +    + +   +LE  + S I T +D  +L +   +P + +I              ++ +
1860 Sbjct:   276 I---DVRQAAIELEGLLHSRIATTADPDALRRAVGRPKKEIIY------------KYNPL 320
1861
1862 Query:   248 IEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEKELG 307
1863              ++     + F     +  P L +   +    +   + A  R+LG W   R  Q++ ++
1864 Sbjct:   321 VKPIQTMLTF-----KLRP-L-IANNKQFSKAFAFSEAAARELGTWFVDRMWQLFLED-E 372
1865
1866 Query:   308 KIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKR-LLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIRLFEILE 366
1867              +++K +   +++L   +MA   ++   R  +    + I+S E  +P  P  +    + L
1868 Sbjct:   373 ELLKLEAKTERSLS-KDMAAPEVVEKHRNAVRSARELIRSHEFPKPE-PGLLSSKLKTLS 430
1869
1870 Query:   367 TFNPEFQKERMKLEKAEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPDYVVGA- 425
1871                  E+  +         +  I+FV++R+ A    L+    +S   +     P   VG+
1872 Sbjct:   431 KLLEEYFTD-------SSIRCIVFVERRWTAK---LLTDFFESHAAEI----PGLKVGSL 476
1873
1874 Query:   426 SGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPLDMR 485
1875               G N     SQ   + Q   +  F +   NC+ ATSV EEG+D+  CNL+I+FD    M
1876 Sbjct:   477 MGANAEGGSSQTSFREQIRTILSFKKGNTNCIFATSVAEEGLDIPDCNLIIRFDICKTMI 536
1877
1878 Query:   486 SYVQSKGRARRAGSRYVITVE 506
1879               Y+QS+GRAR+A S Y+  +E
1880 Sbjct:   537 QYIQSRGRARQADSTYIHLIE 557
1881
1882  Score = 204 (76.9 bits), Expect = 4.2e-60, Sum P(4) = 4.2e-60
1883  Identities = 72/260 (27%), Positives = 111/260 (42%)
1884  Links = 1-4-3-(2)
1885
1886 Query:  1498 LTQQHISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSDVPSPLLRFID 1557
1887              + +  ++DKSIAD  EALIG   +T   +    +      +++   Q      P+ ++ D
1888 Sbjct:  1171 MDEHRLADKSIADVCEALIGAAYMTTRKHDDYDLAVRAVTRLVNHKQH-----PMTKWDD 1225
1889
1890 Query:  1558 ---TPTNPNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHAS--YINNRVTGC 1612
1891                     P        N  +     ++ E  GY+FK    L  AF H S  Y+ ++V
1892 Sbjct:  1226 YHAAYVMPGWQ-TMPANAAELDMAQKIHEATGYQFKHPRVLRSAFRHPSRPYVFDKVPH- 1283
1893
1894 Query:  1613 YQRLEFLGDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIA 1672
1895              YQRLEFLGDA+ D     YLF  +    P  LT+ + A+V+N     LAV   F K  +
1896 Sbjct:  1284 YQRLEFLGDALFDMACVDYLFHIAPDEGPQWLTEHKMAMVSNQFLGCLAVSLGFHKFILH 1343
1897
1898 Query:  1673 MCPGLYHMIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESVA 1732
1899                  +   I ++V   +E        AE           +   E  + PK + D+ E+
1900 Sbjct:  1344 HHASIGSQIHEYVTEITEARRAAEDAAEAAGKPRSAYSRDYWVEAPQPPKCIPDVLEAYV 1403
1901
1902 Query:  1733 GAIYLDSGRNLDTTWQVIFH 1752
1903              GAI++DS  +     Q  FH
1904 Sbjct:  1404 GAIFVDSKYDYSVVQQ-FFH 1422
1905
1906  Score = 90 (36.7 bits), Expect = 4.2e-60, Sum P(4) = 4.2e-60
1907  Identities = 24/76 (31%), Positives = 39/76 (51%)
1908  Links = 1-4-(3)-2
1909
1910 Query:  1344 GMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKK--LGIP 1401
1911              G + ER E +GDSFLK ATT  ++  + ++ E      R   + N NL+ + K   L +
1912 Sbjct:  1080 GANYERLELLGDSFLKMATTIAVFTLIPNKDEFDYHCERMVMICNQNLFGVAKSDDLKLH 1139
1913
1914 Query:  1402 QLIVANKFDAHDSWLP 1417
1915              + I +  F+   +W P
1916 Sbjct:  1140 EYIRSKSFE-RGTWYP 1154
1917
1918  Score = 65 (27.9 bits), Expect = 4.2e-60, Sum P(4) = 4.2e-60
1919  Identities = 28/102 (27%), Positives = 48/102 (47%)
1920  Links = 1-(4)-3-2
1921
1922 Query:   529 NQIIPIEENGVTKYCAELLLPIN-SPIKHAIV-LKNPMPN--KKTAQMAVALEACR--QL 582
1923              N +  I E     +C  +L P+  SP+   +V +   +P+   +  Q  +AL+ACR  QL
1924 Sbjct:   981 NFLADINETSKNPFCYFVLEPMRISPLPVDVVAMAYLLPSIIHRIEQNLIALDACRLLQL 1040
1925
1926 Query:   583 HLEGELDDNLLPKGRESIAKLLEHIDE----EPDEYAPGIAA 620
1927               +  +L    L K  ++  +  E +D     EP  + PG+ A
1928 Sbjct:  1041 DIHPDLALEALTKDSDNQGED-ERMDSIQAFEPVNFQPGMGA 1081
1929
1930  Score = 64 (27.6 bits), Expect = 7.1e-60, Sum P(5) = 7.1e-60
1931  Identities = 18/54 (33%), Positives = 28/54 (51%)
1932  Links = 1-(5)-6-3-2
1933
1934 Query:   542 YCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELDDNLLPK 595
1935              +  E+++P  SP+  AI        K+ A+ + A E C QL  +  LDD+L  K
1936 Sbjct:   660 FICEVMMPPLSPVTSAI--GKVYSTKQVAKCSAAFELCFQLIQKKFLDDHLRSK 711
1937
1938  Score = 47 (21.6 bits), Expect = 7.1e-60, Sum P(5) = 7.1e-60
1939  Identities = 14/39 (35%), Positives = 20/39 (51%)
1940  Links = 1-5-(6)-3-2
1941
1942 Query:   930 VPELMDIHPISATLWNVIAALPSIFYRVNQ-LLLTDELR 967
1943              V E M I P+   +  +   LPSI +R+ Q L+  D  R
1944 Sbjct:   998 VLEPMRISPLPVDVVAMAYLLPSIIHRIEQNLIALDACR 1036
1945
1946
1947 >sp|Q0UI93.2|DCL1_PHANO RecName: Full=Dicer-like protein 1; Includes: RecName:
1948             Full=Endoribonuclease DCL1; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
1949             helicase DCL1
1950         Length = 1522
1951
1952  Score = 490 (177.5 bits), Expect = 3.8e-59, Sum P(5) = 3.8e-59
1953  Identities = 162/507 (31%), Positives = 253/507 (49%)
1954  Links = (1)-4-5-3-2
1955
1956 Query:    12 NPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQG--GKRAFFVV 69
1957              NPRDYQ+EL  +A  +NTI  L TG+GKT IA LLL+    +      +G   K AFF+V
1958 Sbjct:    68 NPRDYQMELFLRAKMQNTIAVLDTGTGKTHIATLLLRHVLEEELENRAKGCAHKMAFFLV 127
1959
1960 Query:    70 EKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLDLI 129
1961              + VNLV QQA  +       V  + G     L+  K+  D+    + V+V TAQ L+D +
1962 Sbjct:   128 DSVNLVFQQANVLRCGLDQGVEGISGAMGQSLFQ-KQTWDKLFAVNMVIVCTAQVLVDCM 186
1963
1964 Query:   130 RHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPV-PRVLGLTASLIKAK- 187
1965               H+++ I  M +LIFDE HHA  S HPY  +M DY   + D    PR+  +TAS +  K
1966 Sbjct:   187 MHSFMSISRMNLLIFDEAHHAK-SNHPYARVMKDYYAHELDTSKRPRIFAMTASPVDVKG 245
1967
1968 Query:   188 VAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDTV 247
1969               + E + E  ++LE+ + S I T SD         +P E V +             +  +
1970 Sbjct:   246 QSAEHVREAARELETLLHSRIATTSDSALARNSITRPEEEVAV-------------YTRL 292
1971
1972 Query:   248 IEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAA---WRTAQVWEK 304
1973                 F ET        ++    D+ P R +     T +    +LG WA+   W  A   E+
1974 Sbjct:   293 RNEF-ETPLHQKVKAKYG---DVAPFRKL---FITAKLHASELGRWASDMYWSFAFADEQ 345
1975
1976 Query:   305 ELGKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVI--RLF 362
1977                   I+ ++  +++ R  + A+     + RL E     ++  E   P + ++ +  ++
1978 Sbjct:   346 SRKLQIREELKYNRSKRDWSAAELDA-QMARLKEATAF-VQQYEIGAPTLSEQDLSSKVM 403
1979
1980 Query:   363 EILETFNPEFQKERMKLEKAEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPDYV 422
1981              ++    N  +  ER  L +      I+FV++R+ A  L L+  HI    P    ++ D +
1982 Sbjct:   404 KLQYWLNLYY--ERTTLARC-----IVFVEKRHTAQLLKLIFDHIGG--PN---LHCDVL 451
1983
1984 Query:   423 VGASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPL 482
1985              VG + R  A  ++  L + Q   L++F R E+NCL ATSV EEG+D+ QCNLV++FD
1986 Sbjct:   452 VGINNR--AGEENVSL-RSQILTLQKFRRGELNCLFATSVAEEGLDIPQCNLVVRFDLYR 508
1987
1988 Query:   483 DMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKD 509
1989               M  YVQS+GRAR   S+Y+  +E ++
1990 Sbjct:   509 TMIGYVQSRGRARHRNSKYLHMLEAEN 535
1991
1992  Score = 183 (69.5 bits), Expect = 3.8e-59, Sum P(5) = 3.8e-59
1993  Identities = 86/348 (24%), Positives = 140/348 (40%)
1994  Links = 1-4-5-3-(2)
1995
1996 Query:  1502 HISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNW-MGLKVIQKDQKSD--VPSPLLRFIDT 1558
1997              ++ DKS+AD  EA IG   +           +W   +K ++    SD  +      +
1998 Sbjct:  1144 NLGDKSVADVCEAFIGAAFMQHHKGGQWTPNDWDEAVKAVKLFANSDDHLMEKWTDYYAA 1203
1999
2000 Query:  1559 PTNPNASLNFLNNLWQQFQFT-QLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHAS--YINNRVTGCYQR 1615
2001               T P            Q     ++E K  YRF+    L  AF H S  ++   +   YQR
2002 Sbjct:  1204 YTKPKYQT--AGATATQLDLAHKIEMKHPYRFRYPRLLRSAFIHPSQPFMWENIPS-YQR 1260
2003
2004 Query:  1616 LEFLGDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCP 1675
2005              LEFLGD++LD     +LF       P  LT+ ++ +V+N    ++ VK  +  H
2006 Sbjct:  1261 LEFLGDSLLDMAFIMHLFYKYPDKDPQWLTEHKTPMVSNKFLGAVCVKLGWHTHMKQNTA 1320
2007
2008 Query:  1676 GLYHMIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESVAGAI 1735
2009               L   I  +V    E   + N  A  Y V+  E            PK + D+ E+   AI
2010 Sbjct:  1321 ILSSQIRDYVYEVEEAEREAN-GAVDYWVSVSEP-----------PKCLADVIEAFVAAI 1368
2011
2012 Query:  1736 YLDSGRNLDTTWQVI-FH-------MMRGTIELCCANPPRSPIRELME--FEQSKVRFSK 1785
2013              ++DS  + +   +    H       M     E   +N P + +  L+   F  S+ R
2014 Sbjct:  1369 FVDSEFDFNVVQKFFDLHLKPFFLDMTLDAYENFASNHPTTRLSRLLSINFGCSEWRMGA 1428
2015
2016 Query:  1786 ME-RILESGK---VRVTVEVVNNMRFTGMGRNYRIAKATAAKRALKYL 1829
2017              +E   L  GK   +   V + + + F  +G++ R A+  A+  AL+ L
2018 Sbjct:  1429 LETETLIPGKGKAIAAMVMIHDKVHFHSLGQSGRYARVRASHAALEKL 1476
2019
2020  Score = 83 (34.3 bits), Expect = 3.8e-59, Sum P(5) = 3.8e-59
2021  Identities = 39/128 (30%), Positives = 59/128 (46%)
2022  Links = 1-4-5-(3)-2
2023
2024 Query:  1308 IRQRSEEYVSHIDS-DI-GLGVSPCLLLTALTTS------------NAADGM--SLERFE 1351
2025              I  R E Y+  +D+ D+  L VSP L L ALT              N   GM  + ER E
2026 Sbjct:   995 IIHRFESYLIALDACDVLDLKVSPALALEALTKDSDNSEEHGEEKINFKSGMGPNYERLE 1054
2027
2028 Query:  1352 TIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYR--LGKKLGIPQLIVANKF 1409
2029               +GD FLK AT+  ++    +++E +    R   + N NL    +GKK  + + +  + F
2030 Sbjct:  1055 FLGDCFLKVATSLSVFVQQPEENEFEFHVRRMLMLCNQNLMETAVGKKK-LYKYVRTDAF 1113
2031
2032 Query:  1410 DAHDSWLP 1417
2033                 + W P
2034 Sbjct:  1114 SRRN-WYP 1120
2035
2036  Score = 59 (25.8 bits), Expect = 3.8e-59, Sum P(5) = 3.8e-59
2037  Identities = 25/115 (21%), Positives = 56/115 (48%)
2038  Links = 1-(4)-5-3-2
2039
2040 Query:   535 EENGVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKT-AQMAVALEACRQLHLEGELDDNLL 593
2041              + NG   +  E++LP + PI   I +   + ++KT A+ + A + C +L  +  L++ LL
2042 Sbjct:   638 QRNG---FVCEVILPEHCPI---ISMVGQVYSRKTIAKCSAAFKMCIELRRKDHLNEFLL 691
2043
2044 Query:   594 PKGRESIAKLLEHIDEEPDEYAPGIAAKVGSSKRKQLYDKKIARALNESFVEADK 648
2045              P   + +  +   +    ++     A  +  +  KQ  D  +  +L+ + ++AD+
2046 Sbjct:   692 PTISKYLPAMRNALLAVSEKKKGNYAMVIKPTFWKQDRDT-VPESLHLTIIDADR 745
2047
2048  Score = 46 (21.3 bits), Expect = 3.8e-59, Sum P(5) = 3.8e-59
2049  Identities = 40/219 (18%), Positives = 97/219 (44%)
2050  Links = 1-4-(5)-3-2
2051
2052 Query:   687 LSAKEIPKIPPFPVFL---RQGNMKVRLIVAPKKTTVTAAQLQEIQLFHNYLFTQVLQMC 743
2053              L+ +  P++P FP++L   R  N+  + +  P   ++T   L+    F   +F  +
2054 Sbjct:   757 LTRRPFPQLPSFPIYLTDCRPSNIVSQSLHIP--ISLTPELLEMFTRFTLRIFEDIYNKV 814
2055
2056 Query:   744 KTGNLEFDGTSNAPLNTLIVPLNKRKDDMSYTINMKYVSEVVANMENMPRIPKDEVRRQY 803
2057                   ++D +    ++  ++P+ + +  ++   +M    EV+ +M+ + ++  +     +
2058 Sbjct:   815 ----YDYDVSK---MSYWMLPVIEHR--VASVRSMSNPQEVL-DMDQIRKVYNEPF---W 861
2059
2060 Query:   804 KFNAEDYKDAIVMPWYRN-LEQPVFYYVAEILPEWRPSSKFPDTHFETFNEYFIKKYKLE 862
2061              K++ +   D ++  ++ + +     YY   + P  +P    P  +    N  F+K   L+
2062 Sbjct:   862 KWSPQSRTDDLIDRYFVDPMNGGRRYYSDRLAPHLKPQDPVP-ANVPRQNHKFMKNI-LD 919
2063
2064 Query:   863 IYDQNQSLLDVDFTSTRLNLLQPRIQNQ--PRRSRTVSN 899
2065                D ++ +   D T  R +  QP +Q +  P R   ++N
2066 Sbjct:   920 FSD-SKWMKSRDIT--RWHQDQPVLQVEKIPFRRNHLAN 955
2067
2068  Score = 42 (19.8 bits), Expect = 9.7e-59, Sum P(5) = 9.7e-59
2069  Identities = 14/53 (26%), Positives = 28/53 (52%)
2070  Links = 1-4-(6)-3-2
2071
2072 Query:   979 KTKLD-DNVEWNSLAYATEYEEKQTII-VKKIQQLRDLNQKSIEDQERETREN 1029
2073              K  LD  + +W      T + + Q ++ V+KI   R+ +  ++ED+E++   N
2074 Sbjct:   915 KNILDFSDSKWMKSRDITRWHQDQPVLQVEKIPFRRN-HLANVEDKEKKELAN 966
2075
2076
2077 >sp|Q4WVE3.3|DCL1_ASPFU RecName: Full=Dicer-like protein 1; Includes: RecName:
2078             Full=Endoribonuclease dcl1; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
2079             helicase dcl1
2080         Length = 1537
2081
2082  Score = 466 (169.1 bits), Expect = 4.8e-59, Sum P(6) = 4.8e-59
2083  Identities = 160/515 (31%), Positives = 241/515 (46%)
2084  Links = (1)-4-5-7-3-2
2085
2086 Query:    12 NPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQ--GGKR---AF 66
2087              +PR+YQ+EL ++A  +NTI  L TGSGKT IAVLLL+     +   LD    GK    +F
2088 Sbjct:   125 DPREYQIELFERAKTQNTIAVLDTGSGKTLIAVLLLRH---TILNELDDRANGKTHRVSF 181
2089
2090 Query:    67 FVVEKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLL 126
2091              F+V+ V L  QQA  +  +    V    G   + LWD K   D+ ++R+ V+V TA+ L
2092 Sbjct:   182 FLVDSVTLAYQQAAVLRNNIDQNVAHFFGAMGTDLWD-KRTWDKHLQRNMVIVCTAEILN 240
2093
2094 Query:   127 DLIRHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPVPRVLGLTASLIKA 186
2095                + ++Y++++ + +LIFDE HHA    HPY  I+ D     +    PRV G+TAS I
2096 Sbjct:   241 QCLLNSYVRMDQINLLIFDEAHHAK-KDHPYARIIRDSYFKAQPSQRPRVFGMTASPIDT 299
2097
2098 Query:   187 KVAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDT 246
2099              K     + E   +LE+ +DS I T S +  L +  ++P E V      E      P F T
2100 Sbjct:   300 K---GDITEAATRLETFLDSRIATTSKITLLREVVSRPIEKVWAYNRLE------PPFAT 350
2101
2102 Query:   247 VIEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEKEL 306
2103                    E    ++T    + ++ +     ++   +       +LG W + R    W   L
2104 Sbjct:   351 ------ELYKLMDTR---YGNIKV-----LEGVYRFAWNASSELGKWCSDRA---WWHAL 393
2105
2106 Query:   307 GKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIRLFEILE 366
2107                     VLP        + +++  T+K       K I  I      V        E+
2108 Sbjct:   394 A----DDVLPKLEGNINKLIESN--TMKAEHGAVFKDIIRIREASETVKNYFFTDPELPG 447
2109
2110 Query:   367 TFNPEFQKERMKLEK----AEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPDYV 422
2111                +P+ Q+ RM+L K          I+F  +RY A  L  +   +    P  +   P  +
2112 Sbjct:   448 ELSPKVQRLRMELSKHFNDTTGTKCIVFTQKRYTAKILNELFTVLNI--PNLR---PGVL 502
2113
2114 Query:   423 VGASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPL 482
2115              +G    ++   +     ++Q   L +F   EINCL ATSV EEG+D+  CNLVI+FD
2116 Sbjct:   503 IGVRPGDIGGMNIT--FRQQFLALVKFRTGEINCLFATSVAEEGLDIPDCNLVIRFDLYR 560
2117
2118 Query:   483 DMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKDTAAYCSKL 517
2119               +  YVQS+GRAR   S Y I VE KD A +  +L
2120 Sbjct:   561 TLIQYVQSRGRARHCTSTYAIMVE-KDNAEHEGRL 594
2121
2122  Score = 205 (77.2 bits), Expect = 4.8e-59, Sum P(6) = 4.8e-59
2123  Identities = 75/250 (30%), Positives = 111/250 (44%)
2124  Links = 1-4-5-7-3-(2)
2125
2126 Query:  1497 LLTQ-QH-ISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQK--DQKSDVPSPL 1552
2127              LL++ +H + +K+IAD  EALIG  LL+ GP         M  K +    D  S   S
2128 Sbjct:  1173 LLSEGKHALGEKTIADVCEALIGASLLSGGPEHRFD----MATKAVSALVDSPSHRVSCW 1228
2129
2130 Query:  1553 LRFIDTPTNPNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINN---RV 1609
2131                +I   T P                  +EE++GY F     L  A TH S  +    RV
2132 Sbjct:  1229 KEYITLYTLPKYQTEKHRGSEDDLA-RHVEEELGYHFTYPRLLASAITHPSLPSTWGYRV 1287
2133
2134 Query:  1610 TGCYQRLEFLGDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKH 1669
2135                CYQRLEFLGD++LD +    LF       P  L++ + A+V+N    +L+VK  F +
2136 Sbjct:  1288 P-CYQRLEFLGDSLLDMVCVEDLFRRFPDRDPQWLSEHKMAMVSNKFLGALSVKLGFHRR 1346
2137
2138 Query:  1670 FIAMCPGLYHMIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFE 1729
2139               +A    L   I  +V+       ++   A  Y V  ++            PK + D+ E
2140 Sbjct:  1347 IMAFSNPLQAQITHYVEEIETAQAESQ-GAVDYWVVAKDP-----------PKCLPDMVE 1394
2141
2142 Query:  1730 SVAGAIYLDS 1739
2143              +  GAI++DS
2144 Sbjct:  1395 AYLGAIFVDS 1404
2145
2146  Score = 79 (32.9 bits), Expect = 4.8e-59, Sum P(6) = 4.8e-59
2147  Identities = 24/74 (32%), Positives = 33/74 (44%)
2148  Links = 1-4-5-7-(3)-2
2149
2150 Query:  1344 GMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQL 1403
2151              G + ER E +GD FLK AT+  L+    +  E      R   + N NL+    K  I +
2152 Sbjct:  1086 GKNYERLEFLGDCFLKMATSIALFSQNPNDDEFDYHVNRMCLICNKNLFNTAIKKQIYRY 1145
2153
2154 Query:  1404 IVANKFDAHDSWLP 1417
2155              I +  F  H  W P
2156 Sbjct:  1146 IRSRGFSRH-IWYP 1158
2157
2158  Score = 65 (27.9 bits), Expect = 4.8e-59, Sum P(6) = 4.8e-59
2159  Identities = 30/113 (26%), Positives = 48/113 (42%)
2160  Links = 1-(4)-5-7-3-2
2161
2162 Query:   483 DMRSYVQSK-GR----ARRAGSRYVITVEEKDTAAYCSKLPSDIFTRLVPH-NQIIPIEE 536
2163              D+ S++Q + GR     +  G++          A Y S L  +  T  VP    ++ I
2164 Sbjct:   623 DLDSFLQEEEGRRTFTVKSTGAKLTYHSAIAILARYASSLQYEKET--VPQVTYVVTIAS 680
2165
2166 Query:   537 NGVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELD 589
2167              N    Y  E++LP  SPI+   +  +P   K  A+ + A + C  L     LD
2168 Sbjct:   681 NA---YVCEVILPEKSPIRG--LTGSPAMRKAVAKRSAAFDTCLLLRKNRLLD 728
2169
2170  Score = 52 (23.4 bits), Expect = 4.8e-59, Sum P(6) = 4.8e-59
2171  Identities = 11/55 (20%), Positives = 32/55 (58%)
2172  Links = 1-4-(5)-7-3-2
2173
2174 Query:   687 LSAKEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKK--TTVTAAQLQEIQLFHNYLFTQV 739
2175              L+ +++P+ P F ++L + +++ +++  P K    ++  +LQ + +F   +F  +
2176 Sbjct:   800 LTREKLPEFPAFSIYLDE-DVETKVLSYPLKHGLQISVDKLQSLTVFTLRIFRDI 853
2177
2178  Score = 45 (20.9 bits), Expect = 2.5e-58, Sum P(6) = 2.5e-58
2179  Identities = 16/48 (33%), Positives = 24/48 (50%)
2180  Links = 1-4-(6)-7-3-2
2181
2182 Query:   824 QPVFYYVAEILPEWRPSSKFPDTHFETFNEYFIKKYKLEI-YDQNQSL 870
2183              +P+     E LPE+   S + D   ET    +  K+ L+I  D+ QSL
2184 Sbjct:   795 RPILLLTREKLPEFPAFSIYLDEDVETKVLSYPLKHGLQISVDKLQSL 842
2185
2186  Score = 40 (19.1 bits), Expect = 4.8e-59, Sum P(6) = 4.8e-59
2187  Identities = 10/32 (31%), Positives = 16/32 (50%)
2188  Links = 1-4-5-(7)-3-2
2189
2190 Query:   865 DQNQSLLDVDFTSTRLNLLQPRIQNQPRRSRT 896
2191              D NQ +L  +    R NLL  ++  Q +  +T
2192 Sbjct:   976 DWNQPVLQAELVRLRRNLLD-KMTTQEKEMQT 1006
2193
2194  Score = 39 (18.8 bits), Expect = 1.7e-56, Sum P(4) = 1.7e-56
2195  Identities = 14/43 (32%), Positives = 19/43 (44%)
2196  Links = 1-(8)-3-2
2197
2198 Query:   543 CAE-LLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHL 584
2199              CAE L +    P   +  L  P    +     +ALEAC +L L
2200 Sbjct:  1011 CAEPLRISALPPSIVSTCLAFPAIISRLDSYLIALEACDELEL 1053
2201
2202
2203 >sp|Q2U6C4.2|DCL1_ASPOR RecName: Full=Dicer-like protein 1; Includes: RecName:
2204             Full=Endoribonuclease dcl1; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
2205             helicase dcl1
2206         Length = 1523
2207
2208  Score = 474 (171.9 bits), Expect = 8.5e-58, Sum P(4) = 8.5e-58
2209  Identities = 196/684 (28%), Positives = 307/684 (44%)
2210  Links = (1)-4-3-2
2211
2212 Query:    12 NPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQG-GKR---AFF 67
2213              +PR+YQVEL ++A  +NTI  L TGSGKT IAVLLLK   +Q    +D+  GK    +FF
2214 Sbjct:   115 DPREYQVELFERAKSQNTIAVLDTGSGKTLIAVLLLKHI-IQNEL-IDRANGKPPRISFF 172
2215
2216 Query:    68 VVEKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLD 127
2217              +V+ V L  QQA  +  +    V Q  G   + LW SK+  D   + + V+V TA+ L
2218 Sbjct:   173 LVDSVTLAFQQAAVLRNNLDQNVAQFFGAMGTDLW-SKQTWDHQFENNMVIVCTAEILNQ 231
2219
2220 Query:   128 LIRHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDYKLLKKDKPV-PRVLGLTASLIKA 186
2221               + ++Y++++ + +LIFDE HH     HPY  I+ +   LK D    PR+ G+TAS I
2222 Sbjct:   232 CLLNSYIRMDQINLLIFDEAHHTK-KDHPYARIIRE-SYLKADPTKRPRIFGMTASPIDT 289
2223
2224 Query:   187 KVAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETASDLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLGIPNFDT 246
2225              K     ++E   KLE  +DS I T S    L +   +P E     + +E   L  P F T
2226 Sbjct:   290 K---GDIIESATKLEVLLDSKIATTSKPNLLREVVRRPIE-----ESWEYDKLD-PPFAT 340
2227
2228 Query:   247 VIEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFRQLGPWAAWRTAQVWEKEL 306
2229                +++    A       F    D+   +P+    + T     +LGP  A R    W   L
2230 Sbjct:   341 --KLYQILQA------RFG---DISSLQPV---FRFTLQASSELGPCCADRA---WAYAL 383
2231
2232 Query:   307 GKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEALRPYVPQRVIRLFEILE 366
2233                     VLP   L   N+ K +      + +  +K+I  I+     V         +
2234 Sbjct:   384 A----DDVLPK--LEG-NVRKLAQSISSPIPQCALKEISRIQEASDIVKNHSFNSPNVPG 436
2235
2236 Query:   367 TFNPEFQKERMKLEKA-EH---LSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHIKSWEPKFKFVNPDYV 422
2237                +P+ Q  R KL K  EH      I+F  +RY A  L  +   ++       ++ P  +
2238 Sbjct:   437 ELSPKVQLLRQKLIKYFEHPTKTKCIVFTQKRYTAKMLFDLFSTLE-----IPYLRPGVL 491
2239
2240 Query:   423 VGASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPL 482
2241              +G    ++   +     ++Q   L +F   EINCL ATSV EEG+D+  CNLV++FD
2242 Sbjct:   492 IGVRSGDIVGMNVS--FRQQFLALVKFRSGEINCLFATSVAEEGLDIPDCNLVVRFDLYN 549
2243
2244 Query:   483 DMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEE--KDTAAY------CSKLPSDIFTRLVPHNQIIPI 534
2245               +  YVQS+GRAR + S Y   +E    D AA         KL    F   +P ++I+
2246 Sbjct:   550 TLIQYVQSRGRARHSSSTYASMIERYNADHAARLVEVREAEKLMQS-FCETLPEDRIL-- 606
2247
2248 Query:   535 EENGVTKYCAELLLPINSPIKHAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEA--CRQLHLEGELDDN- 591
2249                +G+      +L       K   +++     K T   A+A+ A     L  E E
2250 Sbjct:   607 --HGIDSEIDSILQ--GEEEKRTFIIR-ATGAKLTYHSALAILARYASSLQYEKETSAQA 661
2251
2252 Query:   592 ---LLPKGRESIAKLLEHIDEEPDEYAPGI-AAKVGSSKRKQLYDKKIARALNESFVEAD 647
2253                 +LP+    + +++   ++ P     G+ A+K  ++K+   +D  +   L +  +  D
2254 Sbjct:   662 TYVVLPQNNSFVCEVILP-EKSPVRGLTGVPASKKSAAKQSAAFDTCVL--LRKHKLLDD 718
2255
2256 Query:   648 KECFIYAFELERFREAELTLNPKR 671
2257                  +Y   L   R A L +   R
2258 Sbjct:   719 HFNSVYHRRLPAMRNARLAITSSR 742
2259
2260  Score = 204 (76.9 bits), Expect = 8.5e-58, Sum P(4) = 8.5e-58
2261  Identities = 95/348 (27%), Positives = 153/348 (43%)
2262  Links = 1-4-3-(2)
2263
2264 Query:  1503 ISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSDVPS-PLLRFIDTPTN 1561
2265              + +K++AD  EALIG  LL+ G +        M +K +      D P+   L + D  ++
2266 Sbjct:  1169 LREKTVADVCEALIGASLLSGGLHNQFD----MAVKAVTA--VVDSPNHKALCWADYTSS 1222
2267
2268 Query:  1562 ---PNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNRV-TGCYQRLE 1617
2269                 P       +  ++     ++EEK+GYRFK    L  AFTH SY +      CYQRLE
2270 Sbjct:  1223 YMLPKYQTQSPDG-YELDLGRKVEEKLGYRFKYPRLLHSAFTHPSYPSTWAKVPCYQRLE 1281
2271
2272 Query:  1618 FLGDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQKHFIAMCPGL 1677
2273              FLGD++LD +    LF       P  LT+ + A+V+N    +LAVK     H       L
2274 Sbjct:  1282 FLGDSLLDMVCVDDLFYRYPDKDPQWLTEHKMAMVSNKFLGALAVKLGLHTHLRHFSNPL 1341
2275
2276 Query:  1678 YHMIEKFVKLCSERNFDTNFNAEMYMVTTEEEIDEGQEEDIEVPKAMGDIFESVAGAIYL 1737
2277                 I  + +       ++    + ++VT +             PK + D+ E+  GA ++
2278 Sbjct:  1342 QSQITHYAEEIQAAENESQGAVDYWLVTKDP------------PKCLPDMVEAYLGAAFV 1389
2279
2280 Query:  1738 DSG---RNLDTTWQ----VIFHMMRGTIELCCANP-PRSPIRELMEFEQSKVRFS-KMER 1788
2281              DS    R ++  +Q      FH M  TI    AN  P + ++  +  E     +  K
2282 Sbjct:  1390 DSDFQFRVVEDFFQRHVKSYFHDM--TIYDTFANKHPTTFLQNRLTNEYGCTNYCLKAGE 1447
2283
2284 Query:  1789 I--LESGKVRVTVEVVNN--MRFTGMGRNYRIAKATAAKRALKYLHQI 1832
2285              I  ++ G V V   V+ +  +   G   + R AK  A+++AL  L  +
2286 Sbjct:  1448 IPVVDGGTVSVLAAVIVHEVVIAEGTASSGRYAKVKASEKALSVLENM 1495
2287
2288  Score = 84 (34.6 bits), Expect = 8.5e-58, Sum P(4) = 8.5e-58
2289  Identities = 24/74 (32%), Positives = 33/74 (44%)
2290  Links = 1-4-(3)-2
2291
2292 Query:  1344 GMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQL 1403
2293              G + ER E +GD FLK AT+  L+    D  E      R   + N NL+    K  + Q
2294 Sbjct:  1074 GKNYERLEFLGDCFLKMATSISLFVQNPDDDEFDFHVNRMCLICNKNLFNTALKKELYQY 1133
2295
2296 Query:  1404 IVANKFDAHDSWLP 1417
2297                +  F  H +W P
2298 Sbjct:  1134 TRSRGFSRH-TWYP 1146
2299
2300  Score = 39 (18.8 bits), Expect = 8.5e-58, Sum P(4) = 8.5e-58
2301  Identities = 10/50 (20%), Positives = 22/50 (44%)
2302  Links = 1-(4)-3-2
2303
2304 Query:   687 LSAKEIPKIPPFPVFLRQGNMKVRLIVAPKKTTVTAAQLQEIQLFHNYLF 736
2305              L+ + +P  P F +FL   +++  ++V            QE++    + F
2306 Sbjct:   789 LTRERLPDFPSFTIFL-DDDIET-IVVTESVEEALHISSQELEYLSTFTF 836
2307
2308
2309 >sp|Q2UNX5.1|DCL2_ASPOR RecName: Full=Dicer-like protein 2; Includes: RecName:
2310             Full=Endoribonuclease dcl2; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
2311             helicase dcl2
2312         Length = 1377
2313
2314  Score = 396 (144.5 bits), Expect = 1.0e-53, Sum P(5) = 1.0e-53
2315  Identities = 144/525 (27%), Positives = 243/525 (46%)
2316  Links = (1)-5-3-2-4
2317
2318 Query:    11 FNPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQGGKR--AFFV 68
2319              + PR YQ E+ + + K+N IV + TG+GKT IA+L +          L+ GG R   +F+
2320 Sbjct:    14 YKPRQYQYEMFEASLKENIIVAMDTGTGKTQIALLRIAHQ-------LEGGGPRKLTWFL 66
2321
2322 Query:    69 VEKVNLVEQQAIHIEVHT-SFKVGQVHGQTSSGLWDSKEQCDQFMKRHHVVVITAQCLLD 127
2323                 V L  QQ   I  H  + +   + G      W S+   D+ +K   VVV T   L +
2324 Sbjct:    67 TPTVALCLQQYEVIRSHLPAVRACTITGLDKVERWKSQYIWDELLKDKQVVVSTHAVLFE 126
2325
2326 Query:   128 LIRHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDY--KLLKKD--KPVPRVLGLTAS- 182
2327               + H +++I  + +LIFDE HH +  +HP   IM+D+    L+K     VP +LGLTAS
2328 Sbjct:   127 ALTHGFVRISQLGLLIFDEAHHCM-RRHPANMIMLDFYHPTLRKHGRDSVPCILGLTASP 185
2329
2330 Query:   183 LIKAKVAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETAS-DLVSLSKYGAKPYEVVIICKDFEIGCLG- 240
2331              ++++K       +++K LES +DS+ +T       L+ Y  +P  + IICK  + G  G
2332 Sbjct:   186 VVRSK------SQEMKTLESNLDSICKTPQVHKQELTTYAHRPELLPIICKAIDEGPGGR 239
2333
2334 Query:   241 ----------IPNFDTVIEIFDETVAFVNTTTEFHPDLDLDP--RRPIKDSLKTTRAVFR 288
2335                          + D   +   +  + +N + E+   +         IK  +  +R +F
2336 Sbjct:   240 ALQALEHAWDTADIDGDPDAIPQNGSLLNGSGEYKALMVRKTLCNEQIKRFVDRSRHIFA 299
2337
2338 Query:   289 QLGPWAAWRTAQVWEKELGKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIE 348
2339              +LG WAA        ++L   I+ Q L   T+ + +  +  +      L     +    +
2340 Sbjct:   300 ELGEWAADYYICTSVEQLRTTIRDQSL---TMDWEDEERAYLSNFLSKLPVAEVQANLAD 356
2341
2342 Query:   349 ALRPYVPQRVIRLFEILETFN-PEFQKERMKLEKAEHLSAIIFVDQRYIAYSLLLMMRHI 407
2343                   +  ++  L   L+ F+ PEF             S +IFV QR +  S+L  +  +
2344 Sbjct:   357 PNNFTMSPKLAALINFLDKFDDPEF-------------SGLIFVKQR-VTVSVLARLLSL 402
2345
2346 Query:   408 KSWEPKFKFVNPDYV---VGASGRNLASSDSQGLHKRQTEVLRRFHRNEINCLIATSVLE 464
2347                 + + +F    YV   VG+  +++         K+Q   +  F     N ++ TSVLE
2348 Sbjct:   403 HP-QTRDRFRCAAYVGMSVGSCRQDMVGDWHNA--KKQRGTMDDFRSGRKNLIVTTSVLE 459
2349
2350 Query:   465 EGVDVKQCNLVIKFDRPLDMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKD 509
2351              EG+DV  C +V+ FD+P +++S++Q +GRAR+  S Y I     D
2352 Sbjct:   460 EGIDVTACRVVVCFDKPANLKSFIQRRGRARQQKSTYAIMFSTAD 504
2353
2354  Score = 196 (74.1 bits), Expect = 1.0e-53, Sum P(5) = 1.0e-53
2355  Identities = 52/169 (30%), Positives = 88/169 (52%)
2356  Links = 1-5-3-(2)-4
2357
2358 Query:  1500 QQHISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSDVPSPLLRFIDTP 1559
2359              ++ +S K +AD +EALIG   L  G +   ++     L  + + Q  D+PS +     T
2360 Sbjct:  1028 KRQMSAKVLADVIEALIGAAYLD-GGHSKAQICTHCFLPEVNR-QPLDIPSLI-----TQ 1080
2361
2362 Query:  1560 TNPNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNRVTGCYQRLEFL 1619
2363              T    +   + +         L+  +GY FK    L++A TH S  +++ T  YQRLEFL
2364 Sbjct:  1081 TEHGRTARHIID-------GDLQRHLGYTFKNEDLLIEALTHPSCQHDQTTQSYQRLEFL 1133
2365
2366 Query:  1620 GDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKFEFQK 1668
2367              GDA+LD +I   +F+ S + SPG +T ++ A+VN  +     ++F  ++
2368 Sbjct:  1134 GDAILDMVIVPIIFQYSNKISPGDMTLIKHAVVNANLLGFFCMEFSIEQ 1182
2369
2370  Score = 99 (39.9 bits), Expect = 1.0e-53, Sum P(5) = 1.0e-53
2371  Identities = 36/155 (23%), Positives = 64/155 (41%)
2372  Links = 1-5-(3)-2-4
2373
2374 Query:  1264 EIDDNAAKTDVLERENCEVLPVAINEKSRSFSFEKESKAINGRLIRQRSEEYVSHIDSDI 1323
2375              E +  +AK  ++  E+C V  + ++              +   LI  R     + I  D+
2376 Sbjct:   867 ESEHGSAKVHMVAAESCTVDKLPVSTAIFGLFIPHIVDRLESTLIANR---LCATILCDV 923
2377
2378 Query:  1324 GLGVSPCLLLTALTTSNAADGMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSFARS 1383
2379              G      ++ TA+   +A    + +R+E +GDS LK+  +  L+   L+  EG L+  R+
2380 Sbjct:   924 GFADIQHVI-TAIMAPSAQGVTNYQRYEFLGDSILKYIVSCQLFFQNLNWPEGFLTEGRT 982
2381
2382 Query:  1384 KEVSNCNLYRLGKKLGIPQLIVANKFDAHDSWLPP 1418
2383                V N  L R     G+   I+         W+ P
2384 Sbjct:   983 TIVQNPRLTRAALDAGLDSFIITKALTPR-RWIAP 1016
2385
2386  Score = 65 (27.9 bits), Expect = 1.0e-53, Sum P(5) = 1.0e-53
2387  Identities = 14/22 (63%), Positives = 16/22 (72%)
2388  Links = 1-5-3-2-(4)
2389
2390 Query:  1722 KAMGDIFESVAGAIYLDSGRNL 1743
2391              K   DI ESV GAIY+DSG +L
2392 Sbjct:  1257 KFFSDIVESVLGAIYVDSGGDL 1278
2393
2394  Score = 54 (24.1 bits), Expect = 1.0e-53, Sum P(5) = 1.0e-53
2395  Identities = 29/111 (26%), Positives = 52/111 (46%)
2396  Links = 1-(5)-3-2-4
2397
2398 Query:   502 VITVEEKDTAAY--CSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEEN--GVTKYCAELLLP--INSPIK 555
2399              VIT +   T  Y  C+ LP +   R V +      E++  G+ K    ++LP  ++  ++
2400 Sbjct:   555 VITPDSVVTHLYHFCAVLPEE---RYVDNRPEFSFEKDRQGLIK--GTVILPSCVHPKVR 609
2401
2402 Query:   556 HAIVLKNPMPNKKTAQMAVALEACRQLHLEGELDDNLLPKGRESIAKLLEH 606
2403                I  K    +++ A    A +A R L+  G L+D+LLP  +    +  +H
2404 Sbjct:   610 R-IQGKLWWKSERAAVKETAFQAYRALYEFGLLNDHLLPLTKNPEMRPTDH 659
2405
2406  Score = 41 (19.5 bits), Expect = 2.2e-52, Sum P(5) = 2.2e-52
2407  Identities = 10/30 (33%), Positives = 14/30 (46%)
2408  Links = 1-(6)-3-2-4
2409
2410 Query:   828 YYVAEILPEWRPSSKFPDTHFETFNEYFIK 857
2411              Y+   +LPE R     P+  FE   +  IK
2412 Sbjct:   566 YHFCAVLPEERYVDNRPEFSFEKDRQGLIK 595
2413
2414
2415 >sp|Q4WA22.2|DCL2_ASPFU RecName: Full=Dicer-like protein 2; Includes: RecName:
2416             Full=Endoribonuclease dcl2; Includes: RecName: Full=ATP-dependent
2417             helicase dcl2
2418         Length = 1388
2419
2420  Score = 369 (135.0 bits), Expect = 1.7e-51, Sum P(5) = 1.7e-51
2421  Identities = 156/536 (29%), Positives = 255/536 (47%)
2422  Links = (1)-5-3-2-4
2423
2424 Query:     7 DLQCFNPRDYQVELLDKATKKNTIVQLGTGSGKTFIAVLLLKEYGVQLFAPLDQGGKRAF 66
2425              D   + PR+YQ+E+L+ + K+N IV + TGSGKT IAVL +K   + + +P     K  +
2426 Sbjct:    10 DASPYQPRNYQLEMLEASMKENIIVAMDTGSGKTHIAVLRIKAE-LDICSP----DKVVW 64
2427
2428 Query:    67 FVVEKVNLVEQQAIHIEVHTSFKVGQVHGQTSSGL-----WDSKEQCDQFMKRHHVVVIT 121
2429              F+   V L  QQ  H EV  S  +  V  +T +GL     W  +   D  +  + V+V T
2430 Sbjct:    65 FLAPTVALCIQQ--H-EVIAS-NLPAVRTRTLTGLDKVELWTDQSIWDAVLNGYRVIVST 120
2431
2432 Query:   122 AQCLLDLIRHAYLKIEDMCVLIFDECHHALGSQHPYRSIMVDY--KLLKKDKP--VPRVL 177
2433                 L D + H ++K+  + +LIFDE HH    +H    IM D+    L K  P  VPR++
2434 Sbjct:   121 HAVLADALSHGFVKMSQLALLIFDEAHHCT-RRHAANKIMQDFYHPTLTKSGPAAVPRIM 179
2435
2436 Query:   178 GLTASLIKAKVAPEKLMEQLKKLESAMDSVIETAS-DLVSLSKYGAKPY--EVVIICKD- 233
2437              GLTAS +      E LM     +ES +D+V  T       L K+  +P+  ++     D
2438 Sbjct:   180 GLTASPVVRSNHQELLM-----VESNLDAVCRTPRLHRQELLKFTHRPHLQQIWYTPTDP 234
2439
2440 Query:   234 --FEIGCLGIPNFDTVIEIFD-ETVAFVNTTTEFHPDLDLDPRRPIKDSLKTTRAVFR-Q 289
2441                F    L +       E  D     ++    +  P   LD R  +K +L T +   R Q
2442 Sbjct:   235 AGFRSASLTLGALYHAWENLDIGDDPYIQRLRK-SP---LDDRA-LKKALLTGKTYCREQ 289
2443
2444 Query:   290 LGPWAAWRTAQVWEKELGKIIKSQVLPDKTLRFLNMAKTSMITIKRLLEPEMKKIKSIEA 349
2445              L  +   R+  ++E ELG+      +     +  +  + S ++       E +K   ++
2446 Sbjct:   290 LRRFVD-RSRHIFE-ELGEWAAEYYIYASIKQLRDRVRDSYMSGDW---DEAEKAYLVDF 344
2447
2448 Query:   350 LRPYVPQRVIRLFEILET----FNPEFQKERMKLEKAEH--LSAIIFVDQRYIAYSLLLM 403
2449              L   +P   I  F + +      +P+F+     L+ ++    S +IFV QR +  S +
2450 Sbjct:   345 LSK-IPTSDIH-FALNDPDGFRISPKFESLLNFLDSSDQREFSGLIFVKQR-VTVSAMTS 401
2451
2452 Query:   404 MRHIKSWEPKFKFVNPDYVVGASGRNLASSDSQG--LHKR-QTEVLRRFHRNEINCLIAT 460
2453              +  +  +  + +F    YV G S  + AS D  G  L+ + Q + L  F     N +IAT
2454 Sbjct:   402 LLSVHPYTRE-RFRCAAYV-GWSNSS-ASKDILGDLLNMQLQRDTLDDFRSGRKNLIIAT 458
2455
2456 Query:   461 SVLEEGVDVKQCNLVIKFDRPLDMRSYVQSKGRARRAGSRYVITVEEKDTAAYCSK 516
2457               VLEEG+D+  C++V+ +D+P +++S++Q +GRARR  S + I     DT+A  S+
2458 Sbjct:   459 DVLEEGIDLSACSVVVCYDKPPNLKSFIQRRGRARRKQSTFAIMFPTDDTSADVSR 514
2459
2460  Score = 178 (67.7 bits), Expect = 1.7e-51, Sum P(5) = 1.7e-51
2461  Identities = 54/165 (32%), Positives = 86/165 (52%)
2462  Links = 1-5-3-(2)-4
2463
2464 Query:  1500 QQHISDKSIADAVEALIGVHLLTLGPNPTLKVMNWMGLKVIQKDQKSDVPSPLLRFIDTP 1559
2465              ++ +S K +AD VEALIG   +  G + T +         I++     +P   L  +DT
2466 Sbjct:  1035 KRQMSTKVLADVVEALIGAAYVD-GGHSTAQAC-------IRRF----LPEINLHAVDTR 1082
2467
2468 Query:  1560 TNPNASLNFLNNLWQQFQFTQLEEKIGYRFKERAYLVQAFTHASYINNRVTGCYQRLEFL 1619
2469              T   A+ +      +     +L++ IGY F++ + LV+A TH S   +  T  YQRLE+L
2470 Sbjct:  1083 T---AARSVAPESARHMMNDRLKDHIGYTFEDESLLVEALTHPSCDYDSTTQSYQRLEYL 1139
2471
2472 Query:  1620 GDAVLDYMITRYLFEDSRQYSPGVLTDLRSALVNNTIFASLAVKF 1664
2473              GDAVLD +I   +F    Q   G +T ++ A+VN  + A L ++F
2474 Sbjct:  1140 GDAVLDMVIVSAIFNHRIQRPQGDMTKIKHAVVNANLLAFLCMEF 1184
2475
2476  Score = 116 (45.9 bits), Expect = 1.7e-51, Sum P(5) = 1.7e-51
2477  Identities = 45/158 (28%), Positives = 69/158 (43%)
2478  Links = 1-5-(3)-2-4
2479
2480 Query:  1263 QEIDDNAAKTDVLERENCEV--LPVAINEKSRSFSFEKESKAINGRLIRQRSEEYVSHID 1320
2481              + I D+AAK  ++  E C +  LP  +       S   E   I   LI  R  + +
2482 Sbjct:   873 EAIPDSAAKNPIVAAEACTIDRLPFTMAIFGLFISAIVEQLEIE--LIATRLRDTILR-- 928
2483
2484 Query:  1321 SDIGLGVSPCLLLTALTTSNAADGMSLERFETIGDSFLKFATTDYLYHTLLDQHEGKLSF 1380
2485               D+    S   ++TA++T  A    + +R+E +GDS LKF+ +  L+    + HEG LS
2486 Sbjct:   929 -DVSFK-STDHIITAISTPLAHRLTNYQRYEFLGDSILKFSVSCQLFFQHPNWHEGYLSE 986
2487
2488 Query:  1381 ARSKEVSNCNLYRLGKKLGIPQLIVANKFDAHDSWLPP 1418
2489               R   V N  L +     G+   IV  +  A   W  P
2490 Sbjct:   987 GRDMIVQNPRLAKAALDTGLDAYIVTKRL-ASRKWSAP 1023
2491
2492  Score = 74 (31.1 bits), Expect = 1.7e-51, Sum P(5) = 1.7e-51
2493  Identities = 35/126 (27%), Positives = 61/126 (48%)
2494  Links = 1-5-3-2-(4)
2495
2496 Query:  1718 IEVPKAMGDIFESVAGAIYLDSGRNLDT----TWQV-IFHMMRGTIELCC-ANPPRSPIR 1771
2497              +   K   DI ESV GAI++DSG NL        Q+ +   +R  ++       PRS ++
2498 Sbjct:  1259 LNADKFFSDIIESVLGAIFVDSGGNLAPCEVFVEQIGLMAYLRRILDHGIDVRHPRSVVQ 1318
2499
2500 Query:  1772 ELMEFEQSKVRFSKMERI-LESG--KVRVTVEVVNNMRFTGMG-RNYRIAKATAAKRALK 1827
2501              +L +   + ++F  ++R+  E G    + +V++     F   G      A+ TAA  A+K
2502 Sbjct:  1319 QLAK---TNIQFV-LQRVPTEEGGASYQCSVQMEQAELFVVTGCLTAEEAEVTAAVEAIK 1374
2503
2504 Query:  1828 YLHQIE 1833
2505              +L + E
2506 Sbjct:  1375 FLTRDE 1380
2507
2508  Score = 53 (23.7 bits), Expect = 1.7e-51, Sum P(5) = 1.7e-51
2509  Identities = 30/145 (20%), Positives = 61/145 (42%)
2510  Links = 1-(5)-3-2-4
2511
2512 Query:   513 YCSKLPSDIFTRLVPHNQIIPIEENGVTKYCAELLLP--INSPIKHAIVLKNPMPNKKTA 570
2513              +C+ LP   +  + P        E+G+ K    ++LP  ++  ++     +     ++ A
2514 Sbjct:   571 FCAVLPPQPYVDMRPVFSF-ETNEDGLLK--GTVILPSCVHPKVRRTEG-RRWWRTERAA 626
2515
2516 Query:   571 QMAVALEACRQLHLEGELDDNLLPKGRESIAKL-----LEHIDEEPDEYAPGIAAKVGSS 625
2517                  A +A + L+  G ++D+LLP  ++   K      +  I E  ++Y P I      S
2518 Sbjct:   627 MKETAFQAYKSLYEFGLVNDHLLPLTKKPELKTHDLGSMPSILETSEQYDPWIEWAYSWS 686
2519
2520 Query:   626 KRKQLYDKKIARALNESFVEADKEC 650
2521                  ++  +I   +NE     D+ C
2522 Sbjct:   687 S-PDIHQSRIVVKMNEG--RGDELC 708
2523
2524
2525 Parameters:
2526   links
2527   postsw
2528   -i cele_dcr1.fa
2529   -i cele_dcr1.fa
2530   wordmask=seg+xnu
2531   -d /data/databases/BLAST/swissprot
2532   -o celedcr1-vs-swissprot.BLASTP
2533   E=1e-50
2534
2535   ctxfactor=1.00
2536
2537   Query                        -----  As Used  -----    -----  Computed  ----
2538   Frame  MatID Matrix name     Lambda    K       H      Lambda    K       H
2539    +0      0   BLOSUM62        0.318   0.134   0.390    same    same    same
2540                Q=9,R=2         0.244   0.0300  0.180     n/a     n/a     n/a
2541
2542   Query
2543   Frame  MatID  Length  Eff.Length     E     S W   T  X   E2     S2
2544    +0      0     1845      1845   9.0e-51  566 3  11 22  0.41    34
2545                                                      40  0.45    37
2546
2547
2548 Statistics:
2549
2550   Database:  /data/databases/BLAST/swissprot
2551    Title:  swissprot
2552    Posted:  9:42:51 AM PST Dec 14, 2008
2553    Created:  9:42:51 AM PST Dec 14, 2008
2554    Format:  XDF-1
2555    # of letters in database:  132,868,552
2556    # of sequences in database:  353,658
2557    # of database sequences satisfying E:  19
2558   No. of states in DFA:  634 (134 KB)
2559   Total size of DFA:  1250 KB (2395 KB)
2560   Time to generate neighborhood:  0.00u 0.00s 0.00t   Elapsed:  00:00:00
2561   No. of threads or processors used:  4
2562   Search cpu time:  109.05u 0.35s 109.40t   Elapsed:  00:00:27
2563   Total cpu time:  109.26u 0.35s 109.61t   Elapsed:  00:00:27
2564   Start:  Sun Dec 14 09:52:50 2008   End:  Sun Dec 14 09:53:17 2008