Makefile.PL

   1 ## --Makefile.PL for Bioperl core module distribution--##
   2 ## ----------------------------------------------------##
   3
   4 # $Id$
   5
   6 #
   7 # Basically this is a standard makefile except
   8 # that we are experimenting with an 'optional autoload'
   9 # on the Seq.pm file.
  10 #
  11 # At the moment, (oct 1998) this don't work, so it
  12 # is switched off, hence $do_autoload_finesse =0; [EB]
  13 #
  14 # If you want help with this Makefile get in touch with
  15 # the bioperl core by sending a message to bioperl-bugs@bio.perl.org
  16 # for real bugs or vsns-bcd-perl-guts@lists.uni-bielefeld.de
  17 # to send a mail to all the bioperl core developpers.
  18 #
  19
  20 #
  21 # Talk to Ewan (<birney@sanger.ac.uk>) for more info.
  22 #
  23
  24 # Let the code begin...
  25
  26 require 5.004;
  27 use ExtUtils::MakeMaker;
  28
  29 $do_autoload_finesse = 0;
  30 $NAME     = 'Bio';
  31 $DISTNAME = "bioperl";
  32 $VERSION  = "0.05.1";
  33
  34 if( $do_autoload_finesse == 1 ) {
  35     fatal("Autoload finessing does not work at the moment!");
  36 }
  37
  38 # don't catch signals - it is very boring!
  39
  40 #BEGIN {
  41 ##Catch signals and invoke a cleanup function
  42 #$SIG{__WARN__} = $SIG{INT} = $SIG{QUIT} =\&cleanup;
  43 #}
  44
  45 @BACKUP_FILES = qw(./Seq.pm.bak);
  46
  47 #
  48 # This does an inplace edit on Seq.pm
  49 #
  50
  51 if( $do_autoload_finesse ) {
  52
  53     print "Bioperl module installation\nPreparing modules for AUTOLOADing...";
  54     `perl -p -i.bak -e 's/#__END__/__END__/' Seq.pm`;
  55     print "done.\n\n";
  56 }
  57
  58 # Check for LWP and warn that Webblast requires it.
  59
  60 unless( eval "require HTTP::Request::Common" and
  61         eval "require LWP::UserAgent") {
  62
  63 print STDERR <<QQ_MISSING_LWP_QQ;
  64
  65 ======================================================
  66 WARNING: LWP IS NOT INSTALLED.
  67
  68    Webblast.pm now requires the LWP (libwww-perl) modules.
  69    To launch remote BLASTs, you will need to install
  70    these most-excellent modules which can be readily
  71    obtained from your local CPAN site:
  72    http://www.perl.com/CPAN/
  73
  74    But don't worry, the rest of bioperl will work fine
  75 ======================================================
  76
  77 QQ_MISSING_LWP_QQ
  78 }
  79
  80 # Check for Ace and warn that Bio::DB::Ace
  81
  82 unless( eval "require Ace" ) {
  83
  84 print STDERR <<QQ_MISSING_ACE_QQ;
  85
  86 ======================================================
  87 WARNING: Ace IS NOT INSTALLED.
  88
  89   Ace.pm (AcePerl) is not installed. Bio::DB::Ace
  90   requires it for access to acedb databases. You can
  91   download this sweet module from
  92   http://stein.cshl.org/AcePerl
  93
  94   But don't worry, the rest of bioperl will work fine
  95 ======================================================
  96
  97 QQ_MISSING_ACE_QQ
  98 }
  99
 100 WriteMakefile(
 101     NAME        => $NAME,
 102     DISTNAME    => $DISTNAME,
 103     VERSION     => $VERSION,
 104     'dist'      => {  COMPRESS     => 'gzip -9f',
 105                       SUFFIX       => '.gz',
 106                       DIST_DEFAULT => 'all tardist',
 107                    },
 108
 109    'realclean'  => {  FILES        => join(' ',@BACKUP_FILES) }
 110 );
 111
 112
 113 sub cleanup {
 114 my $sig = @_;
 115 print "\n** [$0] Caught a SIG$sig -- cleaning up and shutting down.\n";
 116
 117 ## Try to keep module pristine & recover from any inplace edits
 118 if(-e "./Seq.pm.bak")    { `cp ./Seq.pm.bak ./Seq.pm.dist`; `mv ./Seq.pm.bak ./Seq.pm`;  }
 119 exit(0);
 120 }
 121
 122
 123