biomart/PKGBUILD

   1 # Maintainer: Michael Schubert <mschu.dev at google mail>
   2
   3 pkgname=biomart
   4 pkgver=0.7
   5 pkgrel=1
   6 pkgdesc="BioMart is a query-oriented data management system"
   7 arch=('i686' 'x86_64')
   8 url="http://www.biomart.org/"
   9 license=('LGPL')
  10 depends=('java-runtime')
  11 source=('ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/biomart/martj_current/martj-bin.tar.gz')
  12 md5sums=('9381d0fd3a76652bfbebc60b209d9e0c')
  13
  14 build() {
  15   mkdir -p $pkgdir/opt/biomart
  16   cp -r $srcdir/martj-bin/* $pkgdir/opt/biomart/
  17
  18   mkdir -p $pkgdir/usr/bin
  19   for L in martbuilder marteditor martexplorer martregistrydbtool martrunner martshell; do
  20       ln -s /opt/biomart/bin/$L.sh $pkgdir/usr/bin/$L
  21   done
  22 }