realign talks and papers.
[CommonLispStat.git] / README
1 -*- mode: text -*-
6 (comment to save: (gensym) can make an NA entry).
8 For a fast start: 
10 You probably did:
12     git clone git://
14 or 
16     git clone git://
18 (or perhaps:
19     git clone
22 and now you should:
24     git submodules init
25     git submodules update
27 to get the whole package.  However, not all submodules are attached
28 yet!  Will need to load 
30 Make the shared library liblispstat with an ANSI C compiler (only gcc
31 tested at this point):
33        cd lib
34        make
36 run a common lisp (SBCL, CMUCL, CLISP, CLOZURE-CL) starting in the
37 current directory.  Recent versions of CFFI and LIFT can be found in
38 the external/ subdirectory, and should be autoload-able, assuming that
39 you are using a Lisp implementation supporting ASDF.  (AJR-FIXME: need
40 to upload my GIT mirrors to or similar, and have them
41 potentially available as submodules if needed)
43 (on Debian or similar systems: can use CLC (Common Lisp Controller) or
44 SBCL approaches, i.e.  ~/.clc/systems or ~/.sbcl/systems should
45 contain softlinks to the cls, cffi, and lift ASDF files
46 (i.e. cls.asd, cffi.asd, and lift.asd).  AJR-FIXME: There is
47 probably a similar incantation for other CL's, need to record that
48 here!).
50 Step through ls-demo.lisp for a range of examples of activities.
53 So basically ..   
55 1. change directory into the CommonLispStat working directory.
56 2. start your lisp
57 3. follow the commands in the ls-demo.lisp file, i.e.
59    a. (asdf:oos 'asdf:load-op 'cls) ;; use ASDF to load lispstat
60    b. (in-package :ls-user)
61    c. (normal-rand 20)
62    d. (setf mytest (normal-rand 20))
63    e. ... (and so on) ...
65    and see if they work (basic CFFI functionality for external C
66    library, LIFT package for unit-testing framework to ensure run time
67    stability).
69 4. Tell me ( ) if there is any thing wrong
70    (or if anything happens to work.
72 CMUCL and SBCL seem to work just fine at this stage.
74 CLISP is finicky regarding the problems that we have with CFFI
75 conversation.  In particular that we can not really do typing that we
76 need to take care of.   I think this is my problem, not someone
77 elses. 
79 Need to test ECL.  Clozure-CL seems to work.
81 ===========
83 See Doc/README* for history and design considerations
84 See Doc/INSTALL for getting this to work and run
86 ===========
88 Working on this with git:
90     git clone git:// 
91     cd CommonLispStat
92     git submodules init
93     git submodules update
95 will pull the whole repository, and create a "master" branch to work
96 on.  If you are making edits, Probably, you don't want to use the
97 master branch, but more to use a topic-centric branch, so you might:
99     git checkout -b myTopicBranch
101 and then work on myTopicBranch, pulling back to the master branch when
102 needed by
104     git checkout master
105     git pull . myTopicBranch
108     git rebase myTopicBranch
111 of course, perhaps you want to contribute to the mob branch.   For
112 that, after cloning the repository as above, you would:
114     git checkout -b mob remotes/origin/mob
116 (work, work, work... through a cycle of
118          <edit>
119          git add <files just edited>
120          git commit -m "what I just did"
122  ad-nauseum.  When ready to commit, then just:
124      git push git+ssh:// mob:mob
128 and it'll be put on the mob branch, as a proposal for merging.
130 Another approach would be to pull from the topic branch into the mob
131 branch before uploading.   Will work on a formal example soon.
133 (the basic principle is that instead of the edit cycle on mob, do
134 something like:
136   git checkout mob
137   git pull . myTopicBranch   
138   git push git+ssh:// mob:mob
142 Alternatively, one can work on the github repositories as well.  They
143 are a bit differently organized, and require one to get a github
144 account and work from there.  In that case, you'd need to D/L the
145 libraries. 
147 That gets a bit tricky, but see ./bin/ for an example. 
149 ===========
151 I've started putting examples of use in function documentation.   If
152 you are a lisp'er, you'll find this pendantic and insulting.  Many of
153 the uses are trivial.  However, this has been tested out on a number
154 of research statisticians (the primary user audience) and found
155 useful.
157 Still need to write the (run-doc-ex 'function-name)  function, which
158 would print out the example and run it live.  Hopefully with the same
159 results.  I've used XML markup for this, but for no particular reason,
160 we could have used SEXPs as well.   This is currently done by using an
161 <example> tag set, as in
162     <example>
163     (progn
164        (example-code-for-function))
165     </example>
167 ===========